Initialize patch index properly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21779 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add correct output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21778 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21777 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor rewording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21773 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need to list new tests -- they aren't user visible anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21772 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert apparently accidental part of commit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21771 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ensure output correctness on our usual test system.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21770 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add output directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21769 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21763 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21762 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify test case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21761 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug introduced in r21754.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21760 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reverted previous ARPACK patch it does not help it is not relevant for now

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21759 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed to MGConstrainedDoFs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21758 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement 'keep_constrained_entries' part in add_entries_local_to_global for non-quadratic matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21754 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure BLAS and LAPACK are there if we want to link in ARPACK

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21753 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21752 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make code compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21751 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup reinit functions. Remove some unnecessary code, make the code scale.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21750 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21749 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for DataOutReader::merge. Currently failing. Why does the -1 change to 0 in
the second patch?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21748 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Type check aclocal

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21747 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

put the right results to generic

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21746 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test for Newton's method

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21745 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21744 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21743 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a DEAL_II_USE_ARPACK to config.h.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21742 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21741 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Workaround by Wolfgang to get PetscScalar is complex working, plus release VECTOR_FUNCTIONS back to petsc complex

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21740 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Parallelization of FETools::compute_embedding_matrices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21739 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21738 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21737 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21736 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed the MGConstraints to MGConstrainedDoFs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21735 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change the MGConstraints to MGConstrainedDoFs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21734 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rename the MGConstraints to MGConstrainedDofs and change the call in the
transfer accordingly

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

use the MGConstrainedDoFs object in the transfer

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed the call of the constructor in MGTransferPrebuilt due to changes
in the library

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

slightly different output now

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21730 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert previous PETSc patch which is legal with clanguage C plus plus

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21729 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a warning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make better use of the arpack architecture macro

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21727 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Tests for the parent relation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21726 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

set precision to avoid roundoff trouble

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21725 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

set precision to 6 to avoid roundoff trouble

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21724 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Actually bind ARPACK into lib/liblac

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect ARPACK and ARPACK architecture

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21722 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Parent relation for cells.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21721 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21719 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test function n_intervals, get_view and fill_index_vector in IndexSet.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21717 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure SparseDirectMUMPS shows up in the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug introduced in r21708

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21715 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix columns in distribute_local_to_global with rectangular matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21714 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

pass a MGConstraints instead of the boundary_indices only in
build_matrices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed the interface of MGConstraints. Made the member variables
private and wrote functions to acess them. Changes made in step-16
accordingly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add member functions. Document.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a lot of assertions. Add instantiations for block sparsity patterns.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed the make_fluy_sparsity_pattern in  way that it can handle a
ConstraintMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new instantiation for make_flux_sparsity_pattern using a ConstraintMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo in comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add function add_entries_local_to_global for rectangular matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21704 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Indent, make compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21703 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rephrased an operation that turns out to be illegal for PETSc scalar-complex

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21702 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

now without emacs signs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21701 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new function make_flux_sparsity_pattern that uses a ConstraintMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new function make_flux_sparsity_pattern that uses a ConstraintMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Have a section on defensive programming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add Baerbel, very much deservedly so!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Pulled out the creation of FEValues objects from the main loop in VectorTools::project_boundary_values_curl_conforming. Further we fixed some bugs and made some code simplifications in this function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More on what Tobias Leicht provided.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention MUMPS interface.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor mods.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start reformatting and add print function to GlobalRowsFromLocal

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cross-link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write some more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend significantly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Can't use latex markup for non-ASCII letters in doxygen comments. One
would have to use the direction HTML markup for that.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove trailing whitespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Terminate one formula. Properly indent in a few places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reorder initialization of fields to avoid compiler error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace stupid integer product by the more reasonable test that both are nonzero
this allows us to use copy_from with sparsity patterns of size 65536

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove declaration of nonexisting function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

an if added for face integrals

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

default constructor for DoFHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove compiler warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some unused parameters to avoid warnings.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark a number of objects as const if they are only set once. This
helps read code since it makes it clear that there will be no further
modifications further down below.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use dynamic_cast to find out whether a finite element is of type
FE_Nedelec. This is more reliable since it also captures the case of
an element that may be derived from FE_Nedelec.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move the declaration of temporaries that are left uninitialized at the
top of the function to further down where they are actually used; if
possible, initialize at the place of declaration and then mark them as
constant.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more case of using arrays for static data.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When defining abbreviations for non-scalar data, use references,
i.e. use
      const std::vector<Tensor<2, dim> > &
jacobians = fe_values.get_jacobians ();
instead of
      std::vector<Tensor<2, dim> >
        jacobians = fe_values.get_jacobians ();

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put stuff that's known into lookup tables rather than initializing
things dynamically, i.e. do

  const unsigned int data[6] = { .... };
  ...
  do_something(data[face]);

rather than

  unsigned int data;
  switch (face) {
    case 0: data = ...; break;
    case 1: data = ...; break;
    case 2: data = ...; break;
    ...
  }
  do_something(data);

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@21657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d