tests: sundials/harmonic_oscillator_04 increase precision

Merge pull request #6065 from tamiko/silence_a_warning

Remove superfluous ;

Remove superfluous ;

Merge pull request #6051 from bangerth/minor-update

Minor update to FETools::get_interpolation_difference_matrix().

Merge pull request #6060 from bangerth/use-static-assertion

Convert an Assert into static_assert.

Merge pull request #6002 from luca-heltai/parameter-acceptor-proxy

Parameter Acceptor Proxy.

Merge pull request #6050 from davydden/extend_gitignore

extend gitignore

Merge pull request #6046 from davydden/feature/lapack_set

lapack: add set(i,j,value)

Add a changelog entry.

Add a test.

Convert an Assert into static_assert.

The TableIndices class had Assert statements in a couple of places
that the number of indices in question is a positive number, not zero.
Proximally, this led to Coverity complaining that a function called in a
noexcept function of Table may in fact throw an exception. The warning
is correct, and is most easily worked around by converting the
assertion into a static_assert -- which has to hold for the entire
class, so that's where I moved it from the affected member functions.

Merge pull request #6057 from luzpaz/misc-typos

Misc. typos fixes

Misc. typos fixes

Found via `codespell`

Minor update to FETools::get_interpolation_difference_matrix().

In particular, (i) update the documentation slightly, and (ii) simplify the logic of
the implementation by using IdentityMatrix. This also fixes the bug that there was an
assumption that the matrix was all zeros beforehand.

ParameterAcceptorProxy

add a test and a channgelog

Merge pull request #6054 from drwells/add-fullmatrix-changelog

Add a changelog entry for commits merged in 913d2a5d62.

Merge pull request #6052 from bangerth/cleanups

Minor cleanups to FETools::get_projection_matrix().

Merge pull request #6053 from bangerth/cleanups-2

Really only two micro-cleanups.

Add a changelog entry for commits merged in 913d2a5d62.

extend gitignore

Really only two micro-cleanups.

Minor cleanups to FETools::get_projection_matrix().

Merge pull request #6048 from drwells/rectangular-full-matrix

Rectangular full matrix

Merge pull request #6047 from masterleinad/fix_64bit_dof

Fix 64-bit dof type in test

Update tests with new output.

Since the default test matrix is rectangular, most FullMatrix tests now
have different output.

Update tests with identical output.

The FullMatrix tests now default to using rectangular matrices, but this
does not make sense for every test. This commit modifies tests so that
they use the old (square) test matrix.

Update tests with truncated output.

Use rectangular matrices in FullMatrix tests.

This catches more bugs.

Fix some assertions in FullMatrix.

Fix some (rectangular) FullMatrix methods.

Fix 64-bit dof type in test

lapack: add set(i,j,value)

Merge pull request #6023 from bangerth/parallelize

Parallelize FETools::compute_projection_matrices()

Merge pull request #6044 from luca-heltai/coupling-distributed

Distributed coupling.

Updated documentation for parallel triangulations.

Added distributed test.

Merge pull request #6043 from Rombur/xsdk

Do not use macros in the cuda matrix-free

Merge pull request #6042 from MFraters/add_change_entry_for_json_parser_for_input_files

add change entry for the add_json_parser_for_input_files pull request.

Do not use macros in the cuda matrix-free

add change entry for the add_json_parser_for_input_files pull request.

Merge pull request #6040 from bangerth/doc-update-3

Improve readability of doxygen-generated pages.

Merge pull request #6031 from bangerth/update-step-14

Don't use SynchronousIterator in step-9, 14

Merge pull request #6036 from luzpaz/misc-typos

Misc. typos

Merge pull request #6028 from kronbichler/improve_hermite_poly

Make Hermite-like polynomials represent constant by (1,1,...1)

Distributed coupling now working.

Merge pull request #5999 from luca-heltai/coupling

Non-matching sparsity and mass matrix.

Change weight in Hermite-like polynomials to make constant represented by (1,1,1,...1).

Source typos

Found more typos

Revision

Misc. typos

Found via `codespell`

Merge pull request #6032 from bangerth/doc-comm-world

Document the use of MPI_COMM_WORLD in MPI_InitFinalize.

Merge pull request #6041 from masterleinad/allow_valgrind

Add missing file used in #6035

Merge pull request #6038 from bangerth/doc-update-2

Fix doxygen markup.

Merge pull request #6033 from bangerth/doc-update

Document why using MPI_COMM_WORLD is ok in one place.

Merge pull request #5993 from MFraters/add_json_parser_for_input_files

Add json parser for input files

Add missing file used in #6035

Merge pull request #6035 from masterleinad/allow_valgrind

Allow to run the testsuite with valgrind

Fix a couple of places in the documentation of a function.

Improve readability of doxygen-generated pages.

Fix doxygen markup.

Document why using MPI_COMM_WORLD is ok in one place.

Merge pull request #6025 from masterleinad/fix_clang_6_performance

Fix llvm-6 clang-tidy performance findings

Allow to run the testsuite with valgrind

Merge pull request #6034 from bangerth/add-test

Add a test that works on only a subset of MPI processes.

Merge pull request #5998 from bangerth/update-example-output

Update a couple of things on how we generate output in the example steps

Merge pull request #6022 from bangerth/version-string

Provide a function that returns the version string.

Fix llvm-6 clang-tidy performance findings

Add a test that works on only a subset of MPI processes.

The test is intended to verify that we don't have stray references to MPI_COMM_WORLD.

Document the use of MPI_COMM_WORLD in MPI_InitFinalize.

Update a couple of things on how we generate output in the example steps.

Avoid the use of SynchronousIterator in step-9.

While there also mark a solution vector as a reference to avoid copying it.

Avoid the use of SynchronousIterator in step-14.

Point to the only tutorial program that uses this class.

Add a changelog entry.

Provide a function that returns the version string.

Merge pull request #6029 from bangerth/update-step-14

Avoid re-init'ing the same vector twice in step-14.

Avoid re-init'ing the same vector twice in step-14.

Merge pull request #6027 from bangerth/doc-update

Minor doc update to step-35.

Merge pull request #6003 from masterleinad/relaxation_block_set_kernel

Allow for setting the size of the kernel instead of a threshold in RelaxationBlock

Minor doc update to step-35.

Merge pull request #6024 from kronbichler/remove_mpi_comm_world

Do not use MPI_COMM_WORLD in MG Transfer

Remove use of MPI_COMM_WORLD in serial Trilinos vector.

Do not use MPI_COMM_WORLD.

Run the computation of projections from children in parallel.

Break the main part of a loop out of the loop and put it into a lambda.

Merge pull request #6020 from bangerth/doc-update

Improve documentation of FETools::compute_projection_matrices().

Merge pull request #6014 from kronbichler/improve_hermite_like_interp

Extend Hermite-like interpolation to case degree=2

Merge pull request #6021 from tjhei/cuda_documentation_fixes

CUDA: doxygen fixes

CUDA: doxygen fixes

- disable DEAL_II_ALWAYS_INLINE and __device__ in doxygen documentation
- avoid @ingroup for member functions because they will be moved not
copied to the group

Improve documentation of FETools::compute_projection_matrices().

Merge pull request #6012 from tjhei/cuda_warnings

CUDA: fix cmake 3.10 and remove warning

Merge pull request #6005 from jppelteret/fix_vector_from_trilinos_vector

Fix Vector::operator=(TrilinosWrappers::MPI::Vector)

Extend Hermite-like interpolation to case degree=2.

Merge pull request #6013 from tjhei/lapack_warnings

remove LAPACK warning about uninitialized info variable

remove LAPACK warning about uninitialized info variable

CUDA: fix cmake 3.10 and remove warning

Merge pull request #6009 from bangerth/doc-update-13

Better document one place.

Merge pull request #6008 from bangerth/cleanup-2

Better document a piece of code.