new UpdateFlags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15304 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Let real_to_standard_face_vertex (and its inverse, standard_to_real_face_vertex) return something useful also in 2D. To this end, remove an unneccessary TODO, and introduce two new Asserts.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the 'template' keyword when access the template member function of a template.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15302 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace assertion by a TODO. real_to_standard_face_vertex needs to care about face_orientation in 2d?!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15301 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it compile

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix function name

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15299 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the remaining bug by making sure we loop over the correct number of elements... ts ts ts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15298 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the missing assertion in DataOutReader::merge ensuring that the two sources for merging have the same vector declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the ability to output vector fields in VTK and other formats. Currently, only VTK makes use of this information, but other formats may in the future. Since we now have more information that we need to write into the intermediate format output files and read back in, we also need to bump the revision number of the intermediate format by one.

Currently, there are a couple of failures in the testsuite that I will have to investigate next. There is also still a missing assertion in DataOutReader::merge that I will fix soonish.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15296 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove files that appear to be out of date

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15295 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove, it is identical to 'generic'

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15294 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove file -- it is not up to date anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15293 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix problem of linking debug with non-debug versions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15292 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

roundoff differences

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15291 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust to new structure

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15290 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove two occurances of an Assert which is not valid on general 3D meshes. The 'correct' form of the Assert is used in the neighbor_child_on_subface function anyway, so there is no need to repeat a clumsy test here.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15289 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On meshes with non-standard face_orientation, face_flip or face_rotation we could not find our way back from coarse cells with fine neighbors or vice versa using the neighbor_child_on_subface and neighbor_of_coarser_neighbor functions. Change the way that neighbor_of_coarser_neighbor works, so that we now find our way back in any case. (see tests/bits/mesh_3d_21)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15288 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test that currently fails. On meshes with non-standard face_orientation, face_flip or face_rotation we cannot find our way back from coarse cells with fine neighbors or vice versa using the neighbor_child_on_subface and neighbor_of_coarser_neighbor functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15287 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15286 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Significant cleanups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15285 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a bunch of functions that are unused.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15284 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move the stream objects into an internal namespace

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15283 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an 'Assert (false, ExcInternalError());' to functions that are not implemented.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15282 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-indent entire file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15281 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another reference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15280 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename m_inverse to A_inverse, because that is what it is here.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15279 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove pressure rhs, we won't need it here...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15278 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename variables to 'T' instead of 'S' to indicate that we are now dealing with temperatures.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15277 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get the thing to run. Simplify a bunch of places by removing stuff that was specific to step-21.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15276 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify more function calls with std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15275 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify a function call with std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15274 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid the use of general macro names in header files. Use something prefixed by DEAL_II_ instead, and #undef it again as soon as we can.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15271 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start a short essay on update flags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15268 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more detailed BLAS installation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15267 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add testing n_blocks

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15266 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

number of blocks in FESystem documented

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15265 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

number of blocks in FESystem documented

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15264 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

number of blocks in FESystem should be just the number of base elements times their multiplicity

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15263 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two more publications, now already at 27 for this year :-)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15262 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify a few accesses to an exception in the base class. This shouldn't be strictly necessary in these functions (because they are explicit specializations not dependent on a template parameter any more) but xlC wants that anyway and so why not do it as there is no harm.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15256 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Apply the same fix as for the regular DoFHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15255 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix determination of memory_consumption size of a pointer variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15254 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove 'const' from the keys of a map, since they are implicitly already const. xlC nevertheless produces an error with this construct, so give it a break.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15253 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the memory_consumption function to account for the fact that 'faces' has been made a pointer

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15252 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo accidental checkin

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15251 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explicitly specify template arguments in calls to a template function in an anonymous namespace. xlC requires this and may even be correct since functions with implicit linkage should not be considered in template argument deduction, but gcc appears to accept this anyway...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15250 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress a warning about array arguments out of range that may appear in dead code (like in switch(dim) clauses that aren't taken).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15249 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo the last patch: we don't need anything to be mutable here at all since we don't modify the variable -- only the object the reference points to. constness isn't inherited from member functions to the pointed to object.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15248 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo the last patch: we don't need anything to be mutable here at all since we don't modify the variable -- only the object the reference points to. constness isn't inherited from member functions to the pointed to object.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15247 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix Kovasnzay flow

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15244 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the correct PIC flag for newer xlC versions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15243 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly recognize IBM xlC

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15242 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The C++ standard says that 'mutable' can't be applied to reference members, so change things to a pointer instead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15241 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The C++ standard says that 'mutable' can't be applied to reference members, so change things to a pointer instead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15240 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

inline all member functions of FilteredMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15239 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new FilteredMatrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15238 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

project_boundary_values for vector-valued elements

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15237 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-indent

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15232 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

return to old behavior

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15230 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix missing memory pool

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15229 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add default memory pool

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15228 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15227 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add additional Hessians

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15226 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check StokesLSingulartity

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15225 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

derivatives of StokesLSingularity

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15224 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15223 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Output file is valid also with previous gcc version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15222 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

PointerMatrixAux has own memory just in case

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15221 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

overload new_pointer_matrix_base to choose between PointerMatrix and PointerMatrixAux automatically

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15220 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move implementation of default constructor into .cc file. This may help the problem on Mac OS X where we get a linker error with a missing definition for the typeinfo data for dealii::Threads::internal::thread_description_base.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15219 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify a number of calls for broken STLs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15218 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify a number of calls for broken STLs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15217 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly qualify call for broken STLs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15216 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also list coding conventions in the long table

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15215 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added a function to the logstream class telling the user whether a file has been attached or not.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15214 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15213 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the last hold-outs of the term second_derivatives

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15212 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename the patch_second_derivatives field in the private Data structures of the DataOut classes to patch_hessians, to be conforming to the new naming convention Guido introduces.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15211 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust order of parameters such that the output parameter comes last.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15210 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reword a few things

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15209 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix path to file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15208 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to coding conventions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15207 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move the coding conventions file into the doxygen directory

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15206 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename compute_derived_quantities to two different names for the scalar and vector case to avoid warnings about hiding the respective other function if only one is overloaded.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15205 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix vertical spacing

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15204 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Hessians

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15203 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make legal html

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15202 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated step-29, now using new DataPostprocessor class to output data

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15201 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some awkward markup

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15200 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typos and simplify. @p is not required, doxygen recognizes the names also without @p.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add news entry for DataPostprocessor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one * to make class documentation of DataPostprocessor visible to doxygen.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15197 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure that doxygen can cross-link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move an apparently misplaced command.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replaced the remaining 2nd derivatives by hessians

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

stripped tarfile

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15192 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start unifying names of gradients and hessians

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15191 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Moved test for grid output and input into deal.II tree.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@15190 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d