VectorizedArray: mixed load/store

Merge pull request #14350 from peterrum/iterated_modified_gram_schmidt

Refactor SolverGMRES::modified_gram_schmidt

Refactor SolverGMRES::modified_gram_schmidt

Merge pull request #14348 from drwells/n-face-permutations

Merge pull request #14339 from bangerth/dox-2

Fix some doxygen problems.

Fix some doxygen problems.

Merge pull request #14343 from sebproell/mf-pre-post-loop

MatrixFree pre and post operation for loop()

Implement ReferenceCell::n_face_orientations().

This encodes some previously hard-coded values in FESystem.

Merge pull request #14344 from sebproell/mf-assert-dst-not-ghosted

Merge pull request #14347 from bangerth/semicolon

Remove an unnecessary semicolon.

Remove an unnecessary semicolon.

DoFInfo: Setup pre and post list for faces

MatrixFree pre and post operation for loop()

Merge pull request #14340 from sebproell/field-transfer-ghosted

MatrixFree: add early check for ghosted dst vector

Merge pull request #14345 from gfcas/fix_grid_tools_doc

Fix transform() doc entry

Merge pull request #14341 from kronbichler/fix_check

Fix check for same face type

Merge pull request #14330 from peterrum/gc_memory_consumption

Implement some memory_consumption() functions

MatrixFree face evaluation kernels: Fix check for same face type

Fix bug in FieldTransfer for ghosted vectors

Merge pull request #14335 from bangerth/dox-par

Guard running doxygen in parallel with a version check.

Merge pull request #14336 from bangerth/rename

Merge pull request #14334 from bangerth/dl

Correct a date in a file name in the changelog.

Add a changelog entry.

Run doxygen with threads.

Fix a <dl><dt><dd> type list.

Merge pull request #14329 from peterrum/gc_all_of

Use std::all_of

Merge pull request #14326 from luca-heltai/fix_comments_about_cgal_version

Fix messages about cgal versions

Implement some memory_consumption() functions

Use std::all_of

fix messages about cgal versions

Merge pull request #14325 from luca-heltai/CGAL--adjust_version_intersections

Update required cgal version for intersection routines

Merge pull request #14317 from peterrum/compute_weights_fe_q_dofs_by_entity

Create compute_weights_fe_q_dofs_by_entity()

Update required cgal version for intersection routines

Merge pull request #14304 from drwells/remove-sparsity-pattern-base-1

Remove SparsityPatternBase, for now.

Create compute_weights_fe_q_dofs_by_entity()

Merge pull request #14316 from peterrum/TensorProductMatrixCreator

Add TensorProductMatrixCreator namespace

Remove SparsityPatternBase.

We only have one class which inherits from this (SparsityPattern) and,
since we instantiate templates for each sparsity pattern type, it isn't
possible to do something useful by inheriting from this class.

This was split off from SparsityPattern in
5213023ca165bfbd420423551c184a3e31886223 with the intent of writing some
more general storage classes based on SparsityPatternBase, but that has
never left the proof-of-concept stage.

Remove some references to SparsityPatternBase.

Merge pull request #14305 from mschreter/add_mca_1d

GridTools::MarchingCubeAlgorithm: add 1d implementation

Merge pull request #14314 from kronbichler/reduce_overhead

Reduce organizational overhead/pointer chasing in FEEvaluation/read

Merge pull request #14315 from kronbichler/reduce_potential_aliasing

FEEvaluation::submit_xxx(): Create some local copies to reduce potential aliasing

Merge pull request #14312 from kronbichler/includes_comparator

Restructure includes of FloatingPointComparator

Merge pull request #14320 from tamiko/fix-cgal-clang

CGAL: use dealii's constexpr Utilities::pow instead of std::pow

Add TensorProductMatrixCreator namespace

CGAL: use dealii's constexpr Utilities::pow instead of std::pow

Fixes #14319

Create some local copies to reduce potential aliasing

Reduce organizational overhead/pointer chasing in FEEvaluation/read

Merge pull request #14234 from zjiaqi2018/dof-to-vector-dof-map

Merge pull request #14313 from dangars/dereference_cend

Do not dereference cend

Merge pull request #14308 from tamiko/fix-cgal

CGAL: fix warnings and fix compilation with cgal 5.5

Do not dereference cend

Avoid deferencing cend because it is undefined behaviour.
https://en.cppreference.com/w/cpp/container/vector/end

Merge pull request #14311 from kronbichler/simplify_dof_info

Simplify code in DoFInfo::read_dof_indices

Merge pull request #14310 from kronbichler/shortcut_constraints

Add shortcut to detect whether a DoF is constrained

Merge pull request #14309 from kronbichler/fix_complexity

Fix exponential complexity of FloatingPointComparator with nesting

Restructure includes of FloatingPointComparator

Simplify code in DoFInfo::read_dof_indices

Add shortcut to detection of whether a DoF is constrained

Pass scalars by value and fix a relative tolerance

Fix exponential complexity of FloatingPointComparator with nesting

CGAL: properly declare "namespace PMP"; fixes compilation with cgal 5.5

CGAL: avoid a compiler warning

Avoid an unnecessary copy:

source/cgal/intersections.cc:555:25: note: use reference type to prevent copying
  555 |         for (const auto f : tria_quad.finite_facets())
      |                         ^
      |                         &

Merge pull request #14307 from peterrum/FloatingPointComparator_TriangulationDescription

Use FloatingPointComparator in TriangulationDescription

Use FloatingPointComparator in TriangulationDescription

Merge pull request #14298 from peterrum/FloatingPointComparator_use

Use FloatingPointComparator in TensorProductMatrixSymmetricSumCollection

Use FloatingPointComparator in TensorProductMatrixSymmetricSumCollection

add MCA algorithm for 1d

Merge pull request #14306 from kronbichler/include_header

Add missing header file

Add missing header

Merge pull request #14303 from sebproell/dataout-xdmf-precision

Increase precision of time written in xdmf output

Merge pull request #14301 from kronbichler/update_documentation

Do not mention update_cell_dof_indices_cache in documentation

Do not mention update_cell_dof_indices_cache in documentation

Increase precision of time written in xdmf output

Merge pull request #14299 from kronbichler/fix_test2

Remove reference to update_cell_dof_indices_cache

Merge pull request #14300 from kronbichler/do_not_initialize_table

Do not default initialize projection matrix in GMRES

Merge pull request #14302 from peterrum/weight_fe_q_dofs_by_entity_clean_up

Clean up weight_fe_q_dofs_by_entity

Clean up weight_fe_q_dofs_by_entity

Merge pull request #14296 from peterrum/FloatingPointComparator

Rename FPArrayComparator -> FloatingPointComparator

Do not default initialize projection matrix in GMRES

Remove reference to update_cell_dof_indices_cache

Merge pull request #14246 from bangerth/error

Improve error message.

Merge pull request #14297 from peterrum/TensorProductMatrixSymmetricSumCollection_flat

TensorProductMatrixSymmetricSumCollection: store matrices/vectors flat

address comments

face dof to vector dof

Merge pull request #14236 from tjhei/hdf_empty

support XDMF writing with ranks without cells

Rename FPArrayComparator -> FloatingPointComparator

Introduce a new exception for HDF5.

use correct MPI type

Merge pull request #14068 from kronbichler/eliminate_dof_handler_cache

Remove the cell dof indices cache

Merge pull request #14166 from luca-heltai/cgal-dimension_independent_intersection

TensorProductMatrixSymmetricSumCollection: store matrices/vectors flat

Merge pull request #14183 from zjiaqi2018/fix-3d-half_hyper_shell-manifold

Merge pull request #14294 from peterrum/FPArrayComparator_Number

Remove template parameter from FPArrayComparator

Remove template parameter from FPArrayComparator

Merge pull request #14295 from peterrum/tensor_product_matrix_names

Make variable names in tensor_product_matrix.h more consistent

Merge pull request #14286 from kronbichler/index_owner_streamline

Revise some operations in compute_index_owner_internal

Merge pull request #14293 from peterrum/VectorizedArrayTrait_width_get

Extend VectorizedArrayTrait