Merge pull request #12034 from juleoc02/step-79

Step 79: A topology optimization problem

Merge pull request #12246 from mathsen/gcc_11

Fix compilation issues with GCC 11.1

Merge pull request #12273 from drwells/step-78-edits

Step 78 edits

Merge pull request #12278 from jppelteret/symengine-fix_10016

Fix SymEngine tests for SymEngine version 0.7 and greater

Merge pull request #12281 from peterrum/tests_with_simplex_support

Remove remaining .with_simplex_support=on from tests

Merge pull request #12277 from masterleinad/fix_inline

Fix functions that should be inline in *.templates.h files

Remove remaining .with_simplex_support=on from tests

Merge pull request #12279 from peterrum/tria_policy_copy

Clone policy in Triangulation

Fix SymEngine tests

Clone policy in Triangulation

Merge pull request #12276 from marcfehling/clang-tidy

Fix clang-tidy issues with #12246.

Fix functions that should be inline in *.templates.h files

Merge pull request #12261 from bangerth/initlog-2

Use C++11 functionality.

Merge pull request #12262 from bangerth/initlog-3

Pass 'true' instead of '1' for a function that takes a 'bool' argument.

Merge pull request #12272 from luca-heltai/fix-ida

Fixed naming in IDA.

fix indentation

Fix clang-tidy issues with #12246.

fixec preprocessor directive

add preprocessor directive to restrict changes to GCC >= 11 and Intel compilers

step-79: a topology optimization problem.

Merge pull request #12035 from tyand96/step-78

Step 78

step-78: clarify that we have an IMEX method.

step-78: Update results.

step-78: Avoid doing another timestep at the end.

We should finish at 1, not 1 + dt.

step-78: Avoid using singular first-person pronouns.

This change makes this tutorial more in line with the common style of the others.

step-78: Make output a lot quieter.

We don't want to print thousands of lines.

step-78: Fix some minor typos.

Fixed naming in IDA.

Merge pull request #12266 from bangerth/ida

Minor updates to the SUNDIALS/IDA wrappers.

Merge pull request #12254 from luca-heltai/fix-kinsol

Fix kinsol

Merge pull request #12269 from bangerth/aligned-3

Remove a destructor now no longer necessary.

Addressed comments by WB.

Merge pull request #12260 from bangerth/initlog

Mark a function argument as 'const'.

Remove a destructor now no longer necessary.

Leave the declaration in place but =default it, so that we continue to implement
the rule of 7.

Merge pull request #12185 from bangerth/aligned

AlignedVector: Move element destructors into the 'deleter' object.

Merge pull request #12268 from jppelteret/changelogs_01

Add three changelog entries for new tutorials.

added copy and move constructors / assignment operators to fix compilation issues with gcc 11.1

Add three changelog entries for new tutorials.

Minor updates to the SUNDIALS/IDA wrappers.

Mark a function argument as 'const'.

Merge pull request #12258 from gfcas/step_66_update

Step 66 minor doc update

Merge pull request #12264 from mathsen/preparation_gcc_11

small changes which resulted in problems when merging a GCC 11 fix

Add a test.

Add a test.

Move element destructors into the 'deleter' object.

small changes which resulted in problems when merging a GCC 11 fix

Merge pull request #12259 from bangerth/35

Link to new image files in step-35

Pass 'true' instead of '1' for a function that takes a 'bool' argument.

Use C++11 functionality.

Link to new image files.

Doc entry.

Fix Kinsol interface.

Intro add note on reuse mg_transfer

Indent intro code snippets

Fix solution figure size

Merge pull request #12256 from drwells/fix-gcc11-compilation

Fix compilation with GCC11 and minimal dependencies.

Merge pull request #12257 from bangerth/35

Fix width of pictures.

Fix width of pictures.

Merge pull request #12255 from drwells/gcc11-nedelec-warnings

Fix some GCC11 warnings.

Fix compilation with GCC11 and minimal dependencies.

step-78: Black-Scholes Problem.

Fix some GCC11 warnings.

Merge pull request #12250 from peterrum/particles_lost

Fix ParticleHandler::sort_particles_into_subdomains_and_cells() for lost particles

Merge pull request #12253 from gfcas/add_changelog_step_66

Add changelog entry for step-66

Merge pull request #12251 from kronbichler/fix_warning_array_bounds

MappingQGeneric: Fix warning about array bounds

Add changelog entry

Merge pull request #12249 from peterrum/vector_tools_include

Include file in vector_tools.h

MappingQGeneric: Fix warning about array bounds

Fix ParticleHandler::sort_particles_into_subdomains_and_cells() for lost particles

Include file in vector_tools.h

Merge pull request #12245 from peterrum/fpe_mf

 Move FEPointEvaluation from fe to matrix_free

Merge pull request #12234 from masterleinad/fix_particles

Add assert for ParticleHandler when particles to be inserted are not found

Merge pull request #12239 from tamiko/pr_12201

Merge step-66 - rebased and squashed development branch

Move FEPointEvaluation from fe to matrix_free

Merge pull request #12236 from kronbichler/refactor_fe_point_evaluation

Refactor FEPointEvaluation

Merge pull request #12199 from peterrum/ca_requesting_processes

Allow to enforce unique mapping in RemotePointEvaluation

reindent code

step-66: Implement entire step-66

step-66: a nonlinear, parallel matrix-free example [WIP]

I am working with Fabian Castelli on a nonlinear, parallel, matrix-free
tutorial. Because this is the second time my chosen tutorial number was
taken, I would like to reserve it with this PR.

Merge pull request #12243 from brynbarker/step35

logged step 35 update

Refactor FEPointEvaluation

Merge pull request #12238 from drwells/typos-9.3

Typos 9.3

Merge pull request #12242 from peterrum/fpe_log

FEPointEvaluation: add change-log entry

Merge pull request #12233 from kronbichler/optimize_fe_point_evaluation_integrate

Optimize FEPointEvaluation::integrate() with tensor product path

Merge pull request #12240 from tamiko/remove_entries

remove placeholder changes entries

FEPointEvaluation: add change-log entry

logged step 35 update

Disable particle tests for codimension 1

remove placeholder changes entries

Merge pull request #12221 from kronbichler/fix_fe_field_function

Add assert to compute_point_locations_try_all

Run codespell

Fix double-word typos

Remove second-order Nedelec and Raviart-Thomas elements

FEFieldFunction: Detect case when some points were not found

Allow to enforce unique mapping in RemotePointEvaluation

Code optimization: Switch some loop bounds in hot loops to int

Merge pull request #12211 from peterrum/reinit_polynomial_transfer_diff

Accept differently partioned Triangulations in MGTwoLevelTransfer::reinit_polynomial_transfer()

Optimize FEPointEvaluation::integrate() with tensor product path

Merge pull request #12235 from peterrum/fpe_zero

FEPointEvaluation::integrate(): zero out solution array also if no points given