Merge pull request #10051 from tamiko/fix_a_test_3

fe/memory_consumption_01: remove test

Merge pull request #10055 from tamiko/fix_a_test_6

rol/vector_adaptor_02: port to Trilinos 12.18.1

Merge pull request #10054 from tamiko/fix_a_test_5

serialization/fe_series_0?: Add test variants for libc++

Merge pull request #10052 from tamiko/fix_a_test_4

mpi/petsc_step-27*: add a test variant for petsc-3.13 and newer

Merge pull request #10048 from tamiko/fix_a_test_2

base/utilities_pack_unpack_07: make test more robust

Merge pull request #9990 from jppelteret/fevalues_dof_idx_rbl

fe/memory_consumption - remove test

Remove a stray memory consumption test

rol/vector_adaptor_02: port to Trilinos 12.18.1

serialization/fe_series_0?: Add test variants for libc++

The order of the coefficients stored internally in FESeries::Fourier are
not stable wrt standard library. Just add a test variant.

mpi/petsc_step-27*: add a test variant for petsc-3.13 and newer

add a comment

Merge pull request #10028 from jppelteret/sd-batch_optimiser

Merge pull request #10036 from starki0815/hp_dof_handler_tria_base

Merge pull request #10042 from bangerth/formula

Merge pull request #10034 from starki0815/hanging_node_hp_instantiations

Add codim 1 instantiations of make_hanging_node_constraints()

Update physics tests to use cell DoF range based loop

Update physics tests to use QP range based loop

Add range based loops for DoF indices to FEValuesBase

Improve wording.

Clarify what this class actually computes.

Improve the formatting of a formula in a .h file.

This doesn't change the output, just whether or not it's readable in the
source file. It isn't right now :-)

Merge pull request #10049 from nfehn/print_parameters

clarify documentation of print_parameters()

Allow hp::DoFHandler with parallel::DistributedTriangulationBase

This allows the distribution of dofs for an hp::DoFHandler combined with a triangulation class derived from parallel::DistributedTriangulationBase other than parallel::distributed::Triangulation.
This makes it possible to handle the triangulation without p4est (e.g. manual partitioning).

clarify documentation of print_parameters()

Add codim 1 instantiations of make_hanging_node_constraints()

base/utilities_pack_unpack_07: make test more robust

Merge pull request #10039 from bangerth/vector-op

Merge pull request #10044 from rezarastak/prefer_discrete_time

DiscreteTime is preferred over TimestepControl

Merge pull request #10045 from tjhei/add_missing_override

Merge pull request #10035 from starki0815/mesh_refinement_codim_1

Merge pull request #9930 from tjhei/ci_tidy_clang10

add missing override in MatrixFree LaplaceOperator

Use transfinite interpolation for codim 1 refinement

For a Triangulation<2,3>, the middle vertices are now determined by transfinite interpolation. This makes the refinement behavior of the triangulation consistent with Triangulation<3,3> (where the middle vertices during quad refinement are determined by transfinite interpolation)

Merge pull request #10041 from bangerth/ref

Move a reference to references.bib.

Merge pull request #9997 from jppelteret/mesh_loop_01

Remove MeshWorker::CopyData::operator=(double)

DiscreteTime is prefered over TimestepControl

Fix meshworker tests

Merge pull request #10030 from bangerth/tut

Add a reference to the code gallery.

Merge pull request #10038 from drwells/remove-nonascii-math

Remove some non-ascii characters.

Merge pull request #9076 from luca-heltai/particle-interpolation-sparsity-matrix

Particle interpolation sparsity matrix

Mark constructor for CopyData as explicit

Remove MeshWorker::CopyData::operator=(double)

Augment documentation of mesh_loop()

Add another test for mesh_loop

Merge pull request #10040 from drwells/more-doxygen-fixes

Fix some more doxygen issues.

Fix some more doxygen issues.

1. I now get a warning about paper sizes with doxygen 1.8.18:

warning: argument 'a4wide' for option PAPER_TYPE is not a valid enum value
Using the default: a4!

   Get around this by just using a4.

2. My LaTeX distribution already defines vcentcolon, so rename our own version
   to dealvcentcolon to preserve compatibility with older tex distributions.

3. Use mathrm instead of text to get underscores to work correctly with
   backslashes with both MathJax and LaTeX. This is the solution we use
   elsewhere in the library.

Add SD tests: Batch optimiser

Add SD tests: Common subexpression elimination

Update AD/SD module documentation

Add BatchOptimizer for symbolic expressions

Remove some non-ascii characters.

My copy of pdflatex does not like (i.e., I cannot compile the doxygen-generated
file _formulas.tex) math statements with unicode MINUS SIGN instead of the old
ASCII HYPHEN-MINUS. While here I also switched out RIGHT SINGLE QUOTATION MARK
for (also ASCII) APOSTROPHE and made a few other small changes.

We should be, in general, able to use unicode in our documentation outside of
math mode so I didn't change those usages unless they seemed gramatically
incorrect to me (like using the right quotation mark instead of an apostrophe).

Fixed review comments.

Apply suggestions from code review

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Add a changelog file.

Update tests and test outputs.

Implement operator<<(ostream,Vector) in a better way.

Merge pull request #9391 from peterrum/pft_settings

Refactor settings of p:f:t

Merge pull request #9847 from peterrum/nonconti_update_ghost_values

Rename NoncontiguousPartitioner::update_values()

Merge pull request #9998 from bangerth/discrete-time

Minor updates to the DiscreteTime class documentation.

Merge pull request #10032 from masterleinad/suppres_more_tbb

Suppress more TBB warnings

disable performance-no-automatic-move

nolint std::bind

archive log file

CI: update clang-tidy to clang10

Suppress more TBB warnings

Introduce MeshSmoothing in TriangulationDescription::Description

Merge pull request #10031 from tcclevenger/step-63-format

Small formatting error

sect4 -> sect3

Rename NoncontiguousPartitioner::uptate_values()

Merge pull request #9991 from dougshidong/create_evenly_distributed_partitioning

Add Utilities::MPI::create_evenly_distributed_partitioning()

Merge pull request #10029 from masterleinad/fix_c++20_

Fix C++20 warnings and errors

Add a reference to the code gallery.

deal.II recently acquired a parallel N-S solver.

Avoid deprecated implicit this capture

Avoid volatile assignment in TBB

Avoid allocator::pointer removed in C++20 in Boost

Remove some debug output in DictionarySubstitutionVisitor

Add dictionary (normal + CSE) visitors for SymEngine

Improve serialization of SD Expressions

Add more utilities to convert from SymEngine types

Remove implicit cast from SymmetricTensor

Increase required SymEngine version to 0.6

Add U::MPI::create_evenly_distributed_partitioning

Rename test output file of mpi_create_partitioning

As per
https://github.com/dealii/dealii/pull/9991#discussion_r418361364

Pass arg by value in create_ascending_partitioning

As per
https://github.com/dealii/dealii/pull/9991#issuecomment-622199929.

Merge pull request #10026 from masterleinad/avoid_complex_fabs

Avoid using fabs for std::complex

Merge pull request #10024 from masterleinad/fix_clang_warnings

Fix some clang-10 warnings

Avoid using fabs for std::complex

Merge pull request #10025 from kronbichler/extend_mf_laplace_coefficient

Simplify logfile setup in some tests

Changelog

Test case

Implement cell-wise variable coefficient in MF::LaplaceOperator

Merge pull request #10022 from tamiko/fix_a_test_1

Test: adjust iteration count in ginkgo test

Merge pull request #10020 from bangerth/include

Remove an unnecessary include file.

Merge pull request #10019 from bangerth/fix-test

Fix a test by using the stream output precision.

Fix warning about copying in range-based for loop

Fix warning about default constructors and default assignment operators

Silence conversion warning in bundled UMFPACK

Test: adjust iteration count in ginkgo test