Merge pull request #5748 from masterleinad/inline_geometry_info

Inline GeometryInfo members

Inline GeometryInfo

Merge pull request #5735 from Rombur/cmake_cusparse

Add cuSPARSE support in the build system

Merge pull request #5737 from Rombur/cuda_warning

Fix warnings: do not use Assert in CUDA kernel

Merge pull request #5736 from Rombur/cuh

Change .cuh extension to h

Merge pull request #5740 from masterleinad/internal_alignedvector_const

Make parameters and variables for the internal::AlignedVector classes const

Merge pull request #5749 from bangerth/doc-update

Update documentation of *::Vector::add_and_dot for complex vectors.

Merge pull request #5745 from masterleinad/initialize_constexpr_arrays

Initialize constexpr arrays in GeometryInfo

Wrap comments.

Update documentation of *::Vector::add_and_dot for complex vectors.

Merge pull request #5744 from masterleinad/fix_coverity

Fix issues reported by Coverity

Initialize constexpr arrays in GeometryInfo

Fix issues reported by Coverity

Merge pull request #5743 from bangerth/doc-update

Clarify documentation of (hp::)?DoFHandler::distribute_dofs().

Clarify documentation of (hp::)?DoFHandler::distribute_dofs().

Make parameters and variables for the internal::AlignedVector classes const

Merge pull request #5731 from masterleinad/fix_rt_bubbles_tests

Increase precision in FE_RT_Bubbles tests

Merge pull request #5733 from niveshd/ExtendTestFE_Enriched

Minor change in FE Enriched element

Merge pull request #5738 from bangerth/doc-update

Fix a grammar error.

Fix a grammar error.

Fix warnings: do not use Assert in CUDA kernel

Change .cuh extension to .h

Blacklist header files containing CUDA code from all-headers tests

Header files that contain CUDA codes cannot be passed to the host compiler.
Thus, we blacklist them in all-headers tests.

Increase precision in FE_RT_Bubbles tests and filter small values out

Add cuSPARSE support in the build system

Merge pull request #5690 from tamiko/fix_mpi_check

CMake: remove mpi two-pass search

Bug fix in FE_Enriched element. Avoid evaluating quadrature points if no dofs are assigned

Merge pull request #5719 from bangerth/doc-update

Update some comments around renumbering DoFs.

Merge pull request #5730 from masterleinad/clang-tidy-new__3

Make some variables const (references)

Merge pull request #5729 from masterleinad/clang-tidy-new_2

Use nullptr instead of 0 or NULL

Make some variables const (references)

Merge pull request #5704 from BenBrands/extend_scalapack

 add template wrappers for ScaLAPACK functions

Use nullptr

Merge pull request #5722 from eldarkh/add-fe-rt-bubbles

New Finite Element RT+Bubbles (PR #4540 part II)

CMake: make the MPI compatibility check less strict

When configuring with CMake 3.10 and providing compiler wrappers,
  CC=mpicc CXX=mpicxx cmake ...
the new FindMPI.cmake library does not export MPI_CXX_LIBRARIES and
MPI_C_LIBRARIES any more. So, make the check less strict.

CMake: Support a FindMPI.cmake of CMake version 3.10 and later

This change should also be backward compatible to older CMake versions.
(Fingers crossed.)

add changes entry

CMake: Disable MPI autodetection

CMake: remove mpi two-pass search

As discussed in https://github.com/dealii/dealii/issues/5510, we must
not assume anything about the internal workings of CMake's FindMPI.cmake
module. In particular, it is not sufficient to set CMAKE_<LANG>_COMPILER
to an MPI-compiler wrapper in order for FindMPI.cmake to actually detect
MPI. So, remove this logic in our FindMPI.cmake module.

Merge pull request #5726 from bangerth/automatic-memory

Use automatic memory management, rather than doing it by hand.

Merge pull request #5717 from masterleinad/copy_distribute_dofs

Make sure distribute_dofs doesn't copy unnecessarily

New Finite Element, RT-Bubbles

Use automatic memory management, rather than doing it by hand.

Merge pull request #5725 from bangerth/doc-update-2

Fix a formula that trips up doxygen.

Fix a formula that trips up doxygen.

Merge pull request #5721 from bangerth/add-test

Add another test.

Merge pull request #5724 from bartniday/patch-1

Fix grammar in parameter description

Fix grammar in parameter description

Merge pull request #5720 from luca-heltai/bug-mapping

Fix bug in MappingFEField.

Merge pull request #5723 from bangerth/fix-grammar

Use complete grammar.

Use complete grammar.

Add another test.

Make sure distribute_dofs doesn't copy unnecessarily

Removed smart pointer to dh.get_fe()

Update some comments around renumbering DoFs.

Merge pull request #5658 from luca-heltai/simplex-quad

Simplex quadratures and their utilities.

Merge pull request #5709 from eldarkh/add-poly-rt-bubbles

New polynomial space RT+Bubbles (PR #4540 part I)

New polynomial space RT+Bubbles, final changes

Merge pull request #5712 from masterleinad/precice_p4est

Make the instructions for the p4est installation script more precise

Make the instructions for the p4est installation script more precise

Merge pull request #5710 from masterleinad/simplify_normal_spherical_2

Update documentation by using Manifold instead of Boundary

Merge pull request #5713 from vishalkenchan/suppress_zoltan_phg_warnings

suppress PHG warning saying: PHG_EDGE_SIZE_THRESHOLD is low

updating copy-right headers

add ScaLAPACKMAtrix::copy_to(ScaLAPACKMatrix &dest)

do not free MPI_COMM_NULL communicator in ProcessGrid

add template wrappers for ScaLAPACK functions and introduce support for float

suppress PHG warning saying: PHG_EDGE_SIZE_THRESHOLD is low

Fixed Denis' comments.

Improve documentation

Merge pull request #5708 from davydden/bugfix/fix_zoltan

fix Zoltan debug output

fix Zoltan debug output

Merge pull request #5696 from bangerth/fix-hierarchical-2

Fix hierarchical renumbering

Merge pull request #5695 from masterleinad/dummy_cylindrical_manifold

Dummy implementation for CylindricalManifold for spacedim!=3

Fixed documentation and WB's comments.

Merge pull request #5655 from Jie-Cheng/petsc_mmult

Add PETScWrappers::MatrixBase::mmult

Update documentation.

Add a changelog entry.

Add a test.

Ensure that DoFRenumbering::hierarchical() is independent of the previous DoF indices.

Merge pull request #5705 from marcfehling/step-26_positivity_preservation

Extended step-26 documentation with regard to positivity preservation.

Minor edits to the positivity-preserving section of step-25

Merge pull request #5706 from masterleinad/update_bits_cone_03

Update output of bits/cone_03

Dummy implementation for CylindricalManifold for spacedim!=3

Update output of bits/cone_03

Extended step-26 documentation with regard to positivity preservation.

Merge pull request #5682 from masterleinad/replace_cylinder_boundary

Replace CylinderBoundary by CylindricalManifold in tests

Merge pull request #5703 from masterleinad/replace_hypershell

 Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Merge pull request #5698 from masterleinad/rebase_opencascade_boundaries

Rebase Opencascade Boundary classes

Merge pull request #5697 from masterleinad/replace_cone_boundary

 Replace ConeBoundary by CylindricalManifold

Merge pull request #5700 from Rombur/cuda_assert

Make AssertCuda use Assert instead of AssertThrow

Merge pull request #5702 from vishalkenchan/bug_fix/rol_vector_adaptor

ROL: bug fix applyBinary function in Rol::VectorAdaptor

Merge pull request #5701 from masterleinad/fix_tests_5691

Fix failing tests after #5691

Merge pull request #5699 from Rombur/pedantic

Do not use pedantic when cuda support is enabled

Use SphericalManifold in mpi/p4est_2d_constraintmatrix_03

Simplify mpi/p4est_2d_constraintmatrix_03

Do not use pedantic when cuda support is enabled

nvcc generates code that produces a lot of warnings when pedantic is used.
Since the code is generated by nvcc there is nothing we can do about it except
not using pedantic.

Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Merge pull request #5684 from masterleinad/replace_boundary

Replace StraightBoundary by FlatManifold in tests

bug fix applyBinary function in Rol::VectorAdaptor

Changelog entry