Test for HDF5 now runs in parallel

Merge pull request #10937 from peterrum/pft_manifold

Add note to Triangulation::create_triangulation

Merge pull request #10930 from bangerth/code-gallery

Also install missing files from the code gallery.

Merge pull request #10938 from masterleinad/fix_gcc-10-warnings

Fix some more gcc-10 warnings

Fix some more gcc-10 warnings

Merge pull request #10936 from masterleinad/fix_scalapack_test_again

Fix SCALAPACK tests again

Add note to Triangulation::create_triangulation

Fix SCALAPACK tests again

Merge pull request #10898 from bangerth/cc

Mention Code Complete as a resource.

Merge pull request #10935 from masterleinad/deprecated_parallel_triangulation

Avoid gcc-10 warning about deprecated parallel::Triangulation

Avoid gcc-10 warning about deprecated parallel::Triangulation

Exclude cmake-generated files.

Merge pull request #10308 from lethe-cfd/particle_advection_step

Step-68 : Particle tracking of a massless tracer in a vortical flow

Finalized step-68
Fixed a bug related to deal.II distributed vector and to the particle
loop in interpolated euler.

Merge pull request #10933 from elauksap/doc_muparser_fix

Fix broken link to muParser website

Fix broken link to muParser website

Merge pull request #10931 from peterrum/feeval_functions

Add some functions to FEEvaluation

Add some functions to FEEvaluation

Add a changelog entry.

Also install missing files from the code gallery.

Merge pull request #10929 from bangerth/period

Use proper grammar.

Use proper grammar.

Merge pull request #10301 from bangerth/66

step-19: A simple particles tutorial.

Merge pull request #10923 from bangerth/1

Make the tolerance in step-1 relative.

Merge pull request #10925 from bangerth/1.2

Better link to what one can do with iterators.

Merge pull request #10922 from kronbichler/refactor_fe_eval_impl

Refactor access to FEEvaluationImpl and friends

Adjust return parameter. Add inverse mass matrix

Add a reference to step-68.

Make whitespace more uniform.

Edit euler_step_interpolated() somewhat.

Leave a note about step-68.

Edit the remainder of the program.

Apply suggestions from code review by bangerth

Co-authored-by: Wolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>
Applied the final round of comments from Wolfgang

Better link to what one can do with iterators.

Merge pull request #10924 from bangerth/1.1

Better explain something in step-1.

Make the tolerance in step-1 relative.

Better explain something in step-1.

Refactor access to FEEvaluationImpl and friends

Merge pull request #10920 from kronbichler/integrate_scatter_bug

Fix multiple-component bug in FEFaceEvaluationImpl::integrate_scatter

Added the particles in "advanced techniques"
Added that the tutorial for the particles build on step-40
which I think is the first complete parallel tutorial.
Added changelog entry in major changes
Fixed additional spelling mistake
Apply suggestions from code review by bangerth
Applied all additional suggestions by Wolfgang Bangerth
- Fixed spelling mistakes
- Added an animation for the Rayleigh-Kothe vortex in the introduction
to illustrate the flow pattern

Co-authored-by: Wolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>

Fix multiple-component bug in FEFaceEvaluationImpl::integrate_scatter

Merge pull request #10911 from masterleinad/fix_scalapack_test

Fix SCALAPACK tests

Merge pull request #10912 from bangerth/noexcept

Mark two functions 'noexcept'.

Merge pull request #10703 from bangerth/7

Discuss the concept of superconvergence better.

Merge pull request #10919 from bangerth/follow-up

Minor doc fixes.

Use markdown.

Also mention step-19.

Minor doc fixes.

Add a changelog entry.

Mark two functions 'noexcept'.

Discuss the concept of superconvergence better.

Address Bruno Blais's comments.

Merge pull request #10918 from tjhei/step_3_double_rhs

step-3: use a double for the RHS

Fixed a few last spelling mistakes and syntax errors

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Rene Gassmoeller <rene.gassmoeller@mailbox.org>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Rene Gassmoeller <rene.gassmoeller@mailbox.org>

Applied Rene suggestion to introduction
- Fixed typos and minor elements

Add paragraphs about communication, load balancing

- Added missing parameter file
- Added section in introduction on the challenges related to distributed particle simulations

Applied Rene suggestions

Removed reference to step-19 for the moment to prevent CI error

- Removed dependency on trilinos or petsc to use deal.II distributed vectors
- Finalized step-68

Added properties to the particles
Shifted the particle creation to be at the gauss point to ensure that the same number of
particles is generated no matter the number of processors
There is still a bug with parallel output it seems, I will open
an issue

Change particle generation

Working example with properties

Temporary working version while I fix properties

Applied all comments on documentation

Update examples/step-68/doc/tooltip

Co-authored-by: Rene Gassmoeller <rene.gassmoeller@mailbox.org>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Rene Gassmoeller <rene.gassmoeller@mailbox.org>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Rene Gassmoeller <rene.gassmoeller@mailbox.org>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/results.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/step-68.cc

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/step-68.cc

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/intro.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/intro.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/intro.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Update examples/step-68/doc/intro.dox

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Address some comments

Extend documentation

Added the documentation for step-58
- Added introduction
- Commented to code fully
- Added results section
- Put animations on youtube

TODO :
- 2 places where additions by Rene would be appreciated
- Add particle properties and output them

Make indent

Add load balancing.

Addresses the first comments of Peter

Added a preliminary version of step-x for particle tracking on analytically defined velocity field

Merge pull request #10885 from agrayver/python_cell_wrapper

step-3: use a double for the RHS

Merge pull request #10856 from Rombur/cuda_cmake_18

Fix warnings when using cmake 3.18

Merge pull request #10875 from agrayver/python_wrappers

Add method for returning all triangulation cells

Add an incompatibility note and optional args

Update tutotial program

Add changelog item

Add python wrappers

Add an incompatibility note and optional args

Update tutotial program

Add changelog item

Add python wrappers

Merge pull request #10858 from gassmoeller/add_copy_from_particle_handler

Add copy from particle handler

Merge pull request #10913 from tjhei/doc_sparsity_it

SparsityPattern: improve documentation

SparsityPattern: improve documentation

My students rightfully complained, that it is very difficult to find
begin() (hidden in the base class) and the accessor functions (hidden
behind using).

fix_scalapack tests

Merge pull request #10910 from peterrum/categorize_by_boundary_ids_pbc

Fix categorize_by_boundary_ids for PBC

Fix categorize_by_boundary_ids for PBC