some_to_some and all_gather.

Merge pull request #5500 from luca-heltai/pack_unpack

Utilities::pack and unpack

Added support for tuple serialization in Utilities.

Added pack/unpack to Utilities.

Merge pull request #5489 from o-sutton/fix_adaptation_bad_access

Fix EXC_BAD_ACCESS occurring when marking all elements for refinement or coarsening

Merge pull request #5495 from masterleinad/remove_unused_typedefs

Remove unused typedefs

Remove unused typedefs

Add a test to ensure that refine_and_coarsen_fixed_number behaves as expected when either top_fraction or bottom_fraction are set to 1.0.

Merge pull request #5488 from masterleinad/avoid_scoped_lock_warning

Avoid warning about unused ScopedLock for DEAL_II_WITH_THREADS=OFF

Add to minor news

Update grid_refinement.cc

Fix indentation

Fix EXC_BAD_ACCESS occurring when marking all elements for refinement or coarsening using refine_and_coarsen_fixed_number.

Avoid warning about unused ScopedLock for DEAL_II_WITH_THREADS=OFF

Merge pull request #5484 from davydden/bug/missing_instantiations_find_closest_vertex_of_cell

fix missing instantiation of find_closest_vertex_of_cell()

Merge pull request #5485 from masterleinad/fix_bounding_box_warning

Fix warning in base/bounding_box.cc

Fix warning in base/bounding_box.cc

fix missing instantiation of find_closest_vertex_of_cell()

Merge pull request #5479 from masterleinad/array_view_2

Introduce ArrayView::data() and use where appropriate

Merge pull request #5481 from jppelteret/ad-changelogs_01

Add changelogs related to newly implemented AD number functionality.

Add changelogs related to newly implemented AD number functionality.

Changelog entry

Introduce ArrayView::data() and use where appropriate

Merge pull request #5476 from masterleinad/instantiate_compute_interpolation_to_quadrature_points_matrix

Instantiate compute_interpolation_to/from_quadrature_points_matrix

Merge pull request #5125 from gassmoeller/add_particle_handler

Add particle handler

Instantiate compute_interpolation_to/from_quadrature_points_matrix also for dim!=spacedim

Merge pull request #5473 from jppelteret/ad-math_headers

Add math headers for AD numbers

Merge pull request #5474 from jppelteret/ad-fe_values

Add support for AD calculations to FEValues functions

Merge pull request #5117 from GivAlz/LocallyOwnedBBox

Compute bounding boxes approximating cells with a property (adding in grid_tools)

Make serial case compile. Disable case without p4est.

Test to show that a zero-valued function can have non-zero derivatives.

Remove unnecessary ProductTypes and std::decay in FEValues functions

With the current functionality my application of these two features in
the FEValues function is now overly defensive. So this effectively
reverts some of the changes made in #4951, as #4893 makes some use of
ProductType unnecessary and #5251 ensures compatible conversions between
numbers of all CV qualifications.

Add support for AD calculations to FEValues functions

When using AD to automatically compute the linearisation of a residual, one cannot a-priori assume no sensitivity with respect to zero-valued degrees-of-freedom. This commit ensures that this calculation shortcut is not taken for AD numbers.

Remove strict inclusion guards in unified AD header

Add Sacado math header

This adds some missing fundamental math functions for the supported
Sacado numbers.

Add Adol-C math header

This imports the Adol-C math operations into standard namespace. It
gives us the ability to use them (e.g. sqrt) within the Tensor class,
and it also allows the user to write generic code and switch between AD
number types.

Merge pull request #5470 from tjhei/petsc_lu_doc2

update PETSc PreconditionLU documentation, take 2

Merge pull request #5410 from kronbichler/improve_performance_transfinite

Performance improvement for transfinite interpolation manifold.

Merge pull request #5392 from jppelteret/ad-numbers_and_type_traits

 Implement type traits and helper classes for AD numbers

Merge pull request #5471 from masterleinad/avoid_ub

Guard some calls to memcpy, memset and memmove to avoid undefined behavior

Clean up code, fix comments by David.

Add tests for number traits classes: Sacado

Add tests for number traits classes: Adol-C

Implement type traits and helper classes for Sacado numbers

Implement type traits and helper classes for Adol-C numbers

Add core headers for internally supported AD numbers

- Type codes
- Type traits

Add a unifying header for auto-differentation.

Add initial outline of documentation for the AD/SD module.

Merge pull request #5472 from gassmoeller/fix_find_active_cell_around_point

Fix search for the cell of a vertex

Guard some calls to memcpy, memset and memmove to avoid undefined behavior

Fix search for a vertex location

Address comments

Merge pull request #5457 from davydden/tests/sundials_fixes

try to fix sundials tests

update PETSc PreconditionLU documentation, take 2

Merge pull request #5467 from davydden/fix_deprecated_bug

fix deprecation bug

fix deprecation bug

Merge pull request #5464 from vishalkenchan/rol/vector_adaptor

suppress use of ROL for older versions of Trilinos

Merge pull request #5465 from sairajat/AssertionAdd

Added Assert in fe_values.h to ensure fe_values object is reinited to cell

Checked Indentation

Merge pull request #5463 from jppelteret/sacado_complex_rad_guard

Detect a compiler bug that prevents compilation of complex Sacado::Rad.

Added Assert in fe_values.h to ensure fe_values object is reinited to a cell

recommend enabling ROL package while building Trilinos

suppress use of ROL for older versions of Trilinos

Merge pull request #5462 from masterleinad/fix_test_project_03

Fix numerics/project_03

Merge pull request #5459 from masterleinad/use_c++14_deprecated

Use c++14's [[deprecated]] if possible

Detect a compiler bug that prevents compilation of complex Sacado::Rad.

Merge pull request #5443 from davydden/vtu_binary

filter XML binary output in some tests

Fix numerics/project_03

fix sundials tests

Merge pull request #5461 from jppelteret/fix_5455

Add header to tests using Sacado::Rad.

Use [[deprecated]] if available

Add header to tests using Sacado::Rad.

For some older versions of Trilinos, the header for templated
Sacado::Rad numbers is missing from Sacado.hpp.

Merge pull request #5385 from tjhei/prm_escape_latex

 escape characters in LaTeX format of ParameterHandler

Fix position of DEAL_II_DEPRECATED

Hide LevelInd, and add insert_particles(points)

filter out binary data from XML output for some data_out tests

Merge pull request #5452 from masterleinad/merge_grid_tools

Merge parallel::GridTools into GridTools

cleanup a few data_out_base_vtu tests

Update changelog entries

Reintroduce distributed/grid_tools.h for a deprecation warning

Merge pull request #5447 from masterleinad/deprecate_vector_view

Deprecate VectorView

Merge pull request #5453 from tjhei/petsc_lu_doc

update documentation for PETSc PreconditionLU

Added method get_neighbor_type and EnumClass NeighborType in BoundingBox class. Added function compute_mesh_predicate_bounding_box to grid tools

update documentation for PETSc PreconditionLU

Merge distributed/grid_tools into grid/grid_tools

Remove 'parallel' prefix in distributed/grid_tools

Merge pull request #5448 from bangerth/add-instantiation

Add a missing instantiation.

Merge pull request #5444 from masterleinad/fix_interface_matrix_entry

Fix missing include file in multigrid/interface_matrix_entry_01

Move deprecation declaration at the end

Add a test.

Add changelog entry.

Add missing instantiation of function.

Deprecate VectorView

Merge pull request #5445 from drwells/update-gdbinit

Update the GDB pretty-printer.

Merge pull request #5446 from drwells/convert-to-utf8

Prefer UTF-8 to latin-1.

Prefer UTF-8 to latin-1.

Update the GDB pretty-printer.

The data array variable was renamed from 'val' to 'values' in 2faae204c26.

Fix missing include filed in multigrid/interface_matrix_entry_01

Merge pull request #5442 from davydden/fix_illegal_character

fix illegal character (<F6> instead of oe)

fix illegal character (<F6> instead of oe)

Add changelog entry