Merge pull request #13315 from mschreter/matrixfree_compute_diagonal_vectortype

`MatrixFreeTools::compute_diagonal`: introduce template parameter `VectorType`

add typename VectorType to compute_diagonal

Co-authored-by: peterrum <peterrmuench@gmail.com>

Merge pull request #13319 from tamiko/update_find_hdf5

Merge pull request #13320 from bangerth/is_detected

Replace is_detected (type) by is_supported_operation (variable).

Merge pull request #13322 from bangerth/ca-empty

Deal with empty function objects in CA algorithms.

Merge pull request #13324 from kronbichler/fix_warning

Fix warning regarding unused parameter

CMake: Unconditionally require MPI for HDF5

Update github action

CMake: FindHDF5.cmake - remove workaround

CMake: Put FindHDF5 hints back in place

CMake: call CMake's FindHDF5 instead of trying to find everything by hand

Fix warning regarding unused parameter

Merge pull request #13316 from peterrum/compute_diagonal_initialize

MatrixFreeTools::compute_diagonal(): do not initialize vector

Merge pull request #13323 from bangerth/normalize

Micro simplication.

Adjust tests.

Micro simplication.

Deal with empty function objects in CA algorithms.

Also convert the has_begin_and_end query.

Also convert the is_not_parallel_vector trait.

Replace is_detected (type) by is_supported_operation (variable).

Also provide a bunch of doc strings for the involved functions. Then also replace
all of the current uses of the is_detected type by constexpr variables.

MatrixFreeTools::compute_diagonal(): do not initialize vector

Merge pull request #13312 from peterrum/gc_restrict_and_add_dg_fix

Fix MGTwoLevelTransfer::restrict_and_add()

Merge pull request #13272 from bangerth/ca-interface

Switch the consensus algorithms interface to using function objects.

Fix MGTwoLevelTransfer::restrict_and_add()

Merge pull request #13260 from peterrum/feeval_reinit_array

FEEval: allow to reinit with a batch with arbitrary cells

Merge pull request #13281 from peterrum/feeval_face_data

Introduce FEEval::*_face_data()

Merge pull request #13311 from peterrum/is_interior_face

FEEval: rename get_is_interior_face() to is_interior_face()

Introduce FEEval::*_face_data()

FEEval: allow to reinit with a batch with arbitrary cells

FEEval: rename get_is_interior_face() to is_interior_face()

Merge pull request #13309 from marcfehling/compute-mean-hp

Added hp-version for `VectorTools::compute_mean_value()`.

Merge pull request #12757 from simonsticko/step85

Add a CutFEM tutorial as step-85

Added hp-version for `VectorTools::compute_mean_value()`.

Add a changelog entry for step-85.

Add a CutFEM tutorial as step-85

This step shows how the NonMatching classes: MeshClassifier,
FEImmersedSurfaceValues and NonMatching::FEValues are intended to work
together. This is done by solving the Poisson equation on a hypercube
mesh where the domain is described by a level set function

Merge pull request #12771 from kinnewig/FE_NedelecSZ_hessians

Add Hessian to FE_NedelecSZ

Merge pull request #13305 from bangerth/assertion-2

Add a missing assertion.

Merge pull request #13307 from bangerth/manifolds

Updates to manifolds classes

Add hessians to FE_NedelecSZ

Merge pull request #13296 from bangerth/is_detected

Follow-up to is_detected.

Merge pull request #13300 from bangerth/namespace

Avoid 'using namespace' declarations.

Merge pull request #13299 from bangerth/std

Remove an unnecessary 'using namespace std' declaration.

Merge pull request #13301 from bangerth/manifold

Avoid a couple of references to GeometryInfo.

Merge pull request #13303 from bangerth/manifold-vs-manifolds

Rename Triangulation::manifold to Triangulation::manifolds.

Merge pull request #13302 from bangerth/doc-3

Minor updates to the documentation of GridTools::transform().

Merge pull request #13304 from bangerth/assertion

Improve the text of an assertion.

Merge pull request #13306 from bangerth/pipe

Minor adjustments to the pipe junction geometry.

Use copy constructors for manifolds in clone().

Mark some member variables as 'private'.

Minor adjustments to the pipe manifolds.

Minor adjustments to the pipe junction geometry.

Merge pull request #13298 from marcfehling/step55

Minor suggestions for step-55

Merge pull request #13124 from marcfehling/tee-2

Manifold for `pipe_junction`.

Avoid 'using namespace' declarations.

These declarations are dangerous and lead to difficult to find errors when
used in header files, but also in .cc files when used in scopes that one
can re-enter and when we use unity builds. Avoid where possible.

Add a missing assertion.

Improve the text of an assertion.

Rename Triangulation::manifold to Triangulation::manifolds.

The member variable is a std::map and generally holds multiple objects. Use the plural.

Minor updates to the documentation of GridTools::transform().

Avoid a couple of references to GeometryInfo.

Remove an unnecessary 'using namespace std' declaration.

Review function classes.

Adjust template parameter in solver.

Fix typo.

Move the declaration of a base class to right before its child class.

Move a few generic names into a namespace that explains what things refer to.

Merge pull request #13291 from masterleinad/detection_idiom

Use standardized detection idiom

Merge pull request #13287 from bangerth/ref-cell-2

Introduce ReferenceCell::n_isotropic_children().

Add assertions.

Un-hardcode some numbers.

Use n_isotropic_children() in an assertion.

Introduce ReferenceCell::n_isotropic_children().

Move a function to its proper place.

Merge pull request #13269 from blaisb/fix_disappearing_particles

Add a test for moving particles in a complex geometry and

Merge pull request #13294 from tamiko/fix_doc

Merge pull request #13293 from drwells/changelog-9.3.3

Port 9.3.3 changelog changes to master.

fix a rendering issue with doxygen 1.9.3

Fix matrix_free/matrix_free_type_traits test

Port 9.3.3 changelog changes to master.

Move detection idiom to internal namespace

Merge pull request #13286 from bangerth/ref-cell-1

Make naming of function arguments more uniform.

Use standardized detection idiom

Merge pull request #13288 from bangerth/traits

Minor edits to type traits classes.

Switch the consensus algorithms interface to using function objects.

Merge pull request #13289 from drwells/fix-null-ptr-warning

Fix a bogus warning about a null pointer in a lambda.

Revert particle handler change

Merge pull request #13267 from bangerth/prepare_for_answer

Remove the prepare_for_answer() callback in consensus algorithms.

Fix a bogus warning about a null pointer in a lambda.

I get the following warning:

/home/drwells/Documents/Code/CPP/dealii-dev/source/base/mpi.cc: In static member function 'static constexpr void dealii::Utilities::MPI::create_mpi_data_type_n_bytes(std::size_t)::<lambda(ompi_datatype_t**)>::_FUN(ompi_datatype_t**)':
/home/drwells/Documents/Code/CPP/dealii-dev/source/base/mpi.cc:384:15: warning: 'this' pointer is null [-Wnonnull]
  384 |               }};
      |               ^
/home/drwells/Documents/Code/CPP/dealii-dev/source/base/mpi.cc:376:15: note: in a call to non-static member function 'dealii::Utilities::MPI::create_mpi_data_type_n_bytes(std::size_t)::<lambda(ompi_datatype_t**)>'
  376 |               [](MPI_Datatype *p) {
      |               ^

This isn't a problem since deleters don't store any kind of state but we can
work around it by splitting the constructor call.

Minor edits to type traits classes.

Merge pull request #13285 from peterrum/PreconditionRelaxation_vmult_step_relax

PreconditionRelaxation: vmult/step w. relaxation

Make naming of function arguments more uniform.

We don't usually use _n as a suffix to indicate a _number or _index. In fact,
the implementation of the function also doesn't use the suffix used here
in the declaration.

Merge pull request #13283 from peterrum/om

SparseMatrix: rename om to omega

PreconditionRelaxation: vmult/step w. relaxation

Fix indent

Fix tolerance because particles are still lost

revert particles

Fix indentation

Fix lost particle by recalculating mapping + test

SparseMatrix: rename om to omega

Merge pull request #13278 from kronbichler/fix_real_to_unit

Fix bug in initial condition for transform_real_to_unit_cell

Merge pull request #13271 from bangerth/3b

Use relative tolerances in step-3.