Get rid of create_triangulation_compatibility in the UNV reader.

This case is interesting since the current code only works by coincidence. Our
test files have vertices numbered like

    2 ---- 3
    |      |
    |      |
    1 ---- 0

which we read in in the old-style (UCD) numbering, which is like mirroring
across the y-axis. This causes all the cells to have a negative measure (but they
aren't pinched). GridReordering then fixes this by swapping vertices 1 and 3 of
every single cell - i.e., adding another -1 factor to the measure, which now
causes all cells to have positive measure. Something similar happens in 3D.

As far as I can tell there is no widely accepted node numbering for UNV like
there is for everything else so I am going by what Salome generates. Since we
now use their numbering directly (instead of something that worked by
coincidence) the output files are slightly different but all cells do end up
looking correct (nothing is twisted when we visualize with VTK).

Merge pull request #12036 from bangerth/uniformity

Make tooltips more uniform in style.

Merge pull request #12033 from peterrum/find_vector_in_mf

Compare pointers in find_vector_in_mf

Make tooltips more uniform in style.

Compare pointers in find_vector_in_mf

Merge pull request #12028 from bangerth/cmake-2

Make cmake messages easier to read.

Make cmake error messages easier to read.

Merge pull request #12020 from bangerth/p2

Fix a typo.

Merge pull request #12019 from bangerth/15-5

Break generation of graphical data into its own function in step-15.

Merge pull request #12021 from bangerth/p1

Avoid unnecessary include files.

Add missing include files.

Fix a typo.

Break generation of graphical data into its own function in step-15.

Merge pull request #11869 from dangars/hdf5_bool

Add bool type to HDF5

Merge pull request #12018 from bangerth/table-3

Rename more local variables. Add to the documentation.

Slightly simplify the AlignedVector::reserve() function.

Rename variables in AlignedVector::reserve().

Simplify the logic of AlignedVector::reserve().

Merge pull request #12017 from bangerth/table-2

Rename member variables.

Rename member variables.

Merge pull request #12009 from bangerth/table

Use std::unique_ptr to manage memory in AlignedVector.

Merge pull request #11965 from peterrum/compute_nonzero_components_assert

FETools::Compositing::compute_nonzero_components(): add assert

Merge pull request #12010 from tjhei/fewer_prepare_refine_calls

p::d:Triangulation: fewer prepare_coarsening_and_refinement calls

Merge pull request #11995 from bangerth/p2

Add a test.

Use std::unique_ptr to manage memory in AlignedVector.

Simplify step-15 with the new function.

Simplify step-11 somewhat.

Adjust tests.

Add a changelog entry.

Add a default argument.

Deprecate a DoFTools function that returns by argument, rather than directly.

We want to move away from these kinds of functions, so deprecate it and replace it by
a function that does the right thing instead.

Add a changelog entry.

Deprecate a function in DoFTools.

While there also update the documentation of its replacement a bit.

FETools::Compositing::compute_nonzero_components(): add assert

add tests

reduce number of prepare_coarsening_and_refinement() calls

I noticed that we call prepare_coarsening_and_refinement() many times
when using a p::d::Triangulation. Many of these are certainly
unnecessary:

1. distributed tria for mesh_reconstruction_after_repartitioning. This
is used to remove all refinement and smoothing will be called inside the
execute...() call below. No need to call our more expensive version.

2. serial execute_coarsening_and_refinement() should not call the
derived version, which in turn calls the serial version.

For the test tests/distributed_grids/refine_periodic_01:
Before: 154 sequential, 154 parallel
After: 126 sequential, 53 parallel

fixup

Merge pull request #11990 from vachan-potluri/subdivided_hyper_cube-doc

Fix mistake in parameter description

Merge pull request #12005 from bangerth/kinsol

Some KINSOL documentation updates.

Merge pull request #12006 from bangerth/whitespace

Unify endlines at the end of files.

Merge pull request #12011 from tjhei/readme-typo

small readme.html fixes

small readme.html fixes

Add changelog

Add HDF5 documentation for datatypes

Write test hdf5_07

Merge pull request #12004 from bangerth/15-4

Use an easier-to-read do...while loop.

Unify endlines at the end of files.

Merge pull request #11999 from masterleinad/avoid_polymorphic_use_arborx_access_traits

Avoid usage of the ArborX access traits in polymorphic contexts

Merge pull request #12002 from tamiko/small_cleanup

FindARBORX: Remove library variable

Merge pull request #12003 from lethe-cfd/cylinder_with_subdivision

Add a subdivided_cylinder grid generator and test

Merge pull request #11981 from marcfehling/distributed-signal-2

Added `p:d:TemporarilyMatchRefineFlags`.

Some KINSOL documentation updates.

Add bool type to HDF5

Merge pull request #11991 from bergbauer/boomer_settings

Add settings to BoomerAMG

Add changelog entry

Apply first round of comments

Regular cylinder uses subdivided_cylinder

Add image for subdivided cylinder

Use an easier-to-read do...while loop.

While there, also rename a variable again.

Merge pull request #11997 from bangerth/15-3

Rename a variable.

Merge pull request #12000 from bangerth/15-6

Remove an unnecessary destructor in step-15

Fixed documentation

Added `p:d:TemporarilyMatchRefineFlags`.

Add a subdivided_cylinder grid generator and test

Also make the base class members protected and improve documentation

Merge pull request #11993 from agrayver/define_vtk_types

Add query methods for vtk cell types in ReferenceCell

FindARBORX: Remove library variable

ArborX is a header only library, so we don't need to specify an empty
string here :-)

Merge pull request #11992 from peterrum/fesystem_delete_default_constructor

Delete default constructor FESystem

Merge pull request #11988 from marcfehling/fes-size

Remove assertion from `DoFHandler::get_fe_collection()`.

Add query methods for vtk cell types in ReferenceCell

Remove an unnecessary destructor.

Merge pull request #11987 from bangerth/unify

Unify the spelling of a section name in the tutorial programs.

Merge pull request #11954 from bangerth/const

Make a variable 'const'.

Avoid usage of the ArborX access traits in polymorphic contexts

Merge pull request #11994 from bangerth/p1

Rename a changelog file.

Add settings to BoomerAMG.

Merge pull request #11985 from bangerth/15-1

Minor updates to step-15.

Rename a variable.

While there, also replace a '1/' by '1./'.

Merge pull request #11986 from bangerth/15-2

Remove unnecessary header includes.

Rename a changelog file.

Delete default constructor FESystem

Fix mistake in parameter description

"repetitions" here is an integer unlike in subdivided_hyper_rectangle()

Merge pull request #11983 from peterrum/tria_policy_load_fix

Reset policy during Triangulation::load()

Remove assertion from `DoFHandler::get_fe_collection()`.

Make a variable 'const'.

Unify the spelling of a section name in the tutorial programs.

We use 'Possibilities for extensions' in about 40 existing tutorial programs. Use the
same heading in about a dozen others.

Remove unnecessary header includes.

Minor updates to step-15.

Merge pull request #11969 from marcfehling/signal-post-p4est-refinement

New Triangulation signal `post_p4est_refinement`.

Merge pull request #11984 from kronbichler/avoid_quadratic_complexity

Convert a few more cell loops into range-based for loops

Avoid quadratic complexity in coarse grid cells.

Reset policy during Triangulation::load()

Merge pull request #11980 from marcfehling/shared-signal

Fix hp-coarsening on p:s:Triangulation.

Merge pull request #11978 from masterleinad/fix_typo_grid_tools_collect_periodic_faces

Fix typo in GridTools::collect_periodic_faces

Merge pull request #11979 from drwells/improve-mpi-checks-3

Add some more AssertThrowMPIs.

Merge pull request #11976 from peterrum/parse_input_from_json

Wrap boost error message in ParameterHandler::parse_input_from_json()

Fix hp::Refinement::choose_p_over_h() for hp-coarsening on p:s:Triangulation.