LinearOperator: Implement a mean value filter operator

Merge pull request #6427 from luca-heltai/externalize-cache-from-coupling

Externalize cache from coupling

Added comments on missing implementation,+test for hanging nodes

Merge pull request #6367 from bangerth/op-eq

Make FiniteElement::operator== virtual.

Merge pull request #6430 from bangerth/step-54

Follow convention with placement of 'break' statement.

Merge pull request #6410 from bangerth/code-gallery-update

When configuring the code-gallery, skip generated files.

Follow convention with placement of 'break' statement.

Merge pull request #6415 from luca-heltai/fix-step-54

Fix step-54

Merge pull request #6429 from bangerth/step-51

Fix a grammar issue.

Merge pull request #6349 from jppelteret/fix_6339

Adol-C advanced branching: Fix FEValues and tensor classes

Fix a grammar issue.

Merge pull request #6416 from luca-heltai/fix-manifold-doc

Fixed some documentation about boundary and manifold.

Merge pull request #6422 from masterleinad/test_rand

Add test for Testing::rand

Merge pull request #6411 from masterleinad/undefined_7

Simplify CommunicateLocallyMovedVertices::unpack_data

Merge pull request #6408 from bangerth/step-51

Minor edits to the step-51 introduction.

Minor edits to the step-51 introduction.

Specifically, make sure 'FE_DGPMonomial' is spelled correctly. While there,
also address a couple of other things.

Take two fields out of FiniteElement::operator==() again.

Fixed DW comments.

Merge pull request #6426 from drwells/fix-clang-6-warnings

Fix clang 6 warnings

Changelog.

Moved Cache outside compute_coupling_mass/sparsity.

Merge pull request #6420 from masterleinad/update_base_assign_subscriptor

Update test output for base/assign_subscriptor without threads

Removed an unused typedef.

Use nullptr instead of 0.

Merge pull request #6424 from tamiko/fix_mpi_version_variables_2

CMake: Fix MPI version detection, round two

CMake: Fix MPI version detection, round two

Merge pull request #6421 from tamiko/fix_mpi_version_variables

CMake: Fix MPI version detection for newer cmake

Fixed compilation.

Add test for Testing::rand

Merge pull request #6390 from masterleinad/new_fixes_4

Provide alternative output for the *vector_add_and_dot_complex tests without threads

Fixed comments by JP and TH

Merge pull request #6418 from masterleinad/update_lac_vector_memory

Update alternative test output for lac/vector_memory

Merge pull request #6417 from kkormann/fix_6300

Fix matrix-free commits (comments by Bruno Turcksin).

CMake: Fix MPI version detection for newer cmake

CMake: Remove OpenMPI specific version detection

Update test output for base/assign_subscriptor without threads

Merge pull request #6419 from masterleinad/update_base_reference

Update test output for base/reference without threads

Update test output for base/reference without threads

Update alternative test output for lac/vector_memory

Merge pull request #6405 from masterleinad/undefined_4

Avoid accessing elements of a zero size vector in ParticleHandler

Fix matrix-free commits (comments by Bruno Turcksin).

Merge pull request #6414 from kronbichler/issue_6403

Use std::vector::data+offset() rather than [] access

Merge pull request #6413 from masterleinad/undefined_8

Avoid creating pointer to invalid memory in get_dof_indices

Merge pull request #6409 from bangerth/add-include

Add a necessary #include file.

Remove unnecessary const_cast.

Merge pull request #6412 from masterleinad/initialize_sun

Initialize SUN* objects

Fixed intro.

Removed statics, fixed some comments.

Fixed documentation.

Merge pull request #6381 from drwells/update-step-6

Update step 6.

Use vector::data() + offset in a few places. Add assertion.

Do not dereference pointers as we might be at the end of the array.

Simplify the last AssertThrow

Avoid accessing elements of a zero size vector in ParticleHandler

Avoid creating pointer to invalid memory in get_dof_indices

Initialize SUN* objects

Merge pull request #6404 from masterleinad/undefined_3

Guard accessing values in Vector<Number>::zero_out_ghosts

Simplify CommunicateLocallyMovedVertices::unpack_data

When configuring the code-gallery, skip generated files.

People run 'cmake' in their code-gallery directories and may then want to
create documentation for these directories later. The generated files greatly
confuse doxygen, so (appropriately) filter them out.

Add a necessary #include file.

We now reference the 'free' function in the .h file. We need to '#include' the necessary
header file.

Merge pull request #6401 from masterleinad/undefined_1

Only invert bits up to the maximum possible in ~CacheUpdateFlags

Merge pull request #6406 from masterleinad/undefined_5

Avoid signed overflow in test

Merge pull request #6402 from masterleinad/undefined_2

Avoid signed overflow in Testing::rand

Merge pull request #6387 from masterleinad/correct_deleter_readwritevector_values

Call the correct deleter for ReadWriteVector::values

Change style of array access

Fix some documentation regarding exception handling.

Avoid signed overflow in test

Merge pull request #6371 from jppelteret/follow_up_to_6335-2

CMake: Make Adol-C check for boost pool more specific.

Merge pull request #6398 from davydden/tests/zoltan

zoltan: run with mpirun annotation to avoid race condition

Merge pull request #6263 from mathgirl/assert_in_do_integrate_difference

Add missing assert in do_integrate_difference

Merge pull request #6391 from masterleinad/new_fixes_3

Avoid accessing invalid memory in base/utilities_pack_unpack_04

Merge pull request #6399 from GivAlz/NonMatchDocu

Fix documentation for NonMatching

Merge pull request #6392 from masterleinad/new_fixes_2

Clarify that base/reference causes stack-use-after-scope

Merge pull request #6375 from masterleinad/fix_scalapack_create_group

Fix scalapack create group

Guard accessing values in Vector<Number>::zero_out_ghosts

Add documentation to nonoverflow_add

Added documentation for NonMatching namespace

Avoid signed overflow in Testing::rand

Only invert bits up to the maximum possible in ~CacheUpdateFlags

Merge pull request #6400 from drwells/remove-double-stars

Avoid using '**/' at the end of comments.

Avoid using '**/' at the end of comments.

zoltan: run with mpirun annotation to avoid race condition

Merge pull request #6395 from kronbichler/test_fixes_avx512

Test fixes with AVX-512

Merge pull request #6296 from luca-heltai/failing-test

Fix bug in MappingFEField

Merge pull request #6389 from masterleinad/fix_memory_leak_kinsol

Fix memory leak in KINSOL wrapper

Test fixes with AVX-512.

Clarify that base/reference causes stack-use-after-scope

Avoid accessing invalid memory in base/utilities_pack_unpack_04

Provide alternative output for the *vector_add_and_dot_complex tests without threads

Fix memory leak in KINSOL wrapper

Use initializer list instead of default initializer

Merge pull request #6388 from kronbichler/documentation_matrix_free

Improve documentation of new matrix free data structures

Merge pull request #6385 from masterleinad/fix_warning_nonconst_comparator

Fix warning for non-const comparator

Merge pull request #6386 from kronbichler/mf_face_emplace_back

Prefer emplace_back over push_back in a few places

Document new parameters.

Fix doxygen appearance of MatrixFree::Loop.

Fix copydoc in FEEvaluationBase.

Call the correct deleter for ReadWriteVector::values

Merge pull request #6368 from drwells/fix-assert-nothrow-slicing

Fix assert nothrow slicing

Prefer emplace_back over push_back in a few places.