Merge pull request #9623 from peterrum/ca_namespace

Introduce ConsensusAlgorithms namespace

Inroduce ConsensusAlgorithm namespace

Merge pull request #9607 from bangerth/active_cell_iterators

Convert a lot of places to range-based loops over all active cells.

Merge pull request #9629 from bangerth/typos

Fix a typo.

Merge pull request #9387 from peterrum/non-continuous-vector

Utilities::MPI::NoncontiguousPartitioner

Convert a lot of places to range-based loops over all active cells.

Fix a typo.

Merge pull request #9630 from peterrum/ca_instantiation_fix

Instantiate all ConsensusAlgorithm components

Add Utilities::MPI::NoncontiguousPartitioner

Merge pull request #9624 from peterrum/ExcNeedsMPI

Introduce and use new ExcNeedsMPI

Instantiate all ConsensusAlgorithm components

Intoduce and use new ExcNeedsMPI

Merge pull request #9585 from tjhei/use_global_cell_index_typedef

use global_cell_index in many places

Merge pull request #9628 from bangerth/69

Reference step-69 in a couple of places.

Merge pull request #9580 from MFraters/add_rank_2_tensor_orthogonalization_function

Add rank 2 tensor orthogonalization function

Reference step-69 in a couple of places.

Merge pull request #9622 from bangerth/vertex_indices

Introduce GeometryInfo::vertex_indices()

Merge pull request #9614 from tjhei/cleanup_check_indentation.sh

cleanup and document check_indentation.sh

Merge pull request #9625 from drwells/add-missing-boost-header

Add a missing boost header.

Add a missing boost header.

Use GeometryInfo::vertex_indices() in tests/.

Merge pull request #9616 from bangerth/active_cell_iterators-2

More active_cell_iterators().

Merge pull request #9600 from peterrum/ca_move_to_new_file

Move ConsensusAlgorithm related functions to mpi_consensus_algorithm.h

Use GeometryInfo::vertex_indices() in include/ and source/.

Add a changelog entry.

Add GeometryInfo::vertex_indices().

Merge pull request #9619 from bangerth/warnings

Avoid a bunch of warnings in release mode.

Merge pull request #9615 from tjhei/cleanup_shell_scripts

shell script: fix some shellcheck warnings

Fix tester: remove constant expression.

Avoid a bunch of warnings in release mode.

Move ConsensusAlgorithm related functions to mpi_consensus_algorithm.h

expand testing

adress Wolfgangs comments.

More active_cell_iterators().

address comments

use global_cell_index in many places

Merge pull request #9586 from bangerth/global_cell_index

Introduce types::global_cell_index.

shell script: fix some shellcheck warnings

cleanup and document check_indentation.sh

Merge pull request #9612 from tjhei/fix_check_doxygen_script

CI: fix check_indentation.sh script

CI: fix check_indentation.sh script

Due to the addition of check_doxygen.sh we were not checking the return
value of git diff. This means the travis check would pass even though
there was a diff.

Merge pull request #9611 from peterrum/fix_indent

[URGENT] Fix indentation in step-8

Fix indentation in step-8

Merge pull request #9584 from tjhei/ci_jenkins_set_ex

CI: Jenkins: set -x and set -e

Merge pull request #9602 from kronbichler/fix_fe_eval_constraints

Fix bug in FEEvaluation for constraints in face integrals

Merge pull request #9601 from bangerth/8

Augment the introduction of step-8.

Add a changelog entry.

Compress documentation.

Introduce types::global_cell_index.

While there, also clean up a bit of the documentation around that point
in the file.

Use \mathbf C to denote the stress-strain tensor.

Augment the introduction of step-8.

We should make the connection to the Laplace equation a bit clearer, and also
introduce some of the notation we use there.

Merge pull request #9605 from bangerth/simplify

Simplify a piece of code.

Merge pull request #9608 from tjhei/table_handler_uint64_doc

doc: TableHandler uint_64 type

doc: TableHandler uint_64 type

It looks like we never mentioned that this type is available.

Merge pull request #9604 from peterrum/ConsensusAlgorithmProcessTargets_fixtype

Fix type of ConsensusAlgorithmProcessTargets

Merge pull request #9606 from tjhei/doxygen_warnings

fix some doxygen warnings

Merge pull request #9603 from bangerth/face_indices

Convert explicit loops over faces to range-based loops.

Comment some code and add aliases for readability

fix some doxygen warnings

Simplify a piece of code.

Fix type of ConsensusAlgorithmProcessTargets

Merge pull request #9592 from tjhei/ci_test64bit

CI: github action: test 64bit indices

Changelog

Add test case

Fix bug in FEEvaluation for constraints in face integrals

Merge pull request #9593 from nfehn/master

remove redundancy from MGTransfer

Merge pull request #9556 from peterrum/vectorized_transposed

Add new vectorized_load_and_transpose and vectorized_transpose_and_store

Merge pull request #9599 from kronbichler/another_longlong_fix

Add overload for logstream's << for uint64_t

Add new vectorized_load_and_transpose and vectorized_transpose_and_store

Add overload for logstream's << for uint64_t

MGTransfer: don't repeat yourself

Merge pull request #9557 from dangars/fix_equation_step_8

Fix elastic equation of step-8

Merge pull request #9575 from tjhei/doc_tria_level_ghost

documentation: improve level_ghost_owners

Merge pull request #9595 from masterleinad/use_templated_utilities_invert_reverse_permutation

Use a template for Utilities::reverse_permutation and Utilities::invert_permutation

Merge pull request #9560 from gassmoeller/fix_polar_manifold

Handle special case for PolarManifold::normal_vector

Convert explicit loops over faces to range-based loops.

Update include/deal.II/base/utilities.h

Co-Authored-By: Martin Kronbichler <kronbichler@lnm.mw.tum.de>

Use a template for Utilities::reverse_permutation and Utilities::invert_permutation

Merge pull request #9591 from kronbichler/fix_64bit_warning

Fix two 64 bit warnings by converting to long long unsigned

Merge pull request #9587 from bangerth/follow-up

Follow up to #9581

Fix documentation and indentation

Merge pull request #9590 from kronbichler/fix_compile_64b

Eliminate two places with unsigned long long int

Add a changelog entry.

Update the readme file.

CI: github action: test 64bit indices

Test 64bit indices on the OSX github action.

Remove duplicate code of invert_permutation

Eliminate two places with unsigned long long int

Fix two 64 bit warnings by converting to long long unsigned

Merge pull request #9589 from kronbichler/fixup_geometry_info

Fix compile error of GeometryInfo::unit_tangential_vectors on clang-4/5

Fix compile error of GeometryInfo::unit_tangential_vectors on clang-4/5

Merge pull request #9574 from peterrum/anonymous_ca

Add AnonymousConsensusAlgorithmProcess

Add AnonymousConsensusAlgorithmProcess

Merge pull request #9581 from bangerth/uint64_t

Use uint64_t instead of 'unsigned long long int'.

Merge pull request #9583 from tjhei/ci_remove_checkdoxygen

CI: remove check_doxygen as we do this in Travis

CI: Jenkins: set -x and set -e

This is useful when browsing the build log to see the executed command

CI: remove check_doxygen as we do this in Travis

see #9582

Merge pull request #9582 from masterleinad/improve_indentation_jenkinsfile

Improve indentation of Jenkinsfile

documentation: improve level_ghost_owners

Improve indentation of Jenkinsfile

Merge pull request #9576 from peterrum/mglevelglobaltransfer_assert

Add assert to MGLevelGlobalTransfer