fix r30622 by specifying relative path

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor intro update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

modify the parameter GUI to handle Map and List paremeters as strings

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

identify_periodic_face_pairs creates periodicity information for two given boundary_ids on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added support for periodic boundary conditions on distributed meshes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Replace explicit file list with globbing expression

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark some Trilinos variables as advanced

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve conditioning of project_bv_curl_conforming.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Inline documentation for step-51

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test (do not need update_ghost_values() anymore)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

always do update_ghost_values in parallel::distributed::Vector::operator=

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

revert part of 30600 (accident)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in hp::DoFHandler and copy_triangulation(), this fixes tests/hp/copy_tria_bug.cc

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

document bug in hp::DoFHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run test for par::dist::vector too

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

ghost import for distributed::parallel:BlockVector::operator= and add new constructors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in parallel MG: need to import additional level ghost neighbors which are coarser

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename an (internal) file to match the name of the class declared therein.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a variable to be more descriptive.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cleanup, remove unneeded semicolons

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in compute_no_normal_flux_constraints when dealing with odd meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30590 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update documentation in a couple of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30578 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove debug calls previously left in accidentally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30577 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the correct data type for (invalid) default values of an array.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30575 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30574 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the bitset in collect_periodic_face_pairse, closes issue 114

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30572 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on shadowed libraries

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30570 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in the debug version of trilinos_sparse_matrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark a variable as const (because we can, and then we should).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30564 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a couple of apparently wrong uses of types::global_dof_index -- we will never have more than 4B coarse mesh cells. (Famous last words...)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30563 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30562 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30561 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce a macro to compare p4est version numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30560 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify code in a minor way.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30559 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30558 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a couple of comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30557 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add tests for: Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Fahad Alrasched: Add extract_subvector_to() function to all vectors. Use it in DoFAccessor::get_dof_values().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify (failing) test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30549 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc: Adapt P4EST_DIR path in the readme to current changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Parse p4est versions like 0.3.4 and get patch numbers correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect p4est versions and provide preprocessor variables for it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Also export the old lib-suffix variables in Make.global_options

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias' change for issue 106 (https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=106).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Fix issue 106 "common/Make.global_options defines 'enable-threads' wrongly

DEAL_II_WITH_TBB was renamed to DEAL_II_WITH_THREADS some time ago.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Denis Davydov: Document what exactly the gradient of a vector is.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another buggy assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update the documentation. Rename template arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make member variables of the levels objects private.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Since these functions are now no longer used for cells, we can
significantly simplify them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one more typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some unnecessary arguments from functions that now no longer need them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write necessary documentation. Avoid one #include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make a lot of things simpler now that we no longer use DoFObjects in hp::DoFLevels. Documentation coming next.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Matthias and Bruno for the testsuite work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a whole bunch of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify a couple of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30528 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No longer use DoFObjects for the hp DoFs on cells. This will make things a bit simpler and allow for some code simplification.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30527 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run spell-checker on all example files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30526 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Instantiate DataOut_DoFData in only one .inst.in file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove some leftover class in generic_linear_algebra

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix comments and SSOR in generic_linear_algebra

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30521 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix duplicated instantiations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30520 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor cleanups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30519 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct type stored in one offset array. Remove some code duplication in hp::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30518 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add memory_consumption(long unsigned int).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30517 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30516 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an assertion to catch a case Chih-Che Chueh ran into.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30515 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

pass validation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30514 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improve html

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30513 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor cleanups in the various hp-related classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30512 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Numbering of html sections
todo class for html
div for table of contents

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30511 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

adjust title

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30504 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add library targets

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30503 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add some cmake

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30501 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more comments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30500 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug while compiling with 64bit indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30497 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test case derived from step-10 which computes pi to 14 digits on 5 cells with mappings of orders 8 and 20.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30496 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test WorkStream with empty functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30495 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make work without threads

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30494 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compilation with C++11

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30493 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation: Rewrite the documentation aboutdocumentation about  sample CMakeLists.txts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30492 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more intro for step-51

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30491 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make MultipleParameterLoop work again following yesterday's changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30487 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix tutorial program

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30485 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30484 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write comments, cleanup second WorkStream call by using an empty function instead of a separate object, reinident file with astyle.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30483 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow including one input file from another.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a way to also output the file name we are reading when reporting an error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove code duplication.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30475 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup parts of the code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug in compute_normal_flux_constraints, new tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30472 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update comment about no normal flux boundary conditions around reentrant corners

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@30471 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d