Merge pull request #4645 from bangerth/constraint-matrix-copy

Implement a ConstraintMatrix::copy_from() function.

Merge pull request #4648 from drwells/add-p4est-zlib-check

Fail to install p4est if it is not compiled with zlib.

Fail to install p4est if it is not compiled with zlib.

Merge pull request #4649 from simonsticko/disable_warning_immersed_surface_quad

Remove a compiler warning in ImmersedSurfaceQuadrature.

Remove a compiler warning in ImmersedSurfaceQuadrature.

Merge pull request #4632 from luca-heltai/pattern-tools

PatternsTools namespace.

Merge pull request #4305 from simonsticko/immersed_surface_quadrature

Add class ImmersedSurfaceQuadrature

Merge pull request #4646 from drwells/add-default-prm-note

Add a note on generating default parameter files.

Merge pull request #4647 from bangerth/doc-update

Minor doc updates to a couple of classes.

Add a note on generating default parameter files.

A since-removed equivalent to parse_input (see commit 8baf33d316b) took,
as an optional argument argument, a boolean that specified whether or
not parse_input should write a default parameter file if one is not
found. This commit summarizes that old documentation for users who want
the old behavior.

Moved changelog to major.

Specialise Bool pattern.

Fixed naming of is_stl_container and is_stl_map

change log

Added add_parameter function and tests.

Moved pattern_tools.h inside patterns.h

Moved Patterns namespace in its own file.

Support for std::pair

Renamed files to pattern_tools

Fixed support for arbitrary map types.

Renamed namespace, fixed cxx14 dep, fixed stylistic comments.

Added tests for several Convert<T> types.

Add Convert for string types.

Added convert for std::complex types.

Added tensor and point types.

Moved some functions to internal namespaces.

Removed patterns_tools.cc and refactored  add_parameter

Made all stl containers and map available.

Specialization of Convert for Map types.

Added getters to Patterns::Map

Patterns for arithmetic types and container types.

Added Convert struct, with its specialisation for integral types

Added getters for Patterns::List

Minor doc updates to a couple of classes.

Merge pull request #4644 from bangerth/doc-update

Better document the extract_subvector_to() functions.

Explicitly =delete ConstraintMatrix::operator=().

Currently, it was just made 'private' and not implemented.

Add a changelog entry.

Add a test.

Implement a ConstraintMatrix::copy_from() function.

Better document the extract_subvector_to() functions.

This commit deals with the variant of the function that takes iterators.

Better document the extract_subvector_to() functions.

This commit deals with the variant of the function that takes vectors.

Merge pull request #4628 from gassmoeller/allow_zero_dim_output

Allow zero dimensional output in DataOutBase

Add instantiations

Merge pull request #4640 from kronbichler/fix_mg_ghost_periodic

Fix ghost layer with multigrid hierarchy for distributed triangulation

Merge pull request #4636 from bangerth/dofhandler-update

More Dofhandler updates

Instantiate output for zero dim.

Address a couple of review comments.

Standardize on 'template <class DoFHandlerType>'.

Merge pull request #4641 from bangerth/make-var-const

Make a couple of variables 'const'.

Make a couple of variables 'const'.

Add changelog.

Add new test

Fix bug in MG ghost layer computation leading to dead locks.

Merge pull request #4637 from bangerth/fix-serialization

Fix serialization of DoFHandler.

Add class ImmersedSurfaceQuadrature

Add a class representing an quadrature rule over a surface cutting arbitrary
through the unit cell. In order to map a quadrature rule over a surface from
the unit cell to physical space it is not sufficient to know only points and
scalar weights, since information about the normal is also required. In
addition to points and weights this class also stores the normal vectors.

Merge pull request #4634 from bangerth/simplify-code

Simplify a small piece of code.

Merge pull request #4631 from bangerth/delete-copy-operators

Mark copy operators as explicitly deleted.

Merge pull request #4635 from bangerth/simplify-test

Remove an unnecessary cast.

Compress buffers before communicating.

This has already been done in distribute_dofs(). Also do it in renumber_dofs().

Substantially simplify the creation of the NumberCache.

This uses a recently introduced constructor of NumberCache.

Make two blocks of code the same.

One part of the renumber_dofs() algorithm in parallel is exactly the
same as in the distribute_dofs() algorithm, so use the same code in
both places.

Simplify the implementation of an algorithm slightly.

Also make it cheaper: We really only need to loop over ghost cells,
but not locally owned cells.

Rename a variable.

Simplify an algorithm.

We were trying hard to construct an IndexSet efficiently, but IndexSet
can now do that itself provided we give it a sorted set of indices.

More DoFHandler policy cleanups.

Specifically, make function names more uniform. Also some control
flow cleanups, and other minor improvements.

Instantiate the ParallelDistributed policy for hp::DoFHandler.

Fix serialization of DoFHandler.

Some gcc/boost combinations have trouble re-creating vectors of
std::unique_ptr objects because the latter has no copy constructor.
Work around this by doing things one element at a time.

Mark copy operators as explicitly deleted.

The operator=() of all accessor classes had previously been hidden
by making them private and not implementing them. C++11 now allows
us to bring them out of the dark and into the light by making
them public, but marking them as '=delete'.

Remove an unnecessary cast.

Simplify a small piece of code.

Merge pull request #4633 from tjhei/doc_loop_control

improve LoopControl documentation

improve LoopControl documentation

Merge pull request #4630 from masterleinad/replace_deprecated_table_indices_constructor

Replace calls to deprecated TableIndices constructor

Replace calls to deprecated TableIndices constructor

Merge pull request #4629 from masterleinad/fix_construct_chebyshev

Use appropriate constructor for QGaussChebyshev*

Use appropriate constructor for QGaussChebyshev*

Merge pull request #4624 from bangerth/dofhandler-update

DoFHandler policy update

Simplify an assertion.

More small cleanups.

Most documentation changes, renaming of variables, and general housekeeping.

Let a function return its product, rather than use a reference argument.

This is the same patch as the previous commit, except for the multilevel
version of the function: p::d::Triangulation::fill_level_vertices_with_ghost_neighbors().

Let a function return its product, rather than use a reference argument.

While there, also make the function 'const', which requires a bit of surgery in a variety
of places where we did not accurately propagate constness.

More random cleanups.

Merge pull request #4626 from drwells/add-time-dependent-iterator-check

Add an extra iterator validation check.

Add an extra iterator validation check.

Coverity complains about this, so we may as well add an extra check for
iterator correctness.

Rename a couple of variables.

Merge pull request #4620 from bangerth/avoid-raw-pointers

Avoid raw pointers. Use std::unique_ptr instead.

Merge pull request #4622 from bangerth/simplify-pointer-class

Use a clearer initialization syntax.

Merge pull request #4623 from bangerth/add-changelog

Add a changelog entry for hp::DoFHandler vs. p::s::Triangulation.

Minor doc update.

Fix a bug: Also catch the hp case in testing a policy pointer.

Provide the ParallelDistributed policy with a DoFHandler template argument.

Add a changelog entry for hp::DoFHandler vs p::s::Triangulation.

Use a clearer initialization syntax.

Specifically, we used the syntax
  Type object = initializer;
in contexts where the initializer is of a different type and the
compiler automatically converted this into
  Type object(initializer);
where the constructor called was just a regular constructor
that did something with the initializer, but specifically did not
copy the object. This is confusing. Use the latter syntax instead.

Merge pull request #4621 from bangerth/doc-update

Fix a minor spelling problem in a heading.

Fix a minor spelling problem in a heading.

Avoid raw pointers. Use std::unique_ptr instead.

This patch changes SparsityPattern and classes that use it.

Merge pull request #4619 from jppelteret/change_tutorial_cmake_msg_4600

Update CMake error message in tutorials.

Tutorial CMake error message now displays configured options.

Merge pull request #4617 from bangerth/fix-error-messages

Replace message-less exceptions with ones that say what's happening.

Update CMake error message in tutorials.

This removes any ambiguity in the outputted message previously caused by
double negation.

Fixes #4600

Replace message-less exceptions with ones that say what's happening.