Avoid out of bounds memory access

Merge pull request #7269 from drwells/dealii-9.0-7156

[9.0] redo 7156

Fix: 'iota' is not a member of 'std'

Fixes GCC compilation error:
 /source/base/mpi.cc:129:7: error: 'iota' is not a member of 'std'
That appears on newer gcc

Merge pull request #7261 from drwells/fix-petsc-detection

[9.0.1] fix PETSc detection

CMake: FindSLEPC.cmake: Fix regex for version number

Similarly to what was fixed in #7203, fix the regex to also pick up two
(or more digit) version numbers correctly.

*fix* petsc version 3.10 works now too (minor version was found by the regexp as "0" and not "10")

Merge pull request #6591 from davydden/bugfix/quicktest_scalapack_9

[9.0] take over #6590

quick-test: do not use lapack/create_matrix.h in scalapack test

Merge pull request #6588 from tamiko/pr_6587

[9.0] take over #6587

Fix .gitattributes

update VERSION for release

Merge pull request #6580 from tamiko/pr_6567

[9.0] take over #6567

Merge pull request #6579 from tamiko/pr_6577

[9.0] take over #6577

Fixed perl regex.

Fixed WB comment. Removed temporaryly the random new style.

Added div around inlined code.

Make sure program2doxygen does not change code blocks

Disable a test of a functionality that is currently experimental.

Merge pull request #6575 from tamiko/pr_6574

[9.0] take over #6574, #6573

Update the porting document.

Update some navbar links.

Merge pull request #6571 from tamiko/pr_6569

[9.0] take over #6569

Don't use tables in results.dox (copied from step 18)

Fixed some issues with step-60 doc.

Merge pull request #6570 from tamiko/pr_6564

Small doc fixes to the AD module

Small doc fixes to the AD module

Merge pull request #6563 from tamiko/pr_6542

[9.0] take over #6542

Fix DA's comments

Fix DD's comments; other documentation improvements

Add documentation for AD module

Fixes #6172

Merge pull request #6561 from tamiko/pr_6555

[9.0] take over #6555

Merge pull request #6560 from tamiko/pr_6553

[9.0] take over #6553

Correct whitespace in doxygen code section

Reformat table of images in step-18 results section

Add CSS environment for three column layout

Improve test lac/gmres_eigenvalues.

update VERSION for release

Merge pull request #6551 from tamiko/pr_6540

[9.0] take over #6540

Add the step-60 builds-on file.

Remove trailing whitespace.

Create another doxygen link.

Fix some markdown mishandling by doxygen.

My copy of doxygen does not correctly bold all statements with double
earmuffs; use HTML instead.

Remove spurious links to Boundary.

Fix some typos in step-60.

update VERSION for release

Merge pull request #6548 from tamiko/pr_6538

[9.0] take over #6537, #6538

Merge pull request #6549 from tamiko/pr_6544

[9.0] Take over #6544, #6543, #6541

Merge pull request #6547 from tamiko/pr_6536

[9.0] take over #6535, #6536

Clarify some text.

Remove a repetitive piece of text that doesn't add information.

Update the Gmsh entry in readme.html.

doc: say what we need from Gmsh

Remove a static Manifold from an example.

Clarify Manifold attachment in some functions.

Mention Manifold attachment in GridGenerator.

Attach a TorusManifold to a Torus.

Slightly decrease solver tolerance in lac/gmres_eigenvalues

Slighty increase tolerance in base/quadrature_chebyshev

Merge pull request #6514 from tamiko/pr_6393

[9.0] take over #6393

Merge pull request #6534 from tamiko/pr_6533

[9.0] take over #6533

Merge pull request #6515 from tamiko/pr_6508

[9.0] take over #6508, #6519

Make sure that also the output of the embedded value is on the deformed grid.

Merge pull request #6521 from tamiko/pr_6297

[9.0] take over #6297

Added doi.

Fixes to JP comments

Added references to step-60 in header files.

Added entries in tutorial.h.in

Added external cache.

Added possibility to read parameter from command line.

Written results, modified parameter file to use colorize

Added description of C and a solution example

Corrected refinement

First commented version of step-60

Co-authored-by: Giovanni Alzetta <giovannialzetta@hotmail.it>

Work around an internal compiler error on GCC7.

Only check for validity of the resulting Triangulation

Fix gmsh/create_tria_02

Merge pull request #6516 from tamiko/pr_6513

[9.0] take over #6291, #6511, #6513

put changelog entry back in place

Finally fix step-59 formula.

Fix typo.

Try to fix latex formula.

Explain the benefit of the fast diagonalization method in terms of iteration counts.

Link in step-59 in central tutorial page.

Write results section.

Write introduction.

Add step-59 tutorial program showing matrix-free DG.

Make sure not to attach a PropertyPool if not asked for

update VERSION for pre-release

Merge pull request #6509 from tamiko/pr_6475

[9.0] take over #6475

Fix the remaining gcc-8 warnings

Merge pull request #6503 from tamiko/pr_6491

[9.0] take over #6491

Merge pull request #6506 from tamiko/pr_6498

[9.0] take over #6498

Merge pull request #6507 from tamiko/pr_6499

[9.0] take over #6487 and #6499

Merge pull request #6501 from tamiko/pr_6483

[9.0] take over #6483

Merge pull request #6500 from tamiko/pr_6480

[9.0] take over #6480

Merge pull request #6505 from tamiko/pr_6496

[9.0] take over #6496

Actually fix compute_local_to_global_vertex_index_map.

The MPI types do not match the deal.II types, which is causes chaos when we use
32 bit indices.

Fix compute_local_to_global_vertex_index_map.

The MPI_Allgather call should have the same value inputs for the second
and fifth arguments.

CMake: Unset cached results for C++11/14/17 detection if necessary

CMake: Partially revert #6490