Fix a bug in cuda matrix-free.

Merge pull request #4742 from luca-heltai/add-number-to-extractors

FEValuesViews::get_function_values_from_local_dof_values

Merge pull request #4793 from bangerth/fix-2

Avoid warning in 64-bit mode.

Merge pull request #4792 from bangerth/fix

Use correct data type also in 64-bit mode.

Avoid warning in 64-bit mode.

#4778 also forgot to fix an initializer. This patch fixes this.

Merge pull request #4790 from bangerth/fix-include-guard

Fix #include guard name.

Use correct data type also in 64-bit mode.

Fix #include guard name.

Added changelog entry

Add tests for FEValuesViews::get_function_*_from_local_dof_values

Added Tensor::get_function_divergences_from_local_dof_values

Added Tensor::get_function_values_from_local_dof_values

Added SymmetricTensor::get_function_divergences_from_local_dof_values

Added SymmetricTensor::get_function_values_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_third_derivatives_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_laplacians_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_hessians_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_curls_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_divergences_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_symmetric_gradients_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_gradients_from_local_dof_values

Added Vector::get_function_values_from_local_dof_values

Added Scalar::get_function_third_derivatives_from_local_dof_values

Added Scalar::get_function_laplacians_from_local_dof_values

Added Scalar::get_function_hessians_from_local_dof_values

Added Scalar::get_function_gradients_from_local_dof_values

Added Scalar::get_function_values_from_local_dof_values

Merge pull request #4784 from tamiko/fix_tests

lac/(consraints_c1_02|schur_complement): Modernize tests

run astyle

lac/schur_complement_03: Replace std::flush by std::endl

lac/constraints_c1_02: Modernize test

lac/schur_complement_03: Modernize test

Merge pull request #4778 from bangerth/active-fe-index-4

Fix a data type

Merge pull request #4782 from tamiko/fix_a_test_7

base/anisotropic_1: Update forgotten test output

Use the appropriate data type for hp::DoFHandler::vertex_dof_offsets.

The array stores offsets into another array -- using 'unsigned int' is enough,
we don't need to use 'types::global_dof_index' for this.

While there, also rename the variable to get singular/plural right.

Merge pull request #4780 from tamiko/test_cleanup

tests: remove unnecessary includes

Merge pull request #4773 from bangerth/active-fe-index-2

Be careful for which cells and objects we allocate hp DoF indices.

base/anisotropic_1: Update forgotten test output

Merge pull request #4776 from drwells/remove-std-isnan-check

Remove checks for various isnan functions.

tests: Fix up a couple of tests that didn't take the last commit lightly

tests: remove unnecessary includes

Merge pull request #4779 from tjhei/trilinos_include_and_warnings

trilinos as system includes, guard warnings

trilinos as system includes, guard warnings

Merge pull request #4762 from masterleinad/nullptr_coeffs

Allow the create_* functions to be called with nullptr coefficients

Merge pull request #4777 from drwells/fill-in-invalid-iterator

Add additional functions to InvalidAccessor.

Add additional functions to InvalidAccessor.

This was originally written by Luca Heltai and is necessary for the
patch removing the Boundary classes.

Merge pull request #4774 from masterleinad/fix_warning_geometryinfo

Fix clang warning in grid/grid_in.cc

Use a clearer way to empty arrays.

Test for inequality instead.

Remove checks for various isnan functions.

This PR removes

DEAL_II_HAVE_ISNAN
DEAL_II_HAVE_STD_ISNAN
DEAL_II_HAVE_UNDERSCORE_ISNAN

in favor of using std::isnan, which is a C++11 function, instead.

Merge pull request #4761 from tamiko/do_not_set_precision

DataOutBase: Do not modify precision of ostream

Merge pull request #4760 from tamiko/fix_a_test_6

base/anisotropic_?: make tests more robust

Fix clang warning in grid/grid_in.cc

Be careful for which cells and objects we enumerate DoFs.

Be careful for which cells and objects we allocate hp DoF indices.

The patch itself is actually pretty small -- we just have to occasionally exclude cells
when we loop over them, specifically of they are artificial. The patch, however, is
far larger because we replicated the same code for cells, faces, and vertices for
the 1d, 2d, and 3d implementations. I didn't feel like making the same changes
3 times over, so I refactored these things into functions that deal with cells,
faces, and vertices. This makes the overall patch rather large.

Update tests in numerics/

Update tests in hp/ and lac/

Update tests in bits/

Update tests in base/

add a changes entry

DataOutBase: Do not modify precision of ostream

Merge pull request #4766 from masterleinad/disable_project_q_hierarchical

Disable project_q_hierarchical_03

Disable project_q_hierarchical_03

Merge pull request #4765 from tamiko/silence_a_warning

Disable two gcc 7.1.0 diagnostics for external includes

Merge pull request #4740 from tamiko/constrained_linear_operator

constrained_linear_operator: use ConstraintMatrix iterators

update comment

Merge pull request #4764 from drwells/remove-unused-string

Remove an unused std::string.

Disable -Wint-in-bool-context for external includes

Remove an unused std::string.

Disable -Wimplicit-fallthrough for external includes

Allow the create_* functions to be called with nullptr coefficients

Merge pull request #4709 from jppelteret/material_boundary_id_4672

Change the number type of material_id and boundary_id

Merge pull request #4763 from kronbichler/delete_unnecessary_changelog

Remove unnecessary changelog.

Remove unnecessary changelog.

Merge pull request #4759 from tjhei/tensorized_mappingq

fix bug in tensorized MappingQGeneric

base/anisotropic_2: increase output precision

base/anisotropic_1: increase output precision

base/anisotropic_1: compare floating point numbers with tolerance

fix bug in tensorized MappingQGeneric

logical fix for #4664

Merge pull request #4756 from tjhei/remove_compute_level_verts

remove p::d::Triangulation::compute_level_vertices_with_ghost_neighbo…

Update test output

Fix tests (compilation issues; remove unnecessary casts)

Fix instantiation

Change the number type of material_id and boundary_id

Merge pull request #4758 from tamiko/remove_a_test_2

Bugfix: Actually delete the right test...

Bugfix: Actually delete the right test...

Merge pull request #4757 from tamiko/remove_a_test

opencascade/(arclength_boundary_01|plane_intersection_01): remove tests

opencascade/(arclength_boundary_01|plane_intersection_01): remove tests

Remove two failing tests that hit a bug in opencascade libraries
(versions 6.7.0 - 7.1.0) related to closed, periodic curves. We test the
same functionality already in other opencascade tests, so nothing is
lost.

remove p::d::Triangulation::compute_level_vertices_with_ghost_neighbors()

- never used/tested because GMG uses a different strategy to communicate DoFs

fixes #4627

Merge pull request #4755 from tamiko/fix_a_test_5

mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: Add an output variant

mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: Add an output variant

Another test that gives different results due to metis.

Merge pull request #4749 from bangerth/simplify-meshworker

Reduce MeshWorker complexity by removing an undocumented preprocessor #define.

Merge pull request #4752 from tamiko/add_missing_instantiations

ShapeInfo<...>::reinit: add missing instantiations

restructure

add a changelog entry

add missing instantiations

Merge pull request #4751 from tamiko/fix_a_test_4

add an output variant

add an output variant

The number CG iterations changed slightly. At some point we will have to
rewrite this test...

Merge pull request #4750 from tamiko/fix_a_test_3

trilinos/solver_control_06: Add output variants

trilinos/solver_control_06: Add output variants

Newer trilinios print the warning string (that we sometimes get and that
is already present in the original .output files) without a leading ~/.

Thus add another output variant.