Use tr instead of bash specific command

Merge pull request #24 from tjhei/macosx

preliminary mac osx support

mac osx support

Merge pull request #23 from koecher/hdf5-1.10

updates hdf5 to current v1.10.0-patch1

updates hdf5 to current v1.10.0-patch1

Merge pull request #22 from tjhei/arpack

add arpack-ng package

add arpack

(disabled by default)

Merge pull request #21 from tjhei/fix_numdiff

fix numdiff path

fix numdiff path

Merge pull request #18 from tjhei/release_8_5

switch to 8.5.0

Merge pull request #20 from tjhei/p4est_zlib

Fix p4est without zlib

Merge pull request #17 from tjhei/update_p4est

update p4est to 2.0

Merge pull request #19 from tjhei/add_numdiff

add numdiff package

p4est: enforce zlib and pass over arguments

If zlib is installed as part of candi (or manually by setting ZLIB_*),
pass this info to p4est. It turns out p4est won't work (at least in
debug mode) without having access to zlib. So enforce that too.

add numdiff package

numdiff is not installed by default and strictly speaking not a
dependency of deal.II, but it is very convenient to be able to do

    ./candi.sh --packages="numdiff"

and have it installed automatically.

switch to 8.5.0

update p4est to 2.0

Merge pull request #16 from tjhei/update_boost

update boost

update boost

Merge pull request #15 from koecher/update-readme

updates and enhances README.md

updates and enhances README.md

Merge pull request #13 from tjhei/update_ubuntu_instructions

update ubuntu instructions

Merge pull request #14 from tjhei/bg-color

change warning color from yellow to purple

change warning color from yellow to purple

(unreadable on a shell with white background)

update ubuntu instructions

Merge pull request #10 from koecher/superlu-dist-v5.1.2

Superlu dist v5.1.2

Merge pull request #9 from koecher/trilinos-v12.10.1

Set new repository (github.com) source for trilinos; updates to v12.10.1

Merge pull request #12 from tcclevenger/fix_apt-get_ubuntu16

Package names for ubuntu 16.04 have changed.

package names for ubuntu 16.04 have changed.

Merge pull request #11 from koecher/fedora-25

adds fedora 25 platform

adds fedora 25 platform

SuperLU_dist: v5.1.2 with simpler cmake and shared-lib interface; trilinos: superlu and explicit inst.

Set new repository (github.com) source for trilinos; updates to v12.10.1

Merge pull request #8 from koecher/deal.II-v8.4.2

Set deal.II v8.4.2 as default

Set deal.II v8.4.2 as default

Merge pull request #7 from dealii/fedora24

adds current fedora 24 to the supported platforms

adds current fedora 24 to the supported platforms

Merge pull request #4 from tjhei/petsc_update

update PETSc

Merge pull request #3 from tjhei/overwrite_package

allow overwriting packages list in cmdline

Merge pull request #1 from tjhei/cleanup

Cleanup, readme, simpler default paths

update PETSc

- update to 3.6.4
- use light package
- add mumps
- add parmetis/scalapack needed for mumps

allow overwriting packages list in cmdline

typo

change default paths

bump version, format package list

update readme

replace candi.cfg link, remove project-switch script

deal.II: v8.4.0 as default

Merge pull request #72 from Rombur/readme

Add documentation for generic linux cluster.

Add documentation for generic linux cluster.

Merge pull request #69 from tjhei/module_path

set sane module path

set sane module path

Merge pull request #71 from tjhei/config_path

changes to CONFIGURATION_PATH

Merge pull request #70 from tjhei/print_env_info

print environment script infos

changes to CONFIGURATION_PATH

- do not manually set the configuration path
- change the default to be under the installation path (only important
if you change the installation path)

print environment script infos

Merge pull request #65 from tjhei/trilinos_superlu

deal.II: fix trilinos 12 together with superlu dist

Merge pull request #61 from tjhei/j_space

candi: improve command line parsing and adds help message with the usual command line switch

Merge pull request #64 from tjhei/update_boost

update boost

Merge pull request #66 from tjhei/cleaning

Cleaning: removing dorsal's readme and usage files
In-source-build: added folders to gitignore

Merge pull request #63 from tjhei/update_petsc

update PETSC to 3.6.3

Merge pull request #62 from tjhei/enable_sh_check

enable.sh: check that object is a file

update gitignore

delete old files

fix trilinos 12 & superlu bug

update boost

update PETSC to 3.6.3

enable.sh: check that object is a file

catch invalid command line parameters

fix handling of -p

add -h, validate PROCS, update README

Merge pull request #60 from tjhei/curl_errors

curl: report errors and follow redirects

handle -j with space

curl: report errors and follow redirects

- curl -f will report an error code if the source reports 404 which
happens if the mirror doesn't contain the file. Otherwise we are left
with an invalid file.
- curl -L will follow redirects (302), which sourceforge uses sometimes.
Before we downloaded an invalid file (html page).
- verify_archive will no longer accept empty files as valid

Merge pull request #59 from tjhei/opencascade2

disable X11 in opencascade

disable X11 in opencascade

Merge pull request #57 from tjhei/opencascade_no_freetype

disable opencascade font stuff

Merge pull request #58 from tjhei/enable_script

add enable.sh script

generate enable.sh script

This creates a little helper script in ${CONFIGURATION_PATH} that will
source all configuration files. With this you can setup your whole
environment (PETSC_DIR, etc.) just by calling
source ${CONFIGURATION_PATH}/enable.sh

disable opencascade font stuff

With this, we no longer need freetype installed to build opencascade.

Merge pull request #56 from tjhei/update_trilinos

update trilinos to 12.4.2

update trilinos to 12.4.2

Merge pull request #55 from xywei/master

Update candi.sh (use of cecho before its definition)

Update candi.sh

Removed usage of cecho() and BAD before their definition.

corrected typo

trilions: bugfix: switch on superlu and parmetis, if present

candi: implements new DEVELOPER_MODE, for allowing source code changings

candi: package deal.II: optimises configuration file name

candi: adds creation of individual package configuration files

candi: ubuntu 16 xenial (development) detection

candi: deal.II: added support for the upcoming ubuntu16

candi: bugfix corrected if for loading default.packages (logical error corrected)

candi: bugfix, corrected if statement

deal.II: all (optional) packages DIRs are unset, if forced to be not used by DEAL_CONFOPTS

deal.II: opencascade auto off

deal.II: turn of metis for deal.II, if automatically detected by DEAL_CONFOPTS from dealii-prepare
NOTE: allows to build parmetis&superlu for trilinos without getting in trouble with deal.II metis setting

dealii-prepare: let the user confirm skipped packages due to DEAL_CONFOPTS and removes explict turn off for parmetis & superlu if metis is turned off

deal.II: removed special variables for superlu and parmetis

parmetis.package: removed whitespace for make -j<N>

dealii-prepare: more verbose output for forced skipped packages