Fig bug and augment FEEValuation. Rename MatrixFree::get_quadrature_formula into MatrixFree::get_quadrature. Fix typos in tutorial programs. Cleanup in matrix free class for hp case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a misleading error message

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use vtk output. Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Default to debug mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25623 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use proper markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on the refinement criterion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25621 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update after r25604.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25620 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update a couple test results after r25604.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25618 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25616 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one picture.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25615 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow selecting something different than gfortran by setting the F77 environment variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25614 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update test results after recent changes to FE_DGQArbitraryNodes and PointValueHistory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

added missing instantiations for DerivativeApproximation::approximate_derivative_tensor()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25612 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide links from functions to a module.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25611 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a couple sentences.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25610 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more paragraph as suggested by Joerg.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25609 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a section.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25608 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce step-43.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25606 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify the decision which iterator class to use somewhat. My hope is that this gives IDEs a better handle at what these iterator types actually are, though it doesn't seem to help much with Eclipse right now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added support for FE_DGQArbitraryNodes in codimension one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

clarify documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor simplifications.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a missing include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish step-15.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more references to a recently added glossary entry on component masks.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement W1infty norm and seminorm in VectorTools::integrate_difference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The point seems to be outside the cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Michael Rapson: Major update of the PointValueHistory class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one large comment on adaptive meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r25581 and leave a TODO discussing the issue.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25590 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct documentation. Provide a glossary entry and link to it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25589 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-42: fix deadlock with many CPUs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25588 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slightly more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25587 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify the description of ConstraintMatrix::set_zero(..) in the documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25586 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update test results that started failing in r25578.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25585 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor formatting changes. Remove unnecessary code to set a vector to zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25584 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Break long comment lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25583 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two more tests that currently fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25582 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small improvement, but not the real deal yet.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25581 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up code: clearly separate input arguments and return values, rather than using one function argument as both an initial hint and the place where a value is returned.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25580 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25579 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve an algorithm in MappingQ::transform_real_to_unit_cell.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25578 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update tests/bits/find_cell_6

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25577 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25575 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement one function though it isn't quite enoughg to get the Triangulation<1,3> case going.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25574 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend test for dim=1, spacedim=3.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25573 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename test. Add a bunch more commentary and make output less verbose and more informative.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25572 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more cross-references.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25571 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc edit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25570 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Marco Engelhard: Add DataOutInterface::write_pvd_record.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25569 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25568 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix numerous bugs in GridTools::find_cells_adjacent_to_vertex.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25567 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25566 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent two tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25564 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in GridTools::find_cells_adjacent_to_vertex() (workaround)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25562 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-42: fix compilation error

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25561 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Find and review a large number of typos. (Thanks, Matthias Maier, for running the script.)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25560 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve English language wording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve a formula.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a comment following a suggestion by Daniel Gerecht (thanks!).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25554 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixed bug for filling 'diag_mass_matrix_vector', use of dealii::Timer and FGMRES instead of CG

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25553 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25552 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add test for FEFieldFunction with hp::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25550 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make FEFieldFunction capable of handling hp::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25549 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update test about find_active_cell_around_point() to fail

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25547 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

documentation fixes (thanks felgru)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test actually works.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

document bug in find_active_cell_around_point()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixes for clang 3.1: remove default parameters and give all template parameters

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Go over it once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A short notification for DoFTools::make_periodicity_changes in changes.h

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A small test for DoFTools::make_periodicity_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Create the doc/doxygen/tutorial/{generated|plain|doxygen} folders during
documentation generation

This is particularly useful if the deal.II library is locally managed by
a version control system that cannot track empty directories, such as git.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not just yet use C++11 features.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it compile again in the case of using the distributed functionality.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't instantiate make_periodicity_constraints for dim == 1

As long as

dealii::DoFAccessor<0, dealii::DoFHandler<1, 1> >::child(unsigned int) const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::DoFHandler<1, 1> >::get_fe(unsigned int) const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::DoFHandler<1, 1> >::n_active_fe_indices() const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::DoFHandler<1, 1> >::nth_active_fe_index(unsigned int) const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::hp::DoFHandler<1, 1> >::child(unsigned int) const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::hp::DoFHandler<1, 1> >::get_fe(unsigned int) const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::hp::DoFHandler<1, 1> >::n_active_fe_indices() const
dealii::DoFAccessor<0, dealii::hp::DoFHandler<1, 1> >::nth_active_fe_index(unsigned int) const

are not instantiated, we cannot instantiate make_periodicity_constraints
for dim == 1 as well, otherwise linking against the libraries results in
unresolved symbols...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add DoFTools::make_periodicity_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a simple test for GridTools::collect_periodic_cell_pairs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include tria_accessor.h at the end of tria.h

Include tria_accessor.h at the end of tria.h, so that it is possible
for an end user to use the iterators of Triangulation<dim> directly
without the need to include tria_accessor.h separately.
(Otherwise the iterators are an 'opaque' or 'incomplete' type.)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add comments to closing namespace brackets

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a helper function GridTools::collect_periodic_cell_pairs for periodic
boundary conditions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a file that's necessary when I use boost via my libparest library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25528 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more markup fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25527 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an assertment of doxygen markup problems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25526 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove options that are no longer supported in doxygen 1.8.1 and that
were set to their default values anyway (so older doxygen versions
will still produce the same output as before).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update pictures and the text around it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25524 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix markup problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25523 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add necessary tags for doxygen 1.8.1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25521 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25517 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove all traces of MinRes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25515 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d