Merge pull request #9028 from agrayver/indent_contrib_python

Make indent script work for python bindings

Make indent script work for python bindings

Merge pull request #9050 from kronbichler/fixup_vector_communication_channel

Fix two places where we used too large numbers in communication channel

Merge pull request #9052 from masterleinad/cuda_hanging_node_inline

Mark HangingNode member functions as 'inline'

Mark HangingNode member functions as 'inline'

Fix two places where we used too large numbers in communication channel

Merge pull request #9049 from kronbichler/mapping_q_cache_by_lambda

Allow initialization of MappingQCache by lambda

Merge pull request #9023 from agrayver/extend_cell_python_interface

Extend cell python wrappers and add face wrappers

Extend cell python wrappers and add face wrappers

Add test case

Add initialization of MappingQCache by a lambda

Changelog

Fix bug in MappingQGeneric::transform_real_to_unit_cell

Merge pull request #9034 from tjhei/communication_channel

unify MPI tags for Partitioner/parallel Vector

Merge pull request #9048 from tamiko/fix_compilation_with_opencascade_6.8_and_older

fix compilation with opencascade version 6.8.0 and older

fix compilation with opencascade version 6.8.0 and older

Merge pull request #9040 from nicola-giuliani/stl_fixup

added stl read/write functions with compatibility

unify MPI tags for Partitioner/parallel Vector

- use specified range of MPI tags by Partitioner (and not different tags
by rank)
- limit communication channel in partitioner to 0..200
- limit vector communication channel to 0..100 (using Partitioner)
- use 100..200 for block vectors

Merge pull request #9010 from tjhei/central_mpi_tags

use global list of MPI tags for collective communication

updated change file

added another ifdef to check the versions of OCC

Merge pull request #9044 from peterrum/fix_log

Fix data of log files

Merge pull request #9018 from bangerth/22

Add a discussion about Schur complements to step-22.

Merge pull request #9042 from masterleinad/fix_timer_07

Fix timer_07 test

Fix data of log files

Fix timer_07 test

Merge pull request #8797 from kronbichler/speedup_multigrid_init

Allow multigrid transfer to use external vector partitioners

Merge pull request #9041 from kronbichler/remove_unused_variable

Avoid warning about unused variable

Changelog

Test case

Allow multigrid transfer to use external vector partitioners

Avoid warning about unused variable

improved check for OCC versions and test routines

Merge pull request #9038 from Rombur/cuda_volatile

Make variable volatile to avoid incorrect optimization

Make variable volatile to avoid incorrect optimization

See https://devtalk.nvidia.com/default/topic/965588/race-condition-within-warp/

Merge pull request #9039 from jodlbauer/quadratures

Add more choices to QuadratureSelector

Merge pull request #9025 from tjhei/timer_output_spam

remove TimerOutput error spam

break

added stl read/write functions

post comments from wolfgang

added changes

added IncrementalMesh

Add more choices to QuadratureSelector

Merge pull request #9033 from peterrum/compute_point_to_point_communication_pattern_nbx

Use ConsensusAlgorithm_NBX in compute_point_to_point_communication_pattern

Merge pull request #9035 from peterrum/consensus_algo_comment

Add missing doxygen comment in ConsensusAlgorithm

Merge pull request #9024 from tjhei/index_set_64

64bit fixes for IndexSets

Add missing doxygen comment in ConsensusAlgorithm

Rewrite compute_point_to_point_communication_pattern so that it uses ConsensusAlgorithm_NBX for MPI 3.0

Merge pull request #9022 from Rombur/warpsize

Do not hardcode the warp size

Merge pull request #9030 from tamiko/fix_tpetra_check

configure trilinos: Ensure that we are linking against MPI for Tpetra configure check

configure trilinos: Ensure that we are linking against MPI for Tpetra configure check

Merge pull request #9026 from masterleinad/revert_8976

Revert "added stl read/write functions"

Merge pull request #9027 from peterrum/dofhandler_docu_fix

Add missing bracket in docu of DoFHandler

Add missing bracket in docu of DoFHandler

Revert "added stl read/write functions"

This reverts commit 30df5d2033e8fa9a3eb0b0e01da04d34c090b270.

address comment

remove TimerOutput error spam

TimerOutput produces output on each MPI rank when an exception is
thrown. This makes looking at output with 100k MPI ranks somewhat
annoying. Fix this by only outputting on rank 0.
This assumes that also rank 0 triggers this exception, which might not
be true. In that case, we would likely deadlock anyways...

fix comment

fix output

fix index types

add test

fix complete_index_set

Do not hardcode the warp size

Merge pull request #9020 from masterleinad/missing_header

Add missing header

Add missing header

fix bug

Merge pull request #9013 from masterleinad/fix_hp_cell_weights_tests

Fix hp_cell_weights tests

Merge pull request #9016 from Rombur/step_54

Add missing namespace

Add a discussion about Schur complements to step-22.

Merge pull request #9017 from bangerth/20

Minor updates to the documentation of step-20.

fix compilation

Minor updates to the documentation of step-20.

Merge pull request #9012 from masterleinad/fix_fullydistributed_grids_copy_serial_test

Fix test output for fullydistributed_grids/copy_serial_tria

Add missing namespace

Merge pull request #8419 from dangars/phase_shift_periodic_constraints

Bloch periodic conditions (a.k.a. phase shift periodic conditions)

Merge pull request #9014 from rezarastak/dof_tools_doc_fix

small documentation fix in DoFTools

small doc typo fix in DoFTools

Fix hp_cell_weights tests

Fix test output for fullydistributed_grids/copy_serial_tria

Merge pull request #9005 from jodlbauer/master

Allow change of SIMD type via template argument

Merge pull request #9002 from tjhei/comm_by_const_ref

return MPI_Comm by const ref

Merge pull request #8976 from nicola-giuliani/stl_handling

added stl read/write functions

Fix Boost.Python CMake (#9011)

Fix Boost.Python CMake

Unset Boost_FOUND to get Boost.Python properly configured

use smaller type

add many other MPI tags

add missing file

use global list of MPI tags for collective communication

introduce Utilities::MPI::internal::Tags with a list of unique MPI tags.

part of #8958

Merge pull request #8994 from kronbichler/simplify_index_owner_internal

Slightly simplify MPI::ComputeIndexOwner::Dictionary range detection

Merge pull request #9008 from peterrum/indent-message-hint

Add a hint to the indention script

Add a hint to the indention script

added stl read/write functions

post comments from wolfgang

added changes

Merge pull request #8962 from peterrum/gridout-vtk-optional-all

Output all faces and edges to vtk

Add SIMD type to template list of MF-Operators

Merge pull request #9003 from tjhei/index_set_add_indices_64

fix 64bit IndexSet::add_indices

changelog

Output all faces and edges to vtk

Merge pull request #9001 from tjhei/use_collective_mutex2

protect more MPI communication with a CollectiveMutex

fix 64bit IndexSet::add_indices

the offset parameter needs to be 64 bit to allow shifting an IndexSet in
a large computation.

part of and hopefully a fix for #8937

return MPI_Comm by const ref

Fix a few places where we return the MPI_Comm by value. This is
problematic if we pass it to a function taking a reference and storing
it:

    CollectiveMutex::ScopedLock lock(mutex, tria.get_communicator());

do not take a reference to the communicator

protect more MPI communication with a CollectiveMutex

- also replace a MPI_Probe with MPI_ANY_TAG

Merge pull request #8997 from tjhei/use_collective_mutex

use MPI::CollectiveMutex in several places