Merge pull request #95 from bangerth/updates

Minor updates to the MCMC-Laplace benchmark readme file.

Minor updates to the MCMC-Laplace benchmark readme file.

Merge pull request #90 from Lianxiali/fix_boundary_id_handling

Some fixes for functions of make_grid, make_constraints, and print_ve…

Update Cook membrane problem

- Further corrections for running in 3d
- Correct evaluation point such that it corresponds to the reference text (Miehe 1994)
- Set the default case to be the 3d one, which implements the plane strain condition in the reference text
- Updates for newer versions of deal.II

Some fixes for functions of make_grid, make_constraints, and print_vertical_tip_displacement

Merge pull request #85 from DavidSCN/fix-typo

Fix README typos

Fix README typos

Merge pull request #84 from DavidSCN/precice_tutorial

Add a deal.II-preCICE example

Add a deal.II-preCICE example

Merge pull request #83 from ecomellas/porovisco_code_updates

Format update for Nonlinear poro-viscoelasticity code

Update readme.md

Fix formatting of lists. Changed from markdown to html.

Merge pull request #82 from krishnakumarg1984/fix_redundant_edge

Removes a redundant edge from Nonlinear_PoroViscoelasticity tutorial dependencies

removes a redundant edge from Nonlinear_PoroViscoelasticity tutorial dependencies

Merge pull request #81 from bangerth/filenames

Fix the spelling of code gallery programs in a builds-on file.

Remove unnecessary comma.

Fix a missing endline.

Merge pull request #79 from bangerth/filenames

Use the normalized file names in doc/.

Merge pull request #80 from bangerth/newline

Provide a newline where a newline is required.

Provide a newline where a newline is required.

Use the normalized file names in doc/.

The script that looks for code gallery programs wants files without .txt ending,
but this directory had them with a file ending. Fix this.

Merge pull request #72 from ecomellas/my-code-gallery-project

Initial source code and documentation for nonlinear poro-viscoelasticity

Documentation and code improvements

Initial source code and documentation

Merge pull request #49 from jcc242/parallel_in_time

Parallel in time

Fix test warnings and output

Tweak source files

Standardisation of includes; Remove some compilation warnings

Update Readme.md

Update CMakeLists.txt

Merge pull request #77 from jppelteret/update_deal_II_9_1

Update to deal.II 9.1: two_phase_flow

Update to deal.II 9.1: time_dependent_navier_stokes

Update to deal.II 9.1: Quasi_static_Finite_strain_Quasi_incompressible_ViscoElasticity

Update to deal.II 9.1: Quasi_static_Finite_strain_Compressible_Elasticity

Update to deal.II 9.1: MultipointFluxMixedFiniteElementMethods

Update to deal.II 9.1: Linear_Elastic_Active_Skeletal_Muscle_Model

Update to deal.II 9.1: goal_oriented_elastoplasticity

Update to deal.II 9.1: ElastoplasticTorsion

Update to deal.II 9.1: Distributed_LDG_Method

Add IDE related files to .gitignore

Update to deal.II 9.1: Ceres

Add build folders to .gitignore

Update to deal.II 9.1: cdr

Document code maintenance procedure

Merge pull request #75 from drwells/headers-2

Fix some #includes on noncompiled source files

Fix some #includes on noncompiled source files

Merge pull request #41 from bangerth/fix-elastoplastic

Do not make a variable 'static' in the elastoplastic code gallery.

Merge pull request #61 from bangerth/depr

Avoid deprecated stuff.

Merge pull request #74 from drwells/fix-virtual-warnings

Fix virtual warnings

Merge pull request #73 from drwells/cleanup-removed-features

Cleanup removed features

cleanup whitespace

Remove a pessimizing move.

Also a GCC warning.

Add some virtual dtors.

GCC warns about this since the class has a virtual function.

Avoid using DataOut::active_cell_iterator.

This was recently removed from deal.II.

Remove #includes of headers removed in 9.2.

Merge pull request #70 from bangerth/corrections

Minor corrections to a recent code gallery addition

Merge pull request #71 from bangerth/ref

Fix a wrong glossary reference.

Fix a wrong glossary reference.

Use correct latex markup.

Reduce the number of tutorials this program 'depends on'.

Merge pull request #67 from tjhei/doxygen_fix

fix doxygen warning

Merge pull request #32 from Jie-Cheng/time-dependent-navier-stokes

Time-dependent Navier-Stokes

remove warning

fix cmake config

Merge pull request #65 from krishnakumarg1984/tutorial_dag_fix

cleanup tutorial DAG for couple of code-gallery programs

cleanup tutorial DAG for coupel of code-gallery programs

Merge pull request #64 from bangerth/fix

Fix a bug in the Metropolis-Hastings solver.

Simplify the code slightly.

Adjust the number of samples to be computed.

Adjust the proposal distribution to get a particular acceptance ratio.

Pad output file names to a uniform length appropriate for unsigned integers.

Increase the precision of the output.

Augment documentation.

Fix a bug in the Metropolis-Hastings solver.

Avoid deprecated stuff.

Merge pull request #60 from jppelteret/Magneto_Active_Polymers_Book-01

Add placeholder for Magneto-active polymers book

Add placeholder for Magneto-active polymers book

Merge pull request #58 from tamiko/update_to_9.1-4

ElastoplasticTorsion: Update to 9.1

Merge pull request #56 from tamiko/update_to_9.1-2

CeresFE: Update to 9.1

Merge pull request #57 from tamiko/update_to_9.1-3

Distributed_LDG_Method: Update to 9.1

Merge pull request #59 from tamiko/update_to_9.1-5

elastoplasticity: Update to 9.1

Merge pull request #55 from tamiko/update_to_9.1

cdr: Update to 9.1

update FunctionMap

Use AffineConstraints<double>

Update FunctionMap

use AffineConstraints<double>

use AffineConstraints<double>

update FunctionMap

use AffineConstraints<double>

remove obsolete header file

use affine_constraints.h

cdr: Do not use deprecated FunctionMap type

cdr: use affine_constraints.h

cdr: Use AffineConstraints<double>

Merge pull request #54 from bangerth/update

Update the MCMC-Laplace Readme.md file.

Update the MCMC-Laplace Readme.md file.

Merge pull request #52 from bangerth/mcmc-laplace

Add a code that solves a Bayesian inverse problem

Require deal.II 9.1.

Tabulate the exact measurement values, rather than compute them on the fly.