fix latex formula

Merge pull request #1220 from kronbichler/r83_nodeprecate

[8.3] Do not mark Epetra_Map interfaces as deprecated: needs more work

Do not mark Epetra_Map interfaces as deprecated because it needs more work

Merge pull request #1210 from tjhei/r83_pr1208

[8.3] take over #1208: make IndexSet Epetra_Map constr explicit

make IndexSet Epetra_Map constr explicit

The new constructor IndexSet(const Epetra_Map &map) was not marked explicit
and caused ambiguous type conversions.

update VERSION for release

Merge pull request #1201 from tjhei/r83_pr1197_1191_1195

[8.3] take over #1197 #1191 #1195

fix compilation

size_type doesn't exist here yet

Made get_data return InternalData.

Moved dof values and indices inside InternalData. Closes #941.

Added entry in changes.h. Closes #1029.

Conflicts:
doc/news/changes.h

Added get_mpi_communicator() to Trilinos Matrix.

Added IndexSet constructor with Epetra_Map

Fixed documentation and a few const.

Conflicts:
doc/news/changes.h

Fixed bug in MappingFEField. Closes #1138.

Merge pull request #1189 from tjhei/r83_pr1180_1188

[8.3] take over #1180, #1188, and missing changelog

add missing changelog entry

Re-break comments to the usual length.

Update the numbers in a comment.

Add a changelog entry.

Conflicts:

doc/news/changes.h

Make sure that compute refinement thresholds are no larger than the max indicator.

This could happen because we search the threshold in an interval larger than the
actual indicators. If we end up with a threshold that is larger than the largest
indicator, we need to cut things back.

In the process of debugging, I also found a few oddities that have to do
with the fact that we do a lot of arithmetic in double precision, but often
pass in criteria as vectors of float. Fix some of those as well.

Merge pull request #1187 from tjhei/r83_pr1179

[8.3] take over #1179: Fix cmake configure issue introduced by #1148

Merge pull request #1186 from tjhei/r83_pr1176

[8.3] take over #1176 fix invalid operation in DynamicSparsityPattern::iterator

Fix cmake configure issue introduced by #1148

add missing RESET_CMAKE_REQUIRED() introduced by #1148 and commit
e02e450.

fix invalid operation in DynamicSparsityPattern::iterator

We used to compare two std::vector iterators that might belong to
different std::vectors. This is obviously illegal.

This addresses issue #1175, see
https://github.com/dealii/dealii/issues/1175

Add a test that failed (with stl debug library only).

Conflicts:

doc/news/changes.h

Merge pull request #1170 from tjhei/r83_authors

[8.3] add forgotten AUTHORS file for release

add forgotten AUTHORS file for release

Merge pull request #1161 from tjhei/r83_pr1148

[8.3] take over #1148: Workaround: fix compilation with icc and linear_operator

Merge pull request #1160 from tjhei/r83_pr1157

[8.3] take over #1157: Update tests for Intel 15

Merge pull request #1159 from tjhei/r83_pr1158

[8.3] take over #1158: Avoid Intel 15 bug in SymmetricTensor

silence test

Workaround: fix compilation with icc and linear_operator

Disables the sfinae lookup in the has_vmult_add helper class for faulty
icc. Intel's compiler up version 15.0.3 run into an sfinae bug otherwise.

For affected compiler versions, has_vmult_add will always report "false"
for icc which will result in a slight performance penalty due to
unnecessary temporary storage.

Update tests for Intel 15

Make error checks more reliable and void == with doubles.

Avoid Intel 15 bug in SymmetricTensor

This should fix broken behavior in deal.II/fe_values_view_{23|24|25} with
Intel 15.0.3, where the compiler sometimes forgets to initialize the static
fields.

Merge pull request #1149 from tjhei/r83_pr1147

[8.3] take over #1147: Bugfix: Do not test for inclusion of config.h in header tests

Bugfix: Do not test for inclusion of config.h in header tests

It turns out that sometimes [1] the testsuite picks up revision.h (and
config.h) as well.

revision.h does not include config.h and the test subsequently fails with
the DEAL_II_NAMESPACE_* not being found. Disable this check for the
revision.h test.

[1] For an in-source build and if an installed deal.II is tested.

update VERSION for release

Merge pull request #1143 from tamiko/remove_blocklinearoperator

[8.3] Remove unfinished BlockLinearOperator class and tests

Documentation: Remove BlockLinearOperator from the glossary

Merge pull request #1145 from tjhei/r83_pr1144

[8.3] take over #1144: Fix name of this file to match our convention

Fix name of this file to match our convention (and the HTML links we
use everywhere).

Remove unfinished BlockLinearOperator class and tests

Merge pull request #1142 from tjhei/r83_pr1141

[8.3] take over #1141: fix references in testsuite.html

fix references in testsuite.html

Merge pull request #1140 from tjhei/r83_pr1135

[8.3] take over #1135: disable cxx11 on clang with libc++ if buggy

disable cxx11 on clang with libc++ if buggy

Merge pull request #1137 from tjhei/r83_remove_steps

[8.3] removed unfinished steps (release tasks step 8)

removed unfinished steps (release tasks step 8).

update AUTHORS

update VERSION

update changes and news for release

Merge pull request #1136 from tjhei/intel_vec

enable auto-vectorization for intel 15

enable auto-vectorization for intel 15

It turns out vectorization is working again (at least with 15.0.3), so
enable it conditionally.

Merge pull request #1130 from bangerth/remove-unnecessary-data-element

Remove storing data we end up not using.

Merge pull request #1133 from tjhei/cmake_fixes

configuration fixes

set template depth on MAC OS

disable cxx14 if cxx11 fails

Finally disable cxx14 if cxx11 detection failed for whatever reason.
Before we could end up in a situation with CXX14=TRUE and CXX11=FALSE
even if nothing was specified during configure time. Running cmake a
second time would then bail out.

Merge pull request #1090 from masterleinad/branch_fix_rotated_periodicity

Arbitrary orientations in parallel::distributed::Triangulation::add_periodicity

Merge pull request #1132 from kronbichler/master

Update documentation

Update documentation

Add tests for periodicity constraints in parallel

Remove storing data we end up not using.

We passed a data element around and stored it in a local class, but
ended up not using it after all. This is likely a leftover from a
previous iteration in the code. In any case, removing the member
variable turns out to compile and test fine, so we don't need to
pass this data to the constructor either.

Allow for arbitrary orientations of faces for periodicity constraints in parallel

Fix smaller errors for rotated periodicity constraints and allow for constraints on the same DoF in this case

Merge pull request #1127 from tjhei/release_step_0

Release step 0

Merge pull request #1123 from tjhei/test_multipleselection

test ParameterHandler::MultipleSelection

update Trilinos docs

./contrib/utilities/update-copyright

bump PETSc version in doc

Merge pull request #1125 from tjhei/cmake_cxx14_variable

set cxx14 cmake variable correctly

Merge pull request #1126 from tjhei/mingw_warnings

boost variadic template warnings

avoid compiler warnings on windows

BOOST no cxx11 warnings

Stop BOOST from trying to use variadic templates when we compile without cxx11
support. This only happens rarely (at least with mingw gcc 5 on windows).

set cxx14 cmake variable correctly

The with_cxx14 flag was incorrectly set as a variable instead of settings the
cached variable. This would cause some weirdness (cached and non-cached
variables of the same name coexist). Before this patch, "DEAL_II_WITH_CXX14 =
OFF" would be printed twice in the feature section.

changelog

fix handling of whitespace in ParameterHandler

No longer remove multiple spaces inside the 'set' expression, but only
at the beginning and end of the lines and before after '='.

add Utilities::trim()

improve documentation

test ParameterHandler::MultipleSelection

Merge pull request #1124 from bangerth/fix-comment

Update a comment.

Update a comment.

Reformatting has destroyed the formatting of this comment and made it
difficult to see what it actually was supposed to mean. That said, I'm
also not entirely clear what exactly the TODO referred to to begin with,
so remove it.

Merge pull request #1121 from simonsticko/EigSortingGMRES

Add sorting to eigenvalues in SolverGMRES

Add sorting to eigenvalues in SolverGMRES

The eigenvalues output through the eigenvalues signals was not sorted
previously. Add sorting according to
internal::SolverGMRES::complex_less_pred.

Merge pull request #1118 from kronbichler/master

Simplify Chebyshev preconditioner setup by using signals

Simplify Chebyshev preconditioner setup by using signals

Merge pull request #1112 from drwells/fix-code-intercalation

Fix code intercalation

Merge pull request #1120 from drwells/update-include-guards-2

Update two more nonstandard include guards.

Update two more nonstandard include guards.

Fix comments on a code sample.
The comments and code were intercalated in an incorrect manner, where
some comments were uncommented and some code was (incorrectly)
commented. I also fixed a small error in the example code (the dof
handler was not associated a triangulation).

Merge pull request #1093 from davydden/MPI_sum_Vector

Utilities::MPI::sum() for Vector<number>

Merge pull request #1111 from bangerth/move-IsBlockMatrix

Move IsBlockMatrix from block_indices.h to constraint_matrix.h.

Merge pull request #1116 from drwells/fix-code-quote-line-split

Correctly format a code quote.

Merge pull request #1115 from drwells/use-tt-not-TT

Consistently use '<tt>', not '<TT>', so show code.

Merge pull request #1114 from drwells/update-include-guards

Update header guard symbols to the new style.

Merge pull request #1113 from drwells/fix-small-typos

Fix some small typos.

Merge pull request #703 from simonsticko/signalsSolverCG

Add signals for retrieving additional data from solver_cg

Correctly format a code quote.

Consistently use '<tt>', not '<TT>', so show code.

Update header guard symbols to the new style.

Fix some small typos.