Merge pull request #5048 from tjhei/fix_mesh_loop_test

fix tests/meshworker/step-11-mesh_loop

Merge pull request #5005 from tamiko/fe_nedelec_bug

Fix FE_Nedelec::convert_generalized_support_point_values_to_dof_values (kind of)

fix tests/meshworker/step-11-mesh_loop

Merge pull request #5032 from drwells/timer-rename-variables-2

Clean up some variable names in the Timer class.

Add an interpolation test for FE_Nedelec

Fix FE_Nedelec::convert_generalized_..._to_dof_values

Merge pull request #5046 from tamiko/refactor_fe_tools

Refactor template definitions into fe_tools_templates.h header

Refactor template definitions into fe_tools_templates.h header

Merge pull request #5025 from drwells/update-timer-examples

Update the explanations of Timer in the tutorials.

Merge pull request #5040 from davydden/vector_tool_lambdas_docu

fix VectorTools::project lambdas examples to use references

Merge pull request #5041 from koecher/doxygen-typo-QGaussChebyshev

doxygen typos of sqrt in quadrature documentation

moved the doxygen section encapsulation to include missing quadratures

doxygen typos of sqrt in quadrature documentation

fix VectorTools::project lambdas examples to use references

Merge pull request #5036 from LucasCampos/correct_div

Add missing div on note on step-44

Merge pull request #5038 from tjhei/step-10-warnings

fix warnings in step-10

grammar

add underscores to filenames

fix warnings in step-10

The clang code model in qtcreator was showing me these warnings. While
here, remove weird '0'+integer hack.

Merge pull request #5033 from jppelteret/quick_tests

Add a quick test for Adol-C.

Merge pull request #5031 from tjhei/mesh_loop_cells_last

mesh_loop: replace cells_first by cells_after_faces

Add missing div on note on step-44

Merge pull request #5030 from drwells/iota-argument-type

Use the right types for iota and accumulate.

Merge pull request #5034 from bangerth/fix-formatting

Fix formatting of a piece of example code.

Fix formatting of a piece of example code.

Merge pull request #5015 from tjhei/readwritevector_view1

New ReadWriteVector::reinit(TrilinosWrappers::MPI::Vector)

Fix the nanoflann quick-test.

Add a quick test for Adol-C.

Merge pull request #4997 from bangerth/data-postprocessor-tensor

Add DataPostprocessorTensor

Clean up some variable names in the Timer class.

This is compatible with 8.5 but not with some previous patches to this class
made since then.

fix test output

mesh_loop: replace cells_first by cells_after_faces

Use the right types for iota and accumulate.

Merge pull request #5029 from bangerth/fix-test

Fix test.

Fix a test.

Merge pull request #5022 from drwells/timer-clear-mpi-data

Clean up initialization of MinMaxAvg values.

New ReadWriteVector::reinit(TrilinosWrappers::MPI::Vector)

Let a ReadWriteVector be a view for a (potentially ghosted)
TrilinosWrappers::MPI::Vector. This is the first step towards using RWV
inside the library.

Use automatic tensor unrolling instead of doing it by hand.

Also mention the possibility of computing stresses.

Merge pull request #5024 from drwells/require-boost-1.59

Require boost 1.59

Merge pull request #5014 from tjhei/parallel_vec_print

ReadWriteVector and TrilinosWrappers::MPI::Vector print in parallel

Merge pull request #5028 from luca-heltai/quick-tests

Nanoflann quicktest.

Added quicktest for nanoflann.

Fixed gls and lapack tests on mac.

Merge pull request #4996 from eldarkh/hp-RTNodal-FENothing

Support for RTNodal and FENothing in hp::FECollection

make 64bit compatible

Merge pull request #5023 from davydden/lapack_support

minor cleanup of LAPACKSupport

Merge pull request #4998 from tjhei/epetra_to_rwr

do not allow import from ghosted TrilinosWrappers to ReadWriteVector

Update the explanations of Timer in the tutorials.

add a changelog

Use boost's small_vector in a few places.

This class allows us to simplify some logic where we previously switched
between stack-allocated built-in arrays and std::vectors; now we can
just use the object's internal buffer in most cases, but if
dofs_per_cell or indices.size() is large enough we will allocate a big
enough buffer.

Require boost 1.59 or newer.

This enables us to use the relatively new boost::container::small_vector
class.

minor cleanup of LAPACKSupport

Merge pull request #5016 from davydden/mpi_summ_full_matrix

add Utilities::MPI::sum() for FullMatrix objects

Clean up initialization of MinMaxAvg values.

Merge pull request #4987 from bangerth/fix-naming-issues

Convert more places to VectorMemory::Pointer.

add a test with complex<double>

add Utilities::MPI::sum() for FullMatrix objects

update test output

ReadWriteVector and TrilinosWrappers::MPI::Vector print in parallel

Print index and value for ::print() of ReadWriteVector and
TrilinosWrappers::MPI::Vector.

Merge pull request #5013 from masterleinad/reorthogonalization_signal_gmres

Introduce SolverGMRES::connect_re_orthogonalization_slot

Changelog entry

Update tests

Add a slot for notification about re-orthogonalization in SolverGMRES

Catch ReadWriteVector::import errors from Trilinos

- check return value of Epetra import
- document that ghosted vectors are not allowed
- add test for that
- cleanup

Merge pull request #4999 from tamiko/fix_support_point_to_dof_values

Fix FESystem::convert_generalized_support_point_values_to_dof_values

New test.

Add a changelog entry.

Add DataPostprocessorTensor along with documentation.

Merge pull request #5010 from tamiko/revert_test

Revert "Relax lac/gmres_reorthogonalize_01"

Revert "Relax lac/gmres_reorthogonalize_01"

This reverts commit b9cff2610fe93494eebef7c775fd0667b743ecf7.

add a test

Avoid memory reallocation

Doc: update news items

Tests: Update fe/interpolate_system

Well, now one has to use generalized support points ;-)

Fix FESystem::convert_generalized_support_point_values_to_dof_values

Use generalized_support_points_index_table to correctly convert
generalized support point values to dof values.

Unify index name with later code, base_el -> base

Renamed convert_gen_sup_val_to_nodal_val to ..._dof_values

Merge pull request #5000 from bangerth/patch-0

Specialize DataOutBase::Patch for dim==0.

Merge pull request #5008 from masterleinad/relax_gmres_reorthogonalize

Relax lac/gmres_reorthogonalize_01

Merge pull request #5007 from masterleinad/clear_threadlocalstorage

Clear data in ThreadLocalStorage also when not using threads

Relax lac/gmres_reorthogonalize_01

Clear data in ThreadLocalStorage also when not using threads

Merge pull request #5006 from masterleinad/fix_clang_tests

Fix two tests failing for clang

Explicitly specify template arguments in fe/fe_system_generalized_support_points

clang alternative output for lac/vector_memory

Specialize DataOutBase::Patch for dim==0.

For dim==1, we output only points, and in this case we can avoid
allocating a fair share of the memory that we use in the
general case.

In reference to #4695.

Merge pull request #5004 from masterleinad/clean_thread_management

Clean up thread_management.h

Merge pull request #5003 from bangerth/patch-update

Updates to DataOutBase::Patch.

Changelog entry

Remove unused fun_ptr_helper

Remove unused fun_encapsulator

Generalize new_task and new_thread using variadic templates

Correct the implementation of DataOutBase::Patch::memory_consumption.

Update the documentation of DataOutBase::Patch.

Merge pull request #5002 from tamiko/fix_test_output

Update test output for changes in get_general_support_points()

Update test output for changes in get_general_support_points()

hp for RTNodal and FENothing

Merge pull request #4993 from tamiko/representative_system

Populate get_generalized_support_points in FE Systems

add a test

Add an assert