Reference step-46.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23585 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formula markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23584 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formula markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23583 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23582 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More text.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23581 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New operator* between SymmetricTensor and Tensor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23580 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed KellyErrorEstimator in codim one

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23579 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added test for error estimator

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23578 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a bit of text for now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23577 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it easier for the compiler to identify which function to call.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Moved recent specific changes to the section they belong to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23574 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add framework for coupling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23569 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix remaining transition of class names.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23568 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename primary class to reflect what the program actually does.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23567 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Kelly error estimator and Solution Transfer now work in codim one

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23566 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some text by Jichao Yin.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an erroneous explanation of an acronym.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23564 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-21:
If the size of a linear system is small, i.e. when the mesh is very
coarse, then it is sometimes not sufficient to set a maximum of
<code>src.size()</code> CG iterations before the solver in the
<code>vmult()</code> function converges. (This is, of course, a result
of numerical round-off, since we know that on paper, the CG method
converges in at most <code>src.size()</code> steps.) As a consequence,
we set the maximum number of iterations equal to the maximum of the
size of the linear system and 200.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23563 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

If the size of a linear system is small, i.e. when the mesh is very
coarse, then it is sometimes not sufficient to set a maximum of
<code>src.size()</code> CG iterations before the solver in the
<code>vmult()</code> function converges. (This is, of course, a result
of numerical round-off, since we know that on paper, the CG method
converges in at most <code>src.size()</code> steps.) As a consequence,
we set the maximum number of iterations equal to the maximum of the
size of the linear system and 200.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23562 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23558 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify p4est_3d_refine_02

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23557 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add 3D implementation of tangential_curl

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add functions to module

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add 3D implementation and augment documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23554 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed anisotropic refinement in codim one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23548 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test vector reinitialization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23547 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Circumvent case where one processor has no data.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify assertions in add() operations: The local size must fit, otherwise we get segfaults. But that is all we need.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix border case where some processors have zero vector sizes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update docs. Remove several parenthetical remarks.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make work with gcc-4.6.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile with gcc-4.6. Avoid some warnings about unused variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow comments at the end of a line of other stuff, rather than throwing away the whole line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch on source browser.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix doc markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formula.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move comment about the implementation to the function that actually does the
(internal) implementation, rather than leaving it with the general class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add auxiliary functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23513 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-32: in 2d we want the 12er hyber shell, not the 96er

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23510 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace ExcInternalError by more accurate ExcImpossibleInDim

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23506 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed annoying little bug

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23505 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

crash in refining a 12 cell shell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23489 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Trilinos expects a valid pointer for constant modes also when there is no data owned locally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23488 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23487 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23486 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changes updated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23485 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23484 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in get_face_interpolation_matrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated test results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23482 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix several bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23481 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in hp_quad_dof_identities.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23480 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23479 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot to disable Trilinos and PETSc in case we do not use them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23478 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some more instantiations for Trilinos and PETSc matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List additional copyright years.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also interpolate displacement boundary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a suggestion for extensions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify a statement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add ConditionalOStream::get_stream(). Use it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the discretization run time parameters and allow for locally conservative discretizations. Adjust a couple things when the input file is missing to avoid strange exceptions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23471 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23470 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix copy-n-pasto.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23469 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document and test the change to FESystem previously checked in.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23468 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Relax the conditions under which we don't return unit_face_support_points a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23467 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23466 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed sign error in step-29

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23465 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in FE_Nothing::get_name().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor grammar edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23462 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix several bugs that stood in the way of making the things with FE_Nothing that didn't work last week work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23461 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-insert an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23460 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix PETSc stuff introduced by me the other day with version < 3

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23459 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct cut&paste bug in doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23458 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup: replace Teuchos::rcp by shared_ptr in one place to be consistent with the rest of Trilinos part. Move one Trilinos header file to .cc file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23457 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23456 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initialize one variable to zero to eliminate a compiler/profiler warning on some systems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23455 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable Trilinos when explicitly saying so also when TRILINOS_DIR is set.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23454 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup and clarify documentation of ParameterHandler and DataOut and simplify the usage in step-29.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23453 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Chose a quadrature formula compatible with the fe_degree

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23452 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23451 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Consistently use a higher order mapping in all places I could
find. Add some more debug output that unfortunately shows that we
still do not get the divergence down very far.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo r23436 since it breaks all sorts of tests :-(.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23449 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change geometry slightly. Impose no-slip boundary conditions on the
interface.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing instantiation of interpolate_boundary_values.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23447 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

correct path for generating documentation with doxygen

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Handle constraints between FE_Q and FE_Nothing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23444 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test that currently fails so that I can look at it at home.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23443 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Indent a couple lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

put all classes for the parameterGUI in a namespace and add parameterGUI documentation to the doxygen flow

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test of get_fe_from_name for FE_Q with Gauss-Lobatto points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement get_fe_from_name for FE_Q with Gauss-Lobatto points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23439 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move test that now works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23438 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resolve a couple issues with the new no_requirements flag.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resolve a couple issues with the new no_requirements flag.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add output directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23435 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert accidental change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23434 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation. Other simple mods.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23433 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23432 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d