Merge pull request #12276 from marcfehling/clang-tidy

Fix clang-tidy issues with #12246.

Merge pull request #12261 from bangerth/initlog-2

Use C++11 functionality.

Merge pull request #12262 from bangerth/initlog-3

Pass 'true' instead of '1' for a function that takes a 'bool' argument.

Merge pull request #12272 from luca-heltai/fix-ida

Fixed naming in IDA.

Fix clang-tidy issues with #12246.

Merge pull request #12035 from tyand96/step-78

Step 78

Fixed naming in IDA.

Merge pull request #12266 from bangerth/ida

Minor updates to the SUNDIALS/IDA wrappers.

Merge pull request #12254 from luca-heltai/fix-kinsol

Fix kinsol

Merge pull request #12269 from bangerth/aligned-3

Remove a destructor now no longer necessary.

Addressed comments by WB.

Merge pull request #12260 from bangerth/initlog

Mark a function argument as 'const'.

Remove a destructor now no longer necessary.

Leave the declaration in place but =default it, so that we continue to implement
the rule of 7.

Merge pull request #12185 from bangerth/aligned

AlignedVector: Move element destructors into the 'deleter' object.

Merge pull request #12268 from jppelteret/changelogs_01

Add three changelog entries for new tutorials.

Add three changelog entries for new tutorials.

Minor updates to the SUNDIALS/IDA wrappers.

Mark a function argument as 'const'.

Merge pull request #12258 from gfcas/step_66_update

Step 66 minor doc update

Merge pull request #12264 from mathsen/preparation_gcc_11

small changes which resulted in problems when merging a GCC 11 fix

Add a test.

Add a test.

Move element destructors into the 'deleter' object.

small changes which resulted in problems when merging a GCC 11 fix

Merge pull request #12259 from bangerth/35

Link to new image files in step-35

Pass 'true' instead of '1' for a function that takes a 'bool' argument.

Use C++11 functionality.

Link to new image files.

Doc entry.

Fix Kinsol interface.

Intro add note on reuse mg_transfer

Indent intro code snippets

Fix solution figure size

Merge pull request #12256 from drwells/fix-gcc11-compilation

Fix compilation with GCC11 and minimal dependencies.

Merge pull request #12257 from bangerth/35

Fix width of pictures.

Fix width of pictures.

Merge pull request #12255 from drwells/gcc11-nedelec-warnings

Fix some GCC11 warnings.

Fix compilation with GCC11 and minimal dependencies.

step-78: Black-Scholes Problem.

Fix some GCC11 warnings.

Merge pull request #12250 from peterrum/particles_lost

Fix ParticleHandler::sort_particles_into_subdomains_and_cells() for lost particles

Merge pull request #12253 from gfcas/add_changelog_step_66

Add changelog entry for step-66

Merge pull request #12251 from kronbichler/fix_warning_array_bounds

MappingQGeneric: Fix warning about array bounds

Add changelog entry

Merge pull request #12249 from peterrum/vector_tools_include

Include file in vector_tools.h

MappingQGeneric: Fix warning about array bounds

Fix ParticleHandler::sort_particles_into_subdomains_and_cells() for lost particles

Include file in vector_tools.h

Merge pull request #12245 from peterrum/fpe_mf

 Move FEPointEvaluation from fe to matrix_free

Merge pull request #12234 from masterleinad/fix_particles

Add assert for ParticleHandler when particles to be inserted are not found

Merge pull request #12239 from tamiko/pr_12201

Merge step-66 - rebased and squashed development branch

Move FEPointEvaluation from fe to matrix_free

Merge pull request #12236 from kronbichler/refactor_fe_point_evaluation

Refactor FEPointEvaluation

Merge pull request #12199 from peterrum/ca_requesting_processes

Allow to enforce unique mapping in RemotePointEvaluation

reindent code

step-66: Implement entire step-66

step-66: a nonlinear, parallel matrix-free example [WIP]

I am working with Fabian Castelli on a nonlinear, parallel, matrix-free
tutorial. Because this is the second time my chosen tutorial number was
taken, I would like to reserve it with this PR.

Merge pull request #12243 from brynbarker/step35

logged step 35 update

Refactor FEPointEvaluation

Merge pull request #12238 from drwells/typos-9.3

Typos 9.3

Merge pull request #12242 from peterrum/fpe_log

FEPointEvaluation: add change-log entry

Merge pull request #12233 from kronbichler/optimize_fe_point_evaluation_integrate

Optimize FEPointEvaluation::integrate() with tensor product path

Merge pull request #12240 from tamiko/remove_entries

remove placeholder changes entries

FEPointEvaluation: add change-log entry

logged step 35 update

Disable particle tests for codimension 1

remove placeholder changes entries

Merge pull request #12221 from kronbichler/fix_fe_field_function

Add assert to compute_point_locations_try_all

Run codespell

Fix double-word typos

Remove second-order Nedelec and Raviart-Thomas elements

FEFieldFunction: Detect case when some points were not found

Allow to enforce unique mapping in RemotePointEvaluation

Code optimization: Switch some loop bounds in hot loops to int

Merge pull request #12211 from peterrum/reinit_polynomial_transfer_diff

Accept differently partioned Triangulations in MGTwoLevelTransfer::reinit_polynomial_transfer()

Optimize FEPointEvaluation::integrate() with tensor product path

Merge pull request #12235 from peterrum/fpe_zero

FEPointEvaluation::integrate(): zero out solution array also if no points given

Merge pull request #12214 from jppelteret/vectorization_math_01

Add some more vectorisation math functions

FEPointEvaluation::integrate(): zero out solution array also if no points given

Merge pull request #12229 from peterrum/n_vector_tests

Test new methods of n_vector

Merge pull request #12160 from peterrum/simplex_examples

Add simplex/mixed mesh examples to simplex module page

Merge pull request #12230 from peterrum/sudials_copy

Remove sundials/copy.h

Update source/particles/particle_handler.cc

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Merge pull request #12232 from kronbichler/bugfix_point_eval_linear

Fix bug in FEPointEvaluation for certain linear functions

Test new methods of n_vector

Remove sudials/copy.h

Merge pull request #12200 from luca-heltai/ida-with-sundials-ge-4.0.0

Make IDA work with new sundials.

Add simplex/mixed mesh examples to simplex module page

Add assert for ParticleHandler

Merge pull request #12227 from luca-heltai/fix-dirac

Fixed gradient of tensor product cutoff.

Merge pull request #12226 from peterrum/find_active_cell_around_point_artificial

Add comment to find_active_cell_around_point()

Merge pull request #12215 from peterrum/fpe_0_test

FEPointEvaluation: test FE_DGQ(0)

Add tests for linear shape functions

Fix bug in FEPointEvaluation for certain linear functions

Restructured and renamed functions.

Moved to new interface in sundials.

Make IDA work with new sundials.

Fixed gradient of tensor product cutoff.

Merge pull request #12228 from luca-heltai/quick-fix-kinsol

Dirty fix for the tester.