Merge pull request #3950 from dealii/revert-3914-fix_tests_3

Revert "Tests: output variants for opencascade 6.9.1"

Revert "Tests: output variants for opencascade 6.9.1"

Merge pull request #3914 from tamiko/fix_tests_3

Tests: output variants for opencascade 6.9.1

Merge pull request #3946 from davydden/tests/fe_enriched_step_36

use jacobi preconditioner in fe_enriched test eigenproblems

Merge pull request #3940 from davydden/tests/parallel_block_vector_03

add extra output for parallel_block_vector_03

Merge pull request #3949 from masterleinad/reduce_fe_abf_02

Simplify fe/abf_02

Simplify fe/abf_02

tests: use jacobi preconditioner in fe_enriched test eigenproblems

Merge pull request #3945 from drwells/clang-warnings

Fix some simple clang warnings.

Remove some unused variables.

This was caught by clang 3.9.

Check if a preprocessor variable is defined before use.

Clang complains about this with -Wundef on.

Merge pull request #3936 from davydden/tests/memory_consumption_01

tests: extra output for memory_consumption_01

Merge pull request #3938 from davydden/tests/oce_step_create_write

extra output for OCE 0.18

Merge pull request #3943 from davydden/tests/no_flux_constraints_extra

extra output for no_flux_constraints when md5sum is not installed

Merge pull request #3941 from davydden/tests/fix_slepc_solve_04

fix slepc/solve_04

tests: extra output for no_flux_constraints when md5sum is not installed

tests: fix slepc/solve_04

Merge pull request #3937 from davydden/tests/metis_extra_output

extra output for METIS tests

tests: add extra output for parallel_blocK_vector_03

tests: extra output for OCE 0.18

tests: extra output for METIS tests

tests: extra output for memory_consumption_01

Merge pull request #3934 from tjhei/warn_unref

remove unused variable names

remove unused variable names

MSVC complains about this...

Merge pull request #3928 from masterleinad/fix_filtered_iterator

Fix Initialization of FilteredIterator from base class

Add test for copying FilteredOperator

Merge pull request #3918 from koecher/deprecate_supports_distributed_data_static_member

deprecates static support_distributed_data member of vector declarations

adds DEAL_II_DEPRECATED to PREDEFINED of doc/doxygen/options.dox.in

Merge pull request #3930 from tjhei/intel_inline_warning

remove intel warning about always_inline

Merge pull request #3850 from bangerth/add-abf-test

Add a test for the ABF element in 3d.

remove intel warning about always_inline

disable the following incorrect warning:
```
include/deal.II/base/tensor.h(824): warning #3415: the "always_inline"
attribute is ignored on non-inline functions
inline DEAL_II_ALWAYS_INLINE
```

Fix Initialization of FilteredIterator from base class

Merge pull request #3925 from masterleinad/update_fe_project_test

Update fe/fe_project_2d

Update fe/fe_project_2d

Merge pull request #3903 from tjhei/rework_instantiations

cleanup template-arguments.in

Merge pull request #3924 from drwells/boost-serialization-macro-warning

Avoid using 'defined' inside a macro.

deprecates static support_distributed_data member of vector declarations

Avoid using 'define' inside a macro.

This is technically illegal and clang rightfully complains.

Patch from https://github.com/boostorg/serialization/pull/49

fix expand-instantiations

- remove trailing newlines in pattern values
- skip spaces and newlines before first pattern
- report errors if pattern is not found

Merge pull request #3923 from tjhei/undo_static_assert

Revert #3861 "add new macro for static asserts"

Merge pull request #3891 from tjhei/step-57-fixes

update step-57

Merge pull request #3916 from tamiko/do_not_use_as_needed_in_check

CMake: Disable -Wl,--as-needed in DEAL_II_HAVE_USABLE_FLAGS

CMake: Disable -Wl,--as-needed in DEAL_II_HAVE_USABLE_FLAGS

This works around a serious regression with ld.bfd in combination with
-Wl,--as-needed when compiling a simple

  int main () { return 0; }

and linking against a *huge* list of (entirely unused) libraries.

See #3686

Tests: output variants for opencascade 6.9.1

Revert "add new macro for static asserts"

This reverts commit c9283e795004308c570f356da95f97562f62d112.

Merge pull request #3919 from masterleinad/fix_get_fe_by_name_01

Adjust tolerance for FE_ABF

Adjust tolerance for FE_ABF

Merge pull request #3907 from masterleinad/simplify_back_interpolate

Unify FETools::back_interpolate

Merge pull request #3921 from davydden/spherical_component

Functions::Spherical add component argument to svalue/sgradient/shessian

Merge pull request #3920 from davydden/workstream_hp

WorkStream: add a note on hp-FEM

Merge pull request #3910 from tamiko/fix_tests_1

Tests: Provide output variant

WorkStream: add a note on hp-FEM

Functions::Spherical add component argument to svalue/sgradient/shessian

Merge pull request #3912 from tamiko/fix_tests_2

Tests: Do not run to example steps in tests

Simplify FETools::back_interpolate

Merge pull request #3917 from masterleinad/rm_output_file_name

Remove output_file_name variable from tests

Get rid off output_file_name in tests

Tests: Do not run (only build) step-48 in build_tests

Tests: Do not run (only build) step-23 in build_tests

Tests: One more output variant for newer p4est

Tests: Provide output variant

p4est after 1.1 outputs slightly different vtk files:

      </PPoints>
        <PDataArray type="Int32" Name="treeid" format="ascii"/>
      </PCellData>
-     <PPointData>
-     </PPointData>
      <Piece Source="1_0000.vtu"/>
    </PUnstructuredGrid>
  </VTKFile>

Simply provide output alternatives that don't have this empty section.

Merge pull request #3890 from dealii/fix_PR_1783_02

Refactor identity_operator and null_operator for non-trivial payloads

Merge pull request #3901 from masterleinad/restrict_c++11

Fix tests for non-c++11 build

Merge pull request #3909 from drwells/remove-timer-fit-from-test

Remove a check on a timer slope.

Remove a check on a timer slope.

This commit gets rid of the part of a test that tried to check the
computational complexity of distributing DoFs by fitting a least squares
curve to timing data. This frequently failed and it is not really
needed: the test will time out if we ever go back to a quadratic time
algorithm.

Restrict tests requiring C++11

Merge pull request #3904 from tjhei/fix_typos

fix minor typos

Merge pull request #3905 from davydden/doc_updates_tests

more descriptive commands on how to setup tests for an already instal…

Merge pull request #3906 from tjhei/assert_warning_compare_int

fix >=0 comparison warning

fix >=0 comparison warning

gcc 4.8 complained:
```
/ssd/deal-git/source/fe/mapping_q_generic.cc:2800:11: warning: comparison of unsigned expression >= 0 is always true [-Wtype-limits]
```

fix minor typos

update template-arguments.in

- document template-arguments.in
- delete DERIVATIVE_TENSORS FEVALUES_BASES DOFHANDLERS (now unused)
- update instantiations

update file location

remove only usage of DOFHANDLERS in .inst.in

Merge pull request #3902 from tjhei/boost_no_unordered_double_def

Fix BOOST_NO_CXX11_HDR_UNORDERED_MAP warning

more descriptive commands on how to setup tests for an already installed library

Fix BOOST_NO_CXX11_HDR_UNORDERED_MAP warning

When forcing CXX11 to off, I get the following warning with gcc <4.8:
```
/ssd/deal-git/bundled/boost-1.62.0/include/boost/config/stdlib/libstdcpp3.hpp:182:0: warning: "BOOST_NO_CXX11_HDR_UNORDERED_MAP" redefined
```
This change fixes this.

Merge pull request #3894 from kronbichler/fix_constraints_merge

Fix constraints merge

Merge pull request #3895 from tamiko/fix_warnings

CMake: Also ignore -Wignored-attributes for external includes

CMake: Also ignore -Wmisleading-indentation for external includes

CMake: Also ignore -Wignored-attributes for external includes

New test

Fix merge of constraint matrices where lines cache exceeds local lines

Update method used to nullify Epetra_MultiVectors

update step-57

- always assemble rhs when assembling matrix (so we get correct boundary
values from the ConstraintMatrix)
- this fixes having 0 iterations in the first Newton iteration
- restructure assemble* functions to make this more clear
- reorder some comments
- redo results section (neater tables)

Re-add reinit functions to null_operator

Refactor identity_operator and null_operator for non-trivial payloads

When performing compound operations with LinearOperators, it is
necessary for the Payload type of all operations to be the same.
identity_operator did not take in a operator, so we used to define a
variant of it in the TrilinosWrappers namespace in order to set up the
underlying Payload. This lead to some compiler confusion as it could not
deduce which version of the function to call unless the namespace was
used to explicitly remove this ambiguity.

We've now removed the second identity_operator in TrilinosWrappers, and
have instead defined an alternative identity_operator that takes in an
exemplar LinearOperator. This version of the function will automatically
extract the range of operations from the exemplar, deduce the Payload
type AND initialise it correctly (this would not have been done
correctly before). This required the introduction of the inverse_payload
function to the Payload classes.

In anticipation of similar problems with null_operator, this
LinearOperator is also slightly refactored as to ensure that the payload
is correctly configured. This required the introduction of the
null_payload function to the Payload classes.

Fixes #3846

Merge pull request #3889 from bangerth/fix-old-tbbs

Work around a problem when using very old TBB versions.

Work around a problem when using very old TBB versions.

Merge pull request #3885 from masterleinad/fix_get_fe_by_name_01

Fix get_fe_by_name_01

Merge pull request #3884 from masterleinad/fix_mw_assembler

Fix use of AnyData in MeshWorker::Assembler

Merge pull request #3888 from bangerth/fix-more-changelog-entries

Fix more changelog entries.

Fix more changelog entries.

Merge pull request #3887 from bangerth/fix-changelog-entry

Fix the markup of a changelog entry.

Fix the markup of a changelog entry.

Merge pull request #3882 from drwells/header-fixes

Header fixes

Merge pull request #3879 from davydden/empty_payload_fix

fix duplicate symbols for EmptyPayload

Fix get_fe_by_name_01

Fix use of AnyData in MeshWorker::Assembler

Merge pull request #3880 from kalj/remove-unsed-arg-warning

remove warnings about unused arguments