Remove boundary fix

We compute the boundary normal by averaging the normal over the
quadrature points weighted with the shape function. It turns out that
this is sufficient to preserve mass and total energy. No change of the
c_ij's are needed.

Merge pull request #10856 from Rombur/cuda_cmake_18

Fix warnings when using cmake 3.18

Merge pull request #10875 from agrayver/python_wrappers

Add an incompatibility note and optional args

Update tutotial program

Add changelog item

Add python wrappers

Merge pull request #10858 from gassmoeller/add_copy_from_particle_handler

Add copy from particle handler

Merge pull request #10913 from tjhei/doc_sparsity_it

SparsityPattern: improve documentation

SparsityPattern: improve documentation

My students rightfully complained, that it is very difficult to find
begin() (hidden in the base class) and the accessor functions (hidden
behind using).

Merge pull request #10910 from peterrum/categorize_by_boundary_ids_pbc

Fix categorize_by_boundary_ids for PBC

Fix categorize_by_boundary_ids for PBC

Merge pull request #10907 from Rombur/grid_in

Add a constructor to GridIn and extend read(std::string)

Merge pull request #10901 from kronbichler/fe_evaluation_mapping_part

Split out mapping-related part from FEEvaluationBase into base class

Split out mapping-related part from FEEvaluationBase into base class

Merge pull request #10906 from Rombur/tensor_product_warnings

Fix warning: declaration of dim hides template parameter when using CUDA

Merge pull request #10905 from zjiaqi2018/step12-builds-on

remove builds-on 39->12

Merge pull request #10908 from tjhei/doc_cell_neighbor_index

improve documentation and arg naming of cell neighbor*()

Merge pull request #10904 from kronbichler/remove_ncomponents_template

FEEvaluationFaceImpl: Remove n_components template argument

FEEvaluationFaceImpl: Remove n_components template argument

improve documentation and arg naming of cell neighbor*()

My students rightfully got confused about the documentation and the
confusing argument name i. Try to fix things.

Fix warning: declaration of dim hides template parameter when using CUDA

Add read_assimp inside GridIn<dim,spacedim>::read(std::string)

Add constructor to GridIn that directly attaches the Triangulation

remove builds-on 39->12

Add changelog entry

Add ParticleHandler::copy_from function.

Fix warnings when using cmake 3.18

Merge pull request #10896 from peterrum/apply_face

EvaluatorTensorProduct::apply_face for higher dimensions

EvaluatorTensorProduct::apply_face for higher dimensions

Merge pull request #10895 from peterrum/mf_array

Replace C-style arrays in MatrixFree

Replace C-style arrays in MatrixFree

Merge pull request #10892 from bangerth/lambda

Use lambdas to make code more readable.

Merge pull request #10893 from bangerth/parens

Use parentheses to make code easier to read.

Use parentheses to make code easier to read.

Use lambdas to make code more readable.

Merge pull request #10871 from peterrum/categorize_accoring_boundary_ids_for_ecl

Add MatrixFreeTools::categorize_by_boundary_ids

Merge pull request #10891 from peterrum/FEFaceNormalEvaluationImpl_dimension_independent

Make FEFaceNormalEvaluationImpl dimension independent

Merge pull request #10890 from peterrum/mf_categorization_assert_message

Improve assert message

Make FEFaceNormalEvaluationImpl dimension independent

Merge pull request #10889 from peterrum/enable_bv_for_gahter_evaluate_follow_up

Remove VectorType from FEFaceEvaluationSelector

Improve assert message

Add MatrixFreeTools::categorize_accoring_boundary_ids_for_ecl

Merge pull request #10869 from peterrum/do_backward_hessians

Add FEEvaluationImplBasisChange::do_backward_hessians

Merge pull request #10870 from peterrum/quadrature_data_on_face

Work on interpolation from cell to face quadrature points

Remove VectorType from FEFaceEvaluationSelector

Merge pull request #10888 from elauksap/simplex_clang-format

Properly sort #include <deal.II/simplex/*.h>

Merge pull request #10883 from kronbichler/fix_extract_dofs

Speed up DoFTools::extract_dofs

Change

Work on interpolation from cell to face quadrature points

Properly format #include <deal.II/simplex/*.h>

Merge pull request #10865 from peterrum/enable_bv_for_gahter_evaluate

Enable BlockVector for FEEvaluation::gather_evalute()

Speed up DoFTools::extract_dofs

Enabel BlockVector for FEEvaluation::gather_evalute()

Merge pull request #10880 from bangerth/doc

Improve documentation of a rather basic function.

Merge pull request #10876 from kronbichler/improve_tensor_3x3_invert

Reorder computations in inversion of 3x3 tensor

Merge pull request #10879 from drwells/memory-space-virtual-dtor

Use a virtual destructor with virtual methods.

Improve documentation of a rather basic function.

Use a virtual destructor with virtual methods.

Merge pull request #10878 from peterrum/small_docu_fixes

Small fixes in the documentation of L:d:V

Small fixes in the documentatio of L:d:V

Merge pull request #10877 from peterrum/docu_fix

Fix statement in documentation

Fix statement in documentation

Reorder computations in inversion of 3x3 tensor

Merge pull request #10852 from elauksap/simplex_hdf5

Support to HDF5 export of data on simplex meshes

Merge pull request #10835 from peterrum/pick_up_test_arg

Optional argument for DEAL_II_PICKUP_TESTS

Merge pull request #10873 from peterrum/memory_space

Make MemorySpaceData virtual

Merge pull request #10874 from tamiko/cleanup

CMake: Remove DEAL_II_CXX_VERSION_FLAG

Make MemorySpaceData virtual

CMake: Remove DEAL_II_CXX_VERSION_FLAG

This variable is no longer populated. Remove all occurences.

Optional argument for DEAL_II_PICKUP_TESTS

Merge pull request #10860 from drwells/remove-deletes

Wrap some more calls to delete with unique_ptr.

Merge pull request #10843 from peterrum/mapping_fe_assert

Add assert to MappingFE

Support to HDF5 export of data on simplex meshes

Merge pull request #10834 from peterrum/test_suite_json

Run test suite also for json files

Add FEEvaluationImplBasisChange::do_backward_hessians

Run test suite also for json files

Add assert to MappingFE

Merge pull request #10866 from bangerth/simplify

Simplify a piece of code.

Merge pull request #10867 from bangerth/follow-up

Minor clean-ups.

Merge pull request #10868 from bangerth/follow-up-2

Minor fixes.

Minor fixes.

Minor clean-ups.

Simplify a piece of code.

Merge pull request #10864 from drwells/simplex-gridout-1

Get GridOut::write_eps working with triangles.

Merge pull request #10786 from tjhei/jenkins_faster_0g

jenkins: use Og on tester

Merge pull request #10863 from luca-heltai/python-bindings-docker-image

Enable python bindings in the docker image.

try O1

work around warning in bundled boost

/jenkins/workspace/dealii_PR-10786/bundled/boost-1.70.0/include/boost/archive/iterators/istream_iterator.hpp:84:44:
error:
‘<anonymous>.boost::archive::iterators::istream_iterator<char>::m_current_value’
may be used uninitialized in this function [-Werror=maybe-uninitialized]

jenkins: use Og on tester

Try to see if tests run faster when using Og instead of O0.

Merge pull request #10861 from bangerth/variable

Attempt to work around a compiler warning.

Get GridOut::write_eps working with triangles.

There are some additional fixes in here that are necessary for VTU but that is
not yet finished.

Wrap some more calls to delete with unique_ptr.

Enable python bindings.

Attempt to work around a compiler warning.

Merge pull request #10853 from drwells/poly-contiguous-arrays

Use contiguous arrays for some polynomial classes.

Merge pull request #10855 from drwells/fix-bbox-warnings

Fix some warnings in BoundingBox.

Merge pull request #10845 from gassmoeller/unify_particle_property_pool_initialization

Do not forget to set the property pool of a particle 2

Merge pull request #10857 from Rombur/cuda_warnings

Fix warnings when compiling with CUDA

Use std::array in BoundingBox::get_neighbor_type().

The std::vectors are of fixed length so we might as well.