MatrixFree: support FE_PyramidP

Merge pull request #11317 from peterrum/pyramid_test

Add a Poisson test on pyramid grid

Merge pull request #11360 from bangerth/property-pool

Make Particles::Property pool a template <dim,spacedim>.

Merge pull request #11354 from peterrum/windows-2016

Disable quick tests for windows-2016

Adjust tests.

Disable quick tests for windows-2016

Make Particles::Property pool a template <dim,spacedim>.

Merge pull request #11357 from tjhei/step-47-misc

step-47: misc cleanup

Merge pull request #11314 from gassmoeller/particle_vector

Particle property pool improvements

Optimize particle property pool

Merge pull request #11046 from kronbichler/flexible_evaluator

FEPointEvaluation: Evaluating shape functions on arbitrary points of a cell

Add a Poisson test on pyramid grid

Merge pull request #11282 from zjiaqi2018/low_storage_rk

Timestepping: add low-storage rk and update step-67

Merge pull request #11308 from peterrum/mf_diagonal_hp

MatrixFreeTools::compute_diagonal: enable for hp

add low-storage rk and update step-67

step-47: misc cleanup

- line up numbers in std::cout messages
- minor formatting

Merge pull request #11353 from peterrum/get_poly_space_numbering

Add comment to FE_Poly::get_poly_space_numbering()

MatrixFreeTools::compute_diagonal: enable for hp

Merge pull request #11307 from peterrum/mf_diagonal_class

MatrixFreeTools::compute_diagonal: accept class and function pointer

Merge pull request #11325 from peterrum/pyramid_dataout

Enable DataOut for Pyramids

MatrixFreeTools::compute_diagonal: accept class and function pointer

Merge pull request #11347 from peterrum/MatrixFreeTools_compute_matrix

Implement MatrixFreeTools::compute_matrix()

Merge pull request #11355 from peterrum/og

Jenkins: use -Og

Implement MatrixFreeTools::compute_matrix()

Jenkins: use -Og

Merge pull request #11328 from peterrum/pyramid_grid_out_write_vtk

Enable GridOut::write_vtk() for pyramids

Merge pull request #11323 from peterrum/pyramid_standard_to_real_face_line

Implement ReferenceCell::internal::Info::Pyramid::standard_to_real_face_line

Merge pull request #11292 from peterrum/wedges_measures

Test different measures for Wedges

Add comment to FE_Poly::get_poly_space_numbering()

Enable DataOut for Pyramdis

Merge pull request #11270 from peterrum/wedge_dataout

Enable DataOut for Wedges

Merge pull request #11327 from peterrum/qgauss_pyramid

Add QGaussPyramid

Merge pull request #11343 from peterrum/simplex_get_constant_modes

Implement Simplex::FE_Poly::get_constant_modes

Enable DataOut for Wedges

Merge pull request #11297 from peterrum/mf_wedge_test

Add Poisson/Helmholtz test: MatrixFree + wedge mesh

Merge pull request #11340 from bangerth/22

Better document step-22 solvers.

Test different measures for Wedges

Merge pull request #11348 from simonsticko/doc_sparse_direct_mumps

Fix documentation of two SparseDirectMUMPS functions

Fix documentation of two SparseDirectMUMPS functions

Doxygen block comments were used in petsc_solver.cc when c++ block
comments should have been used. This messed up the documentation of the
functions set_solver_type() and solve(). Fix this.

Merge pull request #11326 from peterrum/pyramid_fep

Implement ScalarPyramidPolynomial and FE_PyramidP

Merge pull request #11345 from peterrum/simplex_conformity

Fix conformity of Simplex::FE_P and Simplex::FE_WedgeP

Merge pull request #11344 from peterrum/pyramid_diameter

Implement TriaAccessor::diameter() for pyramid

Merge pull request #11346 from peterrum/simplex_get_fe_assert

Check reference-cell type of cell and FE

Merge pull request #11306 from peterrum/wedge_measure

Implement TriaAccessor::measure() for wedges

Check reference-cell type of cell and FE

Add Poisson/Helmholtz test: MatrixFree + wedge mesh

Impelment ReferenceCell::internal::Info::Pyramid::standard_to_real_face_line

Fix conformity of Simplex::FE_P and Simplex::FE_WedgeP

Implement ScalarPyramidPolynomial and FE_PyramidP

Enabel GridOut::write_vtk() for pyramids

Implement TriaAccessor::diameter() for pyramid

Implement Simplex::FE_Poly::get_constant_modes

Better document step-22 solvers.

Merge pull request #11313 from bangerth/pointer

Avoid pointers, use references instead

Merge pull request #11321 from peterrum/wedge_field

ScalarWedgePolynomial: Make polynomials for triangle and line class field

Merge pull request #11337 from masterleinad/guard_matrix_free

 Guard matrix_free/cuda_matrix_free.h again

Guard matrix_free/cuda_matrix_free.h again

Merge pull request #11336 from bangerth/type

Fix a data type issue.

Merge pull request #11335 from Rombur/new_coef_host

Add functions to perform CUDA matrix-free loop on the host

Fix a data type issue.

Merge pull request #11319 from tjhei/step-67-disable-simd

step-67: disable SIMD pragma

Merge pull request #11149 from marcfehling/unify-distribute-dofs

Clean up distribute_dofs().

Merge pull request #11324 from peterrum/reference_cell_base_fix

Fix base of Tet, Pyramid and Wedge

Merge pull request #11322 from peterrum/write_higher_order_cells_assert

Add assert to extract_vtk_patch_info

Merge pull request #11333 from bangerth/housekeeping

Housekeeping.

Merge pull request #11332 from bangerth/remove-internal

Remove an internal function.

Merge pull request #11334 from bangerth/namespace

Move a function into the appropriate namespace.

Add changelog entry

Add test

Add functions to perform CUDA matrix-free loop on the host

Move a function into the appropriate namespace.

Housekeeping.

Merge pull request #11331 from tamiko/fix_cxx14_flag_injection

CMake: Bugfix: set C++14 flag in CXX_FLAGS_SAVED

Remove an internal function.

Since #11301 introduced a more generic function, we no longer need this one in an internal namespace.

Merge pull request #11301 from peterrum/unify_diameter

Unify diameter implementations

CMake: Bugfix: set C++14 flag in CXX_FLAGS_SAVED

When configuring we make an attempt to set the flag -std=c++14 if we
fail to detect C++14 support. Unfortunately, we accidentally set this
flag in DEAL_II_CXX_FLAGS instead of DEAL_II_CXX_FLAGS_SAVED.

This implied that RESET_CMAKE_REQUIRED() did not include the -std=c++14
flag and consequently compile tests that relied on C++14 support failed.

Add QGaussPyramid

Fix base of Tet, Pyramid and Wedge

Add assert to extract_vtk_patch_info to prevent write_higher_order_cells with non hypercube cells

ScalarWedgePolynomial: Make polynomials for triangle and line class field

Update examples/step-67/step-67.cc

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

step-67: disable SIMD pragma

gcc 7.1 and 7.2 fail to compile SIMD pragmas inside a lambda function
with the error "sorry, unimplemented: unexpected AST of kind omp_simd".
Work around this.

fix

Merge pull request #11178 from peterrum/simplex_2D_refine

Simplex mesh (2D): implement refinement

Unify diameter implementations

Clean up DoFHandler::distribute_dofs().

Simplex mesh (2D): implement refinement

Avoid raw pointers in more places.

Avoid raw pointers -- use references instead.

Merge pull request #11273 from peterrum/mixed_mf_dg

Add Poisson test: MatrixFree + DG + mixed mesh

Merge pull request #11298 from peterrum/mf_wedges

MatrixFree: enable wedges (excluding faces integrals)

Merge pull request #11315 from bangerth/46

Fix step-46.

Merge pull request #11312 from bangerth/throw

Make clear that 'throw' is not a function.

Add changelog.

Fix step-46.

Merge pull request #11309 from tjhei/function_explicit_constructors

mark constructors in Function*<dim> as explicit

Merge pull request #11311 from pwesterbaan/typo_fix_tria_level

Fixed a typo in tria_levels.h

Make clear that 'throw' is not a function.

Fixed a typo in tria_levels.h

mark constructors in Function*<dim> as explicit

While not strictly backwards compatible, I think it is a very dangerous
design to have things convert to Function<dim> automatically including
an int. Stop this by marking them explicit.

Merge pull request #11288 from peterrum/simplex_project_matrix_free

Fix VectorTools::internal::project_matrix_free for arbitrary geometric objects