Merge pull request #8984 from bangerth/61

Update the discussion about broken RT space in step-61.

Merge pull request #8987 from bangerth/simplify

Use identity<...>::type in the right place.

Merge pull request #8986 from tjhei/intel_system_include_fix

disable intel system includes

Merge pull request #8988 from bangerth/space

Be consistent with spaces.

Be consistent with spaces.

Merge pull request #8985 from dougshidong/fix_derivativeform_template

Fix templating of some DerivativeForm functions.

Use identity<...>::type in the right place.

Merge pull request #8968 from agrayver/fix_python_cmake

Fix python bindings configuration for new boost

Make python a required package and remove old lines

Merge pull request #8712 from marcfehling/hp-refinement

Major redesign of hp::Refinement.

disable intel system includes

fixes #8374

Step-50 cleanup (#8948)

Step-50 cleanup

Merge pull request #8973 from winnifried/master

Fix for fe-degree in VectorTools::project_boundary_values_curl_conforming_l2

Update the discussion about broken RT space in step-61.

Fix templating of some DerivativeForm functions.

The previous implementation would automatically try to convert into double.

remove dead code

Merge pull request #8971 from peterrum/matrixfree-get_level_mg_handler4

Add copy assignment to MatrixFree::AdditionalData

Merge pull request #8980 from GrahamBenHarper/graham_dev_typofix

Fix a step-61 typo

Add copy addignment to MatrixFree::AdditionalData

Indentation fixed

Added tests for fix for wrong degree calculation in project_curl_conforming_l2 for FE Systems with FE_Nedelec of different degree

Fix a step-61 typo

Major redesign of hp::Refinement.

Generalizing function and parameter names. Introducing comparators. Distinguishing between absolute and relative thresholds. Elaborating on documentation.

Bugfix: Clear coarsen flags only on active children in hp::Refinement::choose_p_over_h().

Merge pull request #8687 from marcfehling/cellweights

Refactored parallel::CellWeights.

Merge pull request #8977 from marcfehling/template-arguments

Strip trailing whitespaces.

Strip trailing whitespaces.

Fix to TPetra compile issue

Indentation fixed

Refactored parallel::CellWeights.

Fixed fe dimension in VectorTools::internals::compute_face_projection_curl_conforming_l2

Fixed fe dimension in VectorTools::internals::compute_edge_projection_l2

Merge pull request #8676 from drwells/reinit-face-iterator

Permit reinitialization with iterators instead of (sub)face numbers.

Merge pull request #8972 from tamiko/fix_doxygen

fix doxygen documentation generation for tutorial steps

fix doxygen documentation generation for tutorial steps

Newer versions seem to be a bit more picky in what they consider a valid
documentation comment.

Thus, make sure to
 - start with "/**" and close with "*/" on the same line
 - remove the only "*" from the first line

Merge pull request #8970 from peterrum/svg_docu

Fix docu of GridOutFlags::Svg

Keep compatibility

Merge pull request #8941 from drwells/fix-cmake-mathjax-error

Fix an error check with MathJax.

Fix docu of GridOutFlags::Svg

Fix python bindings configuration for new boost

Merge pull request #8967 from peterrum/test_mpi

Make MPI test suite independent from p4est

Permit reinitialization with iterators instead of (sub)face numbers.

This is convenient when paired with the new cell->face_iterators() function.

Implement two helper index functions in (Cell,Tria)Accessor.

Move a function definition.

This puts it in the same order as its declaration.

Minor doc fixes.

Rename files

Make mpi tests independent from p4est

Merge pull request #8965 from peterrum/matrixfree-get_level_mg_handler3

Add copy constuctor to MatrixFree::AdditionalData

Add copy constuctor to MatrixFree::AdditionalData

Merge pull request #8944 from peterrum/matrixfree-getfaceiterator-fix

Fix bug in MatrixFree::get_face_iterator

Merge pull request #8959 from bangerth/memory

Report how much memory was requested when we fail allocating that much.

Fix bug in get_face_iterator

Merge pull request #8885 from tjhei/fe_interface_values_3

FEInterfaceValues: gradients and hessians

Merge pull request #8927 from nfehn/cutoff_digits

new function Utilities::cutoff_digits()

Report how much memory was requested when we fail allocating that much.

address comments

Merge pull request #8898 from sophy1029/step-61

Step-61 Use FE_DGRT for Darcy velocity

Merge pull request #8952 from bangerth/delete

Delete FunctionParse copy constructor.

Merge pull request #8946 from elauksap/interpolate_fe_parallel

Make VectorTools::interpolate() working in parallel

new function Utilities::cutoff_digits()

Final implementation + update documentation and test case

Co-authored-by: Doug Shi-Dong <doug.shidong@gmail.com>

Add related test and changelog + various fixes.

Co-authored-by: Doug Shi-Dong <doug.shidong@gmail.com>

Make VectorTools::interpolate working in parallel + update documentation.

Co-authored-by: Ivan Fumagalli <ivan.fumagalli@polimi.it>

Also delete move constructors/operators.

Also delete the FunctionParser operator=.

Delete FunctionParse copy constructor.

Merge pull request #8954 from tjhei/typo

fix typos in comments

fix typos in comments

nothing else.

Merge pull request #8902 from peterrum/gridout-vtk-optional

Make output cells, faces and co-faces optional in GridOut::write_vtk

Merge pull request #8892 from masterleinad/remove_bind_5

Replace std::bind in documentation

Replace std::bind in documentation

Merge pull request #8947 from tjhei/free_mpi_comm

new MPI::free_communicator and DuplicatedCommunicator helper

Merge pull request #8949 from tjhei/doc_write_vtu_and_pvtu

doc: improve write_vtu_with_pvtu_record

Apply suggestions from code review

Merge pull request #8950 from bangerth/geometry

Provide a link to the geometry paper.

address comments

Provide a link to the geometry paper.

doc: improve write_vtu_with_pvtu_record

use write_vtu_with_pvtu_record

step-50 cleanup

fix several issues listed in #8482

indent correction

Add Darcy velocity.

Merge pull request #8945 from dangars/trilinos_documentation

Remove unnecessary trilinos options

fix test

address comments

Update trilinos options

changelog

add DuplicatedCommunicator

add MPI::free_communicator function

Make output cells, faces and co-faces optional in GridOut::write_vtk

Merge pull request #8942 from bangerth/49

Update the results section of step-49.

Merge pull request #8899 from anates/arpack_solver_control

ArpackSolver sets number of iterations in SolverControl after finishing calculations

Update the results section of step-49.

Merge pull request #8492 from tjhei/step-49-cleanup

step-49: switch to vtu and add possible extensions

Merge pull request #8939 from tjhei/point_to_point_mpi_wait_fix

Fix missing MPI_Wait in compute_point_to_point_communication_pattern

Merge pull request #8940 from drwells/step-3-doxygen

Improve and fix some doxygen things in step-3.

Fix an error check with MathJax.

The correct variable name is MATHJAX_PATH and its correct invalid value (i.e.,
if nothing is found) is MATHJAX_PATH-NOTFOUND.

Improve and fix some doxygen things in step-3.

- use CellAccessor::face_iterators()
- no space after function name
- add some more doxygen links
- fix a missing @endcode

Fix missing MPI_Wait in compute_point_to_point_communication_pattern

Remove the early return (we will just execute 0 MPI_Recv) as we forgot
to Wailall. Also add some error checking while I am here.

Merge pull request #8935 from tjhei/consensus_get_requesters_barrier

add a barrier to avoid MPI race in ConsensusAlgorithm

Merge pull request #8936 from tjhei/partitioner_64bit_overflow

avoid 64bit overflow in Partiioner::set_ghost_indices