Fix a missing std::, as pointed out by Benjamin Kirk (benkirk@cfdlab.ae.utexas.edu)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4905 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check pivot size relative to other matrix entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4904 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add optional options to matrix output class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

BlockMatrix now has function el()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some commented-out functions. Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4901 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Let file conform to coding standards.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4900 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new class MatrixOut and corresponding testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4899 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove an assertion for corner cases, which is not strictly necessary
and was rather thought as an aid in finding programming errors. After
discussion it was thought that it is more difficult to maintain it
than to remove it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4898 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4897 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a class that provides algorithms working on triangulations. New test case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4896 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

spawn wrappers for member functions with 7 args.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4895 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Well, revert patch as does not help...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add path to Sun F77 libs to linker line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Previously, the preconditioners using matrices, derived privately from
PreconditionRelaxation, but introduced the only function of the base
class later on explicitely into the public area. Since private
inheritance interferes with the use of the Subscriptor class in the
base class (we can't cast to it any more), change the inheritance to
public and remove the explicit "using" declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment about a case where we had a TODO previously.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive solvers publicly from Solver, and remove derivation from Subscriptor since the base class already inherits it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reinsert an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4889 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

It was decided that FEValues should no longer support support_points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Why should we want to merge them?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The good reason to have the classes distinct is probably that we want
to have the == operator in the base class not compare all the
complicated and long fields, but just the simple ones.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive Solver and Preconditioners from Subscriptor. Let PreconditionLACSolver use SmartPointers instead of C style pointers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Think about using global std::vector objects in the value_list
function, in order to avoid repeated memory allocation for these
objects. However, no way springs to mind as apparent, basically
because the length of these vectors depends on the number of points at
which the derivative is to be computed, which may vary between
successive calls to the function and we don't want to grow the vectors
beyond all bounds if once many points are required and usually only a
few.

Nevertheless, clean up some things...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the template argument from the MatrixTools and MatrixCreator classes. This also requires to make the IteratorRange arguments to the threaded functions be passed by value rather than by reference since they are generated as a temporary now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4882 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4881 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check the requirements on vectors and matrices in the linear solvers. Minor clean-ups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4880 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

operator*= for vector and block vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4879 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement operator*= for vectors and block vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix leading underscores as nobody else seems to have an interest in doing it...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some assertions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add precondition_Jacobi to FullMatrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4875 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Just reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4874 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve the ConstraintMatrix::merge function for the case that objects are already sorted. Write a test for this function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4873 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide BlockVector with a new constructor that initializes the vector from an iterator range.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New constructor for Vector<...> that takes two iterators the range of which is then copied.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4871 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Has finally appeared.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4870 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the kludge that the QProjector happened to become a real class derived from Quadrature. Rather, make the respective constructor call two functions in their own that return a Quadrature object.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4869 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

density of Naca flow. M=2. alpha=5 degree.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4868 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include naca picture. Set size of picture to 100, explicitly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4867 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4866 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

ConstraintMatrix::merge

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4865 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend ConstraintMatrix::merge.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4864 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4863 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add colorized column indicating how many test cases failed today.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4862 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check reduced residual for equality as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4861 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify computation of laplace vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4860 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add target libo as in the base subdir.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4859 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use of appropriate quadrature rule for MappingQ4 leads to small change in output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4858 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4857 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4856 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4855 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4854 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FourierSineSum and FourierCosineSum

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4853 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO more explicit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4852 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

obsolete TODO removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4851 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Wrap all instances of conceret functions into a namespace of their own.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4850 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FourierSine and FourierCosineFunction

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4849 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Assembling of the laplace matrix is performed using a quadrature that now depends on the degree of mapping employed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4848 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4847 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include additional assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use relative error rather than absolute error for checking for an internal error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4845 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for rand_r/rand

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4844 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing include. Dont know why this was not found before... :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4843 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

bug fixed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4842 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some TODOs. Add memory_consumption functions in several places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4841 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix use of private typedef by using the original type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4840 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive all PreconditionBlock* class virtually from Subscriptor. This allows also PreconditionBlockSSOR to be derived from Subscriptor. Use of virtual derivation to avoid ambiguity.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing typename.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4838 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4837 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a missing std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4836 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect some things for Sun's WorkShop compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4835 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4834 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4833 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4832 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix xref

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4831 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Recognize cxx.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4830 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix date.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4829 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Recognize cxx.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4828 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document OSF1 5.3 and cxx 6.3.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4827 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some issues with cxx.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4826 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Save vmult in CG if starting vector is zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4825 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix </class> by </code>

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4824 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Save one vmult in the common case that the input vector to the CG method is zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4823 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new pic.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4822 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

postscript face output in 3d: not tested

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4821 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The script is now a mess, but it generates much nicer output!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4820 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include regression tests into navbar.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4819 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some more issues about flags for the cxx compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4818 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add constructors to classes, where C++ requires us to do so.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4817 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix issues with Compaq's cxx compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4816 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Exclude one function from compilation in other dimensions than the one it is used in. Mark another function inline to avoid link time errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4815 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explicitely instantiate forgotten class FEValuesData.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4814 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

eps surface plots in 3d

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4813 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Purge inline functions from .cc files if they should be visible globally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4812 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Declare explicit specializations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4811 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include some dof accessor functions unconditionally where they were only included in optimized mode previously. This is necessary since we can't otherwise mark them inline because they might be instantiated internally only then, and would not be accessible from files that have no access to the .templates.h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4810 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't have inline functions in source files, as they are not instantiated externally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4809 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix many missing std:: which Compaq's cxx wants to have, mostly for two reasons: 1. because it does not inject the math functions sqrt, sin, cos, fabs, ... into global namespace when we write include<cmath>. 2. because cxx can't do Koenig lookup of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4808 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

We may not be allowed to initialize Null-references directly, but we can initialize them by dereferencing Null pointers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4807 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix many missing std:: which Compaq's cxx wants to have, mostly for two reasons: 1. because it does not inject the math functions sqrt, sin, cos, fabs, ... into global namespace when we write include<cmath>. 2. because cxx can't do Koenig lookup of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4806 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d