Adds platform AlmaLinux as replacement for CentOS 8

Fix an undefined variable error.

version 9.3.1-r2

merge from master

version 9.3.1-r1

switch to deal.II 9.3.1

version 9.3.0-r3

only set MPI_CXX_COMPILER if requested

Setting the compiler wrapper in CMake instead of in CC and CXX is
recommended, but only works for recent CMake versions (one configuration
I tested requires CMake 3.20 for the intel compiler).
With 9.3.1 deal.II supports setting CXX=mpicxx again, so only do the
above when a setting in candi.cfg is specified.
Works around #202
and fixes feature introduced in #159

switch to deal.II release branch instead of v9.3.0

version 9.3.0-r2

Add package symengine

Replace option --PROCS by --jobs

Add ginkgo package

Update superlu_dist package

Update trilinos confopts according to reported issue

Update trilinos package

disable CXX/CC for deal.II itself

As described in the comment, it is not ideal to set CXX/CC.

version 9.3.0-r1

change deal.II version to 9.3

Update checksum verification (#187)

* Update checksum verification

* Minor corrections

Merge pull request #189 from gfcas/remove_stable_build_option

Remove STABLE_BUILD option

Correctly checkout the desired version for git repositories

Remove STABLE_BUILD option

Merge pull request #183 from gfcas/deal_ii_confopts

Rename to DEAL_II_CONFOPTS

Rename to DEAL_II_CONFOPTS

Add option to run tests after installation (#179)

* Add option to run tests after installation

* Change default value to OFF

Merge pull request #180 from gfcas/readme

Update readme

Merge pull request #182 from gfcas/instant_clean_option

Add instant clean up option

Unification ON|OFF (#176)

* Option CLEAN_BUILD

* Option native optimizations

* Option build examples

* Option stable build

* Update comments

Add GSL 2.6 (#178)

* Add GSL

* Add to package list in cfg file

* Remove multiple newlines

* Fix typo

* Update from koecher

Add instant clean up option

Merge pull request #175 from gfcas/update_cmake

Update cmake to version 3.16.3

Update readme

Update cmake to version 3.16.3

Merge pull request #173 from gfcas/dealii_examples_option

Option whether to build dealii examples

Merge pull request #172 from gfcas/update_arpack

Update to latest arpack version 3.8.0

Option whether to build dealii examples

Update to latest arpack version 3.8.0

Merge pull request #150 from tjhei/trilinos_mkl

fix trilinos tpetra when using intel MKL

Merge pull request #170 from gfcas/skip_prompts

Add option to skip prompts

Short documentation of skip option

Add option to skip prompts

Merge pull request #145 from tjhei/remove_nanoflann

remove nanoflann

Merge pull request #166 from tjhei/netcdf

add netcdf

Merge pull request #164 from koecher/guess-platform

Guess platform

Merge pull request #165 from tjhei/muparser

add muparser as separate package

add netcdf 4.7.4

add muparser as separate package

guess_platform: use major version for debian as well

removes opensuse unsupported platform files

guess_platform: find major os version

adds fedora29 platform file

candi.sh: new guess_platform: removes dependency from lsb_release

Merge pull request #158 from tjhei/ci_linux_blas

CI: add ubuntu 20.04 with openblas, rename and restructure OSX

Merge pull request #153 from tjhei/hdf5-1.10.7

hdf5: bump to 1.10.7

Merge pull request #161 from tjhei/openblas_fixes

openblas: update to 0.3.13 and fix OSX

Merge pull request #162 from tjhei/python3

handle python3 correctly

handle python3 correctly

If "python" does not exist in the environment, we set PYTHONVER to the
empty string, which makes configuration fail. Fix this.

Merge pull request #160 from tjhei/centos_cmake

take over #154 and #157 (centos cmake) to master branch

hdf5: bump to 1.10.7

fix openblas on OSX

update openblas to 0.3.13

I am getting compile errors with the old version on ubuntu 20.04:
getarch_2nd.c:12:35: error: ‘SGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’ undeclared (first
use in this function); did you mean ‘XGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’?

An update fixes this.

Addresses issue #155 old CentOS compilers

Addresses issue #154 CentOS cmake is too old

Merge pull request #152 from tjhei/ci_lapack

CI: fix OSX tester

debug build

use older cmake

output detailed.log

CI: add ubuntu 20.04 with openblas, rename and restructure OSX

CI: fix OSX build

- force cmake 3.18 as 9.2 does not support 3.19 (default in the VM)
- change the minimal build to use MPI as well (without it, blas is not
found for some reason). There is no good reason to test candi builds
without MPI.

Merge pull request #148 from rezarastak/remove_threads

remove WITH_THREADS

fix trilinos tpetra when using intel MKL

The choice to disable TPetra when using MKL lead to several downstream
Trilinos configuration errors. Instead, just disable the two
instantiations that are missing in MKL. Tested to work correctly with
Intel 19.0.5 and MKL.

remove WITH_THREADS

Merge pull request #146 from rezarastak/deprecate_old_ubuntu

deprecate unsupported ubuntu platforms

Merge pull request #147 from rezarastak/required_ubuntu_packages

bc and python must be available on ubuntu

bc and python must be available on ubuntu

deprecate unsupported ubuntu platforms

remove nanoflann

nanoflann is deprecated in deal.II and removed in 9.3.0-pre

Merge pull request #144 from tjhei/master-9.2.0

switch master branch to v9.2.0

switch master branch to v9.2.0

Merge pull request #141 from tjhei/petsc_slepc_update

Petsc/slepc update

Merge pull request #137 from tjhei/adolc-v2.7.2

update adol-c to 2.7.2

Merge pull request #136 from tjhei/arch_manjaro

basic working version for arch/manjaro

Merge pull request #140 from tjhei/ubuntu2004

support ubuntu 20.04

update slepc/petsc version to 3.13.x

This is required as our old version only supports Python 2.x, which is
end-of-life now.

support ubuntu 20.04

bump version number on master branch

update adol-c to 2.7.2

Merge pull request #138 from tjhei/ci_checkoutv2

CI: switch to checkout v2

CI: switch to checkout v2

this might fix occasional reference is not a tree errors.

basic working version for arch/manjaro

Merge pull request #134 from tjhei/test_petsc_on_osx

add github action to include petsc on OSX

add github action to include petsc on OSX

Merge pull request #132 from tjhei/tjhei-osx-ci

simple continuous integration using github actions

use github actions for CI

use github actions for some simple build tests:
- ubuntu 18: MPI, gcc, p4est and deal.II
- OSX minimal: clang, serial, just deal.II
- OSX parallel: gcc9, MPI, p4est and deal.II

Merge pull request #131 from tjhei/osx-support

OSX 10.14 and 10.15 support

OSX 10.14 and 10.15 support

- add platform detection
- update homebrew instructions

Merge pull request #128 from tjhei/osx-update

OSX  doc update

Merge pull request #92 from tjhei/update_trilinos_12_12

update trilinos

Merge pull request #129 from tjhei/openblas_update

update openblas to 0.3.7