Merge pull request #12426 from marcfehling/fix-p4est

Fix setup script for p4est>=2.3.

Merge pull request #12427 from drwells/add-AssertIsNotUsed

Add an assertion for unused tria objects.

Add an assertion for unused tria objects.

Use find instead of version check.

Merge pull request #11490 from peterrum/tet_refinement

Enabling global refinement for TET meshes

Fix setup script for p4est>=2.3.

Merge pull request #12412 from lethe-cfd/particles_ghost_merge

Merge ghost and regular particles in single container

FIx cell type that is checked

Merge pull request #12417 from gassmoeller/reduce_use_of_particle_class

Do not use Particle class inside ParticleHandler

Merge pull request #12414 from bangerth/vec-tools-2

Simplify some code for the DG case by referring to the continuous case.

Enabling global refinement for TET meshes

Merge pull request #12401 from kronbichler/mapping_q_cache_vertices

Fix MappingQCache::get_vertices()

Merge pull request #12418 from bangerth/sundials

We no longer support SUNDIALS before version 3.0.

Fix ghost duplication bug + apply Rene's comments

Properly treat the case of piecewise constant elements.

Simplify some code for the DG case by referring to the continuous case.

We no longer support SUNDIALS before version 3.0.

Remove last non-necessary note

Apply Rene comments

Fix particle duplication + tests

First WIP version. Issue with exchange ghosts

Merge pull request #12395 from bangerth/vec-tools

Try to see whether we can avoid special-casing for MS VC in one place.

Do not use Particle class in ParticleHandler

Merge pull request #12402 from drwells/add-initlog-tests

Use initlog in some tests.

Merge pull request #12413 from bangerth/assertion

Add missing assertions.

Merge pull request #12409 from gassmoeller/use_particle_accessor_instead_of_particle

Simplify particle accessor structure

Merge pull request #12410 from jppelteret/fe_interface_values_01

Add FEInterfaceValues::quadrature_point_indices() to support range based loops

Merge pull request #12407 from simonsticko/face_interpolation_1D

Enable get_face_interpolation_matrix() in 1D on FE_Q and FE_Bernstein

Try to see whether we can avoid special-casing for MS VC in one place.

This error is currently triggered when running step-21. It is possible that with the move
to get_default_linear_mapping(dof.get_triangulation()) we no longer need this.

Add missing assertions.

Add FEInterfaceValues::quadrature_point_indices() to support range based loops

simplify particle data structure

Rename test face_interpolation_fe_Bernstein_2_fe_q.cc

Remove the suffix "_2_fe_q" in the filename, since it now tests both
the interpolation FE_Bernstein to Fe_Bernstein and FE_Bernstein to
FE_Q.

Enable get_face_interpolation_matrix() in 1D on FE_Q and FE_Bernstein

Currently, get_face_interpolation_matrix() on FE_Q and FE_Bernstein
throws an ExcImpossibleInDim(1) exception in 1D. This is strange
because the interpolation matrix should just be a 1-by-1 unit matrix.
Remove the dim > 1 assert in FE_Q_base and FE_Bernstein to fix this
and modify two tests to check that it works.

Merge pull request #12404 from drwells/gcc11-simplex-p-warnings-2

Fix another GCC11 warning.

Merge pull request #12406 from marcfehling/pack-unpack

Minor changes to `Utilities::unpack`.

Merge pull request #12398 from bergbauer/exodusii

Add grid reordering to read_exodusii function

Merge pull request #12405 from masterleinad/remove_remaining_deprecations_9_2

Remove remaining deprecations in release 9.2

Merge pull request #12399 from masterleinad/remove_deprecated_feseriers_constructors

Remove deprecated FESeries::Fourier and FESeries::Legendre constructors

Merge pull request #12394 from bangerth/checks

Simplify the code that leads to an assertion.

Merge pull request #12400 from drwells/virtual-dtor

Mark a destructor as virtual.

Merge pull request #12403 from masterleinad/remove_deprecated_compute_vertices_with_ghost_neighbors

Remove deprecated TriangulationBase::compute_vertices_with_ghost_neighbors()

Add `constexpr` to type check.

Merge pull request #12397 from bangerth/66

Minor edits to step-66.

Fix another GCC11 warning.

Use initlog in some tests.

We forgot to call mpi_initlog() in these tests, which caused the tests to
compare stderr + stdout as output - this is why we had a bunch of problems with
testers collecting additional MPI error output.

Remove remaining deprecations in release 9.2

Merge pull request #12396 from bangerth/tut-graph

Reduce the width of the tutorial graph by a little bit.

Merge pull request #12391 from marcfehling/hp-fevaluesbase

Make `hp::FEValuesBase` derive from `Subscriptor`.

Remove deprecated TriangulationBase::compute_vertices_with_ghost_neighbors()

Fix MappingQCache::get_vertices()

Merge pull request #12388 from JPmoep/master

Add AssertIndexRange for FEPointEvaluation

Simplify the code that leads to an assertion.

We convert integers to doubles so that we can run MPI::MinMaxAvg and then compare
the min against the max. We do this comparison with a tolerance, but that is
unnecessary: If the integer representations are the same, then so are the
floating point representations, bit-by-bit.

Mark a destructor as virtual.

Remove deprecated FESeries::Fourier and FESeries::Legendre constructors

Minor edits to step-66.

Reduce the width of the tutorial graph by a little bit.

More work is necessary, though.

Merge pull request #12381 from masterleinad/require_mpi_for_trilinos

Require MPI for Trilinos

Add grid reordering to read_exodusii function

Add AssertIndexRange for FEPointEvaluation

Merge pull request #12393 from peterrum/simplify_compute_point_to_point_communication_pattern

Simplify compute_point_to_point_communication_pattern() and compute_n_point_to_point_communications()

Merge pull request #11577 from gassmoeller/particle_vector_container

Store particles in vector container

Make `hp::FEValuesBase` derive from `Subscriptor`.

Add changelog entry

Merge pull request #12392 from peterrum/cellwise_inserve_mass_factory

Refactor CellwiseInverseMassMatrixImplTransformFromQPoints and use CellwiseInverseMassFactory

Address comments

Store particles in a vector

Simplify compute_point_to_point_communication_pattern() and compute_n_point_to_point_communications()

Refactor CellwiseInverseMassMatrixImplTransformFromQPoints and use CellwiseInverseMassFactory

Merge pull request #12377 from peterrum/part_simplify

 Simplify workflow of repartitioning

Simplify workflow of repartitioning

Conflicts:
source/grid/tria_description.cc

Merge pull request #12357 from peterrum/create_geometric_coarsening_sequence_new_const

MGTransferGlobalCoarseningTools::create_geometric_coarsening_sequence(): add parameters

Merge pull request #12390 from peterrum/transform_from_q_points_to_basis

CellwiseInverseMassMatrix::transform_from_q_points_to_basis() extension

Merge pull request #12389 from masterleinad/remove_deprecated_vector_tools

Remove deprecated VectorTools functions

MGTransferGlobalCoarseningTools::create_geometric_coarsening_sequence(): make it optional to coarsen input tria

CellwiseInverseMassMatrix::transform_from_q_points_to_basis: for degree = -1 and degree+1!=q_points_1d

Remove deprecated VectorTools

Merge pull request #12386 from masterleinad/remove_deprecated_fe_tools_l_to_h_numbering

Remove deprecated FETools::lexicographic/hierarchc_to_hierarchic/lexicographic_numbering

Merge pull request #12387 from peterrum/reduce_fix

Fix ambiguous call in Utilities::MPI::all_reduce

Merge pull request #12379 from simonsticko/fe_q_support_points_dim_1

Add a 0-dimensional face support point on FE_Q<1>.

Merge pull request #12384 from masterleinad/remove_deprecated_cell_accessor_active

Remove deprecated CellAccessor::active()

Merge pull request #12385 from masterleinad/remove_deprecated_vectorized_array_n_array_elements

Remove deprecated VectorizedArray::n_array_elements

Fix ambiguous call in Utilities::MPI::all_reduce

Remove deprecated FETools::lexicographic/hierarchc_to_hierarchic/lexicographic_numbering

Merge pull request #12383 from peterrum/DEAL_II_DEPRECATED_EARLY_user

Allow DEAL_II_DEPRECATED_EARLY in user code

Remove deprecated VectorizedArray::n_array_elements

Remove deprecated CellAccessor::active()

Allow DEAL_II_DEPRECATED_EARLY in user code

Add a 0-dimensional face support point on FE_Q<1>.

In several places QProjector is used to map the dim-1 dimensional face
support points to dim dimensional points, but this is not possible in
1D because unit_face_support_points currently contains no points for
FE_Q<1>. Add a single 0-dimensional point to unit_face_support_points
to fix this.

Merge pull request #12382 from masterleinad/remove_deprecated_first_cell

Remove DataOut::first_cell() and DataOut::next_cell()

Replace "#if defined(...)" by #ifdef(...)

Remove DataOut::first_cell() and DataOut::next_cell()

Require MPI for Trilinos

Merge pull request #12376 from masterleinad/remove_deprecated_mg_transfer_build_matrices

Remove deprecated multigrid transfer build_matrices() functions

Merge pull request #12371 from peterrum/pdt_subcomm

TriangulationDescription::Utilities::create_description_from_triangulation(): allow subcommunicator in p::d::T

Merge pull request #12356 from peterrum/create_geometric_coarsening_sequence_new

Add new version of MGTransferGlobalCoarseningTools::create_geometric_coarsening_sequence() that takes partitioner

Merge pull request #12375 from peterrum/mg_transfer_global_coarsening_mesh_type

Remove MeshType from mg_transfer_global_coarsening.templates.h

Remove deprecated multigrid transfer build_matrices() functions

TriangulationDescription::Utilities::create_description_from_triangulation(): allow subcommunicator in pdt

Add new version of MGTransferGlobalCoarseningTools::create_geometric_coarsening_sequence() that takes partitioner

Conflicts:
include/deal.II/multigrid/mg_transfer_global_coarsening.templates.h