Merge pull request #1541 from tjhei/enable_muelu_tests

enable muelu tests with newer Trilinos

enable muelu tests with newer Trilinos

Merge pull request #1516 from tjhei/new_inst_file_splitting

rework fe_values.cc inst splitting

address comments

- rename files

Merge pull request #1534 from drwells/refactor-q1-mapping-with-exceptions

Use exceptions to mark Q1 transform failures.

Merge pull request #1536 from tamiko/fix_cxx11_thread_detection

CMake: Avoid running CXX11 Thread support test

Merge pull request #1539 from tamiko/gold

Use gold instead of the traditional linker if possible.

Use exceptions to mark Q1 transform failures.

The previous implementation returned magical numbers in some instances.

CMake: Refactor check for -fuse-ld=gold into check_01_compiler_features.cmake

Use gold instead of the traditional linker if possible.

Merge pull request #1522 from bangerth/further-FEValues-cleanups-32

Make MappingQ1::InternalData more generic

Reapply a patch that would otherwise have been lost in a rebase.

Store the correct polynomial degree in MappingQGeneric.

Currently, MappingQ derives from MappingQ1 which passes 1 down as polynomial degree.
This worked 'by accident' because the polynomial degree is only used by MappingQGeneric
in get_data() and friends, which are overloaded by MappingQ. However, the correct
place to store the polynomial degree is clearly in MappingQGeneric.

Remove MappingQ copy constructor.

It is apparently not needed.

Simplify code.

Some more preparatory work for separating MappingQ/Q1.

Some documentation updates.

Also make the Q1::InternalData object in MappingQ a pointer since that
will fit better into the structure we will need later on.

Refactor MappingQ/Q1 into a common base class.

This patch separates out the common functionality for generic polynomial
mappings into a base class. It contains most of what used to be in MappingQ1
but really was not specific to p=1 mappings.

Make MappingQ::InternalData protected.

Remove a whole bunch of code.

None of this is needed any more now that the InternalData
class has been largely separated.

Move the computation of the Mapping values into initialize().

Rather than having to do it yourself right after initialize(), let initialize()
call the function that does that. This greatly simplifies a good deal of code,
and also leads to better parallelization.

Move the code that initializes the Mapping{Q,Q1}::InternalData into that structure.

This allows us to get rid of the two implementations of compute_shapes(). It also
significantly simplifies the logic which of the two functions actually need to
be called, since the InternalData object actually knows that itself.

Get rid of the awkward dispatch mechanism in MappingQ*::compute_shapes().

In particular, remove the manual dispatch to either the Q1 or Qp functions.

Attempt to disentangle MappingQ1 and MappingQ.

Store the polynomial degree in MappingQ1::InternalData, rather than
which kind of mapping created it.

Merge pull request #1533 from drwells/tria-iterator-greater-than

Add operator< to TriaRawIterator.

Documentation: Increase minimal compiler versions to reflect reality

CMake: Avoid running CXX11 Thread support test

We have had multiple problems with running this test so far. The latests is
pull request #1524, the attempted fix opens another problem #1535.

Given the fact that the test tries to detect a problem with gcc-4.5, just
check for successful compilation.

Add operator< to TriaRawIterator.

This just switches the arguments to operator>.

Merge pull request #1532 from QiaoLei-88/step15Eqn

correct equation in intro of step-15

correct equation in intro of step-15

Merge pull request #1530 from asartori86/fix_multiple_parameter_loop

fix multiple parameter loop tests

new .inst splitting insolution_transfer.cc

fix multiple parameter loop tests

add changelog

move error_estimator code into templates.h

split compilation units

Implement .inst splitting in make_instantiations

Merge pull request #1377 from maieneuro/analytical_hessian_for_fe_poly_tensor

Analytical hessian for fe poly tensor

changed shape hessians in FE_PolyTensor to use analytical instead of numerical differentiation

Merge pull request #1520 from asartori86/prm_preprocess

Allow to use "\" in the file of parameters

allows continuation lines in ParameterHandler

Merge pull request #1524 from Rombur/cxx11_thread_bug

Workaround a bug with Ubuntu 14.04

Merge pull request #1525 from tjhei/sparsity_pattern_docs

update SparsityPattern documentation

update documentation

Workaround a bug with Ubuntu 14.04

Merge pull request #1521 from kronbichler/master

Attempt to fix non-C++11 code path

Attempt to fix non-C++11 code path

Merge pull request #1518 from tamiko/fix_openmp_simd_configuration

CMake: Fix openmp-simd configuration

add news/changes.h entry

CMake: Fix openmp-simd configuration

This enables openmp simd for Clang version 3.6 or newer (and the
corresponding version for XCode). Further, it unconditionally disables
the openmp check for any older clang version - checking for openmp support
with the flag only is unreliable

Merge pull request #1424 from davydden/fe_nothing_dominate

let make_hp_hanging_node_constraints() search for a common space in FECollection

fixed compiler warning in dof_tools_constraints

test make_hanging_node_constraints() with hp-ref and neither_element_dominates

simplified Grid generation in hp_constraints_neither_dominate_01

Also fixed indentation.

extend make_hp_hanging_node_constraints to hp-ref with neither_element_dominates

Remove no more used get_most_dominating_subface_fe_index().
Added an item to changes.h.

fix find_least_face_dominating_fe() for self-domination

test make_hanging_node_constraints() with p-ref and neither_element_dominates

extend make_hanging_node_constraints() to the case neither_element_dominates

Merge pull request #1513 from bangerth/further-FEValues-cleanups-31

Deprecate FEValues::transform().

Merge pull request #1512 from bangerth/further-FEValues-cleanups-30

Provide MappingQ::transform() variants.

Deprecate FEValues::transform().

I don't see the use of this function given that all the
transformations from reference to real cell should actually go
through the Mapping classes directly. The function is also not
used anywhere.

Fixes #1509. In reference to #1198.

Provide MappingQ::transform() variants.

Adding these variants had previously been forgotten.

Merge pull request #1510 from bangerth/further-FEValues-cleanups-29

Further fe values cleanups 29: update Mapping::transform()

Update documentation of Mapping::transform() functions.

Reorder the arguments to Mapping::transform().

Merge pull request #1507 from tjhei/test_fixes

Test fixes

fix compilation error

Type case to make sure the correct reinit() is picked up (not the
template). Error message:
/ssd/deal-git/tests/trilinos/trilinos_sparsity_pattern_03.cc:42:
undefined reference to `void
dealii::TrilinosWrappers::SparsityPattern::reinit<int>(dealii::IndexSet
const&, dealii::IndexSet const&, int const&, int const&, bool)'

do not elide initializer list braces

This fixes the test on intel 15.

Merge pull request #1497 from bangerth/update-step-6

Update the 'possibilities for extensions' section of step-6.

Provide a changelog entry.

Provide more links.

Update the 'possibilities for extensions' section of step-6.

This uses the code example provided by Konstantin Ladutenko.

Update step-6 results section in a few places.

Merge pull request #1506 from bangerth/fix-test-output

Adjust test output.

Adjust test output.

Merge pull request #1505 from tamiko/silence_warnings

CMake: Silence warnings on Mac with XCode prior to 6.3

Merge pull request #1504 from tamiko/fix_compilation

Fixes for commit 5ba5f99, pull request #1312

CMake: Silence warnings on Mac with XCode prior to 6.3

Testsuite: Obey naming convention

Bugfix: Fix syntax error in function.templates.h

Merge pull request #1312 from QiaoLei-88/constFunction

New class ConstantVectorFunction

Merge pull request #1494 from bangerth/squash-warning

Squash warnings.

Merge pull request #1503 from tjhei/simplify_indent_script

simplify indent script

simplify indent script

- find can filter by extension
- xargs does parallel invocation
- fair grouping improves performance

Merge pull request #1502 from tjhei/auto_indent_tests

Auto indent tests

fix indentation

auto-indent code in tests

Merge pull request #1501 from bangerth/fix-test-output

Fix test output.

Fix test output.

Merge pull request #1500 from kronbichler/master

Run astyle over testsuite.

Run astyle over testsuite.

Merge pull request #1499 from tjhei/fix_test_output

fix test output

Merge pull request #1488 from davydden/fe_nothing_dominate_part4

introduced FECollection::find_least_face_dominating_fe(const std::set…

fix test output

Merge pull request #1498 from kronbichler/master

Make test output more robust.

Make test output more robust.

Output the vertex locations for each component separately and put a space between the parenthesis and the numerical output (for numdiff).

introduced FECollection::find_least_face_dominating_fe(const std::set<unsigned int>&) const

Merge pull request #1495 from bangerth/add-tests

Add two tests.

Add tests.

Merge pull request #1484 from davydden/fe_nothing_dominate_part3

introduce a parameter to allow FE_Nothing dominate other FEs

introduce a parameter to allow FE_Nothing dominate other FEs

made other FEs to comply with the new FE_Nothing;
corrected documentation of FE_Nothing::compare_for_face_domination()