Merge pull request #15221 from bangerth/77

Update output of step-77.

Merge pull request #15186 from bangerth/nox

Let NOX callbacks conform to our new standard for callback errors.

Merge pull request #15216 from sebproell/sundials-remove-copy

Merge pull request #15199 from masterleinad/find_non_system_hdf5

Allow finding user-installed HDF5

Update output of step-77.

Merge pull request #15205 from tamiko/create_compile_commands_symlink

SUNDIALS: remove outdated copy functionality

Merge pull request #15189 from bangerth/kinsol-3

Add a test with an irrecoverable failure of KINSOL.

Merge pull request #15194 from sebproell/kinsol-nvector-view

KINSOL: do not copy vectors internally

Merge pull request #15214 from sebproell/step-77-nox

Fix step-77 NOX test

Merge pull request #15207 from kronbichler/variable_type

Tensor product kernels: Use the right type in some templated functions

KINSOL: do not copy vectors internally

Add changelog entry for fixed step-77

Fix step-77 with NOX: zero out residual

Merge pull request #15212 from drwells/bundled-kokkos-gcc-13-fix

Fix Kokkos compilation with GCC 13.

Merge pull request #15211 from bergbauer/fe_point_consistent_template_arg

FEPointEvaluation: Use template argument consistently

Merge pull request #15208 from kronbichler/fix_documentation

Fix typo in documentation

Merge pull request #15210 from sebproell/step77-zero-residual

Fix step-77: zero out residual before assembly

Fix Kokkos compilation with GCC 13.

Use template argument consistently

Fix step-77: zero out residual before assembly

Fix typo in documentation

Tensor product kernels: Use the right type in some templated functions

Merge pull request #15196 from bangerth/import-3

Avoid variables named 'import', part 2.

Merge pull request #15191 from bangerth/import

Avoid variables named 'import'.

Merge pull request #15193 from bergbauer/reduce_overhead_fe_face_normal_eval

Remove overhead from AlignedVector in FEFaceNormalEvaluationImpl

add an entry to .gitignore for build directories of example steps

CMake: create a compile_commands.json symlink

Modern IDEs such as VSCode use a separate build directory for
configuring and compiling a project (such as our example steps).

Unfortunately, this sometimes confuses language servers such as clangd
that might fail to find the correct compile_commands.json in that build
directory. Let's work around this issue by simply creating a symlink
from the source directory pointing to the compile_commands.json file.

As a sanity check, if there is already a compile_commands.json file
present, or if the source and build directory are the same we simply do
nothing.

Merge pull request #15206 from masterleinad/fix_warnings_gcc_13_1

Fix warnings with gcc-13.1

Fix warnings with gcc-13.1

Allow finding user-installed HDF5

Merge pull request #15188 from bangerth/kinsol-2

Avoid variables named 'import', part 2.

Merge pull request #15187 from bangerth/kinsol-1

Reduce overhead of AlignedVector

Merge pull request #15141 from peterrum/MGTwoLevelTransferBase

Add two level transfer operator between non-nested levels

Merge pull request #15192 from bangerth/test

Fix compilation of a test.

Fix compilation of a test.

Avoid variables named 'import'.

first part of review

Add interface for non-nested two level transfer

Co-authored-by: peterrum <peterrmuench@gmail.com>

Add a test with an irrecoverable failure of KINSOL.

Clean up after ourselves.

Catch and rethrow *all* exceptions.

Merge pull request #15178 from bangerth/kinsol-exc

Let KINSOL callbacks conform to our new standard for callback errors.

Add a test that checks NOX error handling.

Deal with obnoxious NOX ways of reporting errors.

Convert NOX tests to not return zero to indicate success.

Document what function we are setting up.

Convert NOX to use the new exception scheme.

Merge pull request #15182 from kronbichler/reduce_overhead2

Reduce overhead in calls to tensor product value function

Merge pull request #15159 from tjhei/mpi_comm_by_value

pass MPI_Comm by value

changelog

Add a changelog entry.

pass MPI_Comm by value

Merge pull request #15185 from kronbichler/avoid_load

Merge pull request #15132 from bangerth/concepts

Merge pull request #15183 from kronbichler/improve_poly

Weight kernel for multigrid: Simplify aliasing analysis for compiler

Merge pull request #15184 from bangerth/scope-exit

Reduce operation count in polynomial evaluation

Merge pull request #15154 from jh66637/reinit_rpe_with_distributed_compute_point_locations

make it possible to fill RPE with GT::DistributedComputePointLocation…

Remove another ArrayView

Reduce overhead in calls to tensor product value function

Merge pull request #15177 from bangerth/const

Make some variables in a few tests 'const'.

Merge pull request #15173 from bangerth/snes

Add the PETSc SNES version of step-77 as a test.

Merge pull request #15171 from bangerth/77-4

Let doxygen resolve a citation in step-77.

Merge pull request #15169 from bangerth/inline

Move a function out of line.

Merge pull request #15144 from bangerth/vec

Clarify the documentation of a reinit() function.

Merge pull request #15138 from bangerth/fiv

Implement alternative rules what quadrature/mapping object to use in FEInterfaceValues::reinit().

Merge pull request #15128 from bangerth/77-2

In step-77, also talk about the other nonlinear solver packages we support.

Mark constructor as 'explicit'.

Mark special functions as =deleted.

Add a changelog entry.

Add a test.

Add a ScopeExit function.

make it possible to fill RPE with GT::DistributedComputePointLocationsInternal

Merge pull request #15179 from bangerth/nox-test

Fix up the single NOX test

Merge pull request #15181 from kronbichler/fix_missing_symbol

Avoid missing symbols and use constexpr functions instead

Merge pull request #15180 from bangerth/more-nox-tests

More NOX tests

Avoid missing symbols by constexpr functions

Add the PETSc SNES version of step-77 as a test.

Move a function out of line.

Move functions into local lambdas, so that a member variable can be made non-public.

Document that the callbacks can throw exceptions.

Simplify code somewhat.

Convert step-77.

Convert tests.

Convert KINSOL callbacks to use exceptions.

Clarify the glossary entry.

Introduce an exception to be used by user callbacks.

Make some variables 'const'.

Add a version of step-77 solved with NOX.

Add another test.

Add a test.

Move some code to where it is actually used.

While there, just use '{...}' instead of 'if (true) {...}'.

Update documentation in a test.

Add necessary header files.

Merge pull request #15176 from bergbauer/fix_empty_quadrature_fe_point

Fix do_reinit of FEPointEvaluation for empty unit_points

Fix do_reinit of FEPointEvaluation for empty unit_points