Add a changelog entry.

Add test.

Implement ReferenceCell::face_vertex_location().

Merge pull request #14762 from drwells/qprojector-orientation

QProjector: minor orientation fixes.

Merge pull request #14767 from bangerth/cleanups

Minor cleanups in PETSc interfaces.

Merge pull request #14765 from pengfej/fixing_random_number_generator

Minor cleanups in PETSc interfaces.

Specifically, silence a warning about an unused variable. While there,
mark a couple more variables as 'const'.

Update source/base/mu_parser_internal.cc

Co-authored-by: Timo Heister <timo.heister@gmail.com>

indent

Adding tests and fixing comments

Fixing random number generator function parser

Merge pull request #14728 from peterrum/find_all_active_cells_around_point

Fix find_all_active_cells_around_point()

Co-authored-by: Magdalena Schreter <schreter.magdalena@gmail.com>

Merge pull request #14763 from Rombur/static_tests

Don't use static variables in tests

Don't use static variables in tests

QProjector: minor orientation fixes.

Merge pull request #14756 from dealii/dependabot/github_actions/docker/build-push-action-4

Bump docker/build-push-action from 3 to 4

Bump docker/build-push-action from 3 to 4

Bumps [docker/build-push-action](https://github.com/docker/build-push-action) from 3 to 4.
- [Release notes](https://github.com/docker/build-push-action/releases)
- [Commits](https://github.com/docker/build-push-action/compare/v3...v4)

---
updated-dependencies:
- dependency-name: docker/build-push-action
  dependency-type: direct:production
  update-type: version-update:semver-major
...

Signed-off-by: dependabot[bot] <support@github.com>

Merge pull request #14755 from Rombur/kokko_mpi

Add Kokkos::initialize and finalize to MPI_InitFinalize

Add Kokkos::initalize and finalize to MPI_InitFinalize

Remove Kokkos::initialize and finalize

Merge pull request #14753 from masterleinad/kokkos_clean_up

Avoid __CUDA_ARCH__ in source code

Wrap Kokkos::abort

Fix nvcc

ifdef KOKKOS_VERSION -> if KOKKOS_VERSION

Merge pull request #14752 from simonsticko/fix_missing_kokkos_header

Make sure all Kokkos headers are installed

Disable warnings in Kokkos headers

Avoid __CUDA_ARCH__ in source code

Make sure all Kokkos headers are installed

One of the Kokkos headers has a .h extension and not .hpp as the
others. Add *.h to the the pattern of headers we copy over when we
install the library.

Merge pull request #14726 from tamiko/silence_warnings

Merge pull request #14746 from bangerth/thread

Merge pull request #14744 from singima/kinsol_edits

Some edits of the KINSol documentation.

Merge pull request #14747 from marcfehling/doc-setactivefe

Doc: Inform user how to exchange active FE indices on ghost cells.

Doc: Inform user how to exchange active FE indices on ghost cells.

Merge pull request #14745 from drwells/exodus-lines

Make the ExodusII reader work with line types.

Merge pull request #14740 from bangerth/doc-12

Better document CommunicationPatternBase and derived classes.

Remove a BOOST src directory we don't use.

Make ExodusII work with line types.

This is useful for loading codim 1 and codim 2 meshes.

Merge pull request #14741 from bangerth/index-set

Introduce IndexSet::get_index_vector().

Replace deprecated function in tests.

Deprecate a fill function.

Merge pull request #14737 from drwells/default-orientation

Merge pull request #14731 from tamiko/fix_tests_3

Test cgal/cgal_intersect_simplices_1d_3d: constrain to version 5.5 or newer

Merge pull request #14571 from masterleinad/kokkos_la_d_vector_device_aware_mpi

Merge pull request #14743 from tamiko/cmake_improvements_2

Documentation: update to reflect recent CMake changes

Merge pull request #14742 from tamiko/cmake_improvements

CMake: Uniformly raise the minimum required version to 3.13.4

Merge pull request #14738 from tamiko/make_older_cmake_happy

CMake: do not use VERSION for interface targets for older CMake versions

Merge pull request #14739 from masterleinad/strip_x_cuda

Strip "-x cuda" from Trilinos flags without configured Cuda support

doc/users: update to new cmake syntax, update to recent changes

doc/developers: update to new cmake syntax, update to recent changes

update news entry

examples/step-81: depend on deal.II 9.5.0

CMake: Uniformly raise the minimum required version to 3.13.4

Merge pull request #14735 from luca-heltai/stefanozampini/issue-14656

partially address https://github.com/dealii/dealii/issues/14656

CMake: do use VERSION for interface targets for older CMake versions

Use get_index_vector() instead of fill_index_vector().

Strip "-x cuda" from Trilinos flags without configured Cuda support

Add a changelog entry.

Introduce IndexSet::get_index_vector().

Better document CommunicationPatternBase and derived classes.

Add some comments describing our orientation implementation.

Consistently name things 'combined face orientation'.

Un-hardcode some more face and line orientations.

Merge pull request #14685 from luca-heltai/stefanozampini/petsc-precon

PETScWrappers: improve preconditioner class

Merge pull request #14732 from drwells/unhardcode-fe-p-orientation

Un-hardcode some orientation info in FE_SimplexP{_Bubbles}.

Merge pull request #14713 from tamiko/parallelize_tests

CMake: add_test(): allow concurrent runs of tests with shared targets

Merge pull request #14729 from tamiko/fix_tests_1

Test gmsh/gmsh_api_(01|02|03|04): add output variants

Use DEAL_II_CONSTEXPR_IN_CONDITIONAL

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into kokkos_la_d_vector_device_aware_mpi

Merge pull request #14733 from masterleinad/fix_old_kokkos_tests

fix mispells

Improve documentation

rename assign_petsc_matrix/vector to reinit

Fix a couple tests for older Kokkos versions used by Trilinos

Un-hardcode some orientation info in FE_SimplexP{_Bubbles}.

Test cgal/cgal_intersect_simplices_1d_3d: constrain to version 5.5 or newer

The test fails with the following assertion:

--------------------------------------------------------
An error occurred in line <557> of file <source/cgal/intersections.cc> in function [...]
The violated condition was:
    false
Additional information:
    This function requires a version of CGAL greater or equal than 5.5.
--------------------------------------------------------

So, let's simply not run this particular test in this case.

Merge pull request #14508 from tamiko/modernize_cmake_part_11

Test gmsh/gmsh_api_(01|02|03|04): add output variants

It seems that there was a change in more recent versions of gmsh and the
mesh output changed. These output variants seem to be stable among a
number of architectures and linux distributions so I simply commit them.

The output is similar to the main version and seems to be a "superset".
(It looks like older gmsh versions removed unused points ?!)

If we ever start to increase the number of output variants again I
suggest to change the test to ".run_only" and not compare unstable
output.

Merge pull request #14701 from bangerth/explicit

Also mark some variable instantiations as 'extern'.

Merge pull request #14722 from masterleinad/introduce_deal_ii_if_constexpr

Introduce DEAL_II_IF_CONSTEXPR

Merge pull request #14719 from drwells/more-initlog

Use initlog() in more tests.

Merge pull request #14702 from drwells/set-combined-orientation

Set combined orientation

CMake: add_tests(): do not oversubscribe mpi/thread tests

CMake: add_test() remove code duplication

CMake: add_test(): remove compilation interrupt guard

CMake: add_test(): allow concurrent runs of tests with shared targets

In order to make this possible we define an *additional* test (and test
target) that depends on the executable target and ensures that the
target is in place before it is called concurrently.

CMake: add_test(): refactor, add comments, fix error message

CMake: add_test(): refactor shared target boolean

Merge pull request #14602 from luca-heltai/petsc-petscmat-to-dealiimat

PETScWrappers:BlockSparseMatrix: constructor from PETSc Mat

Merge pull request #14709 from drwells/misc-reference-cell

Miscellaneous improvements to ReferenceCell

Merge pull request #14723 from tamiko/silence_configure_warnings

CMake: silence the CMAKE_CXX_EXTENSIONS warning when including Kokkos

Fxi some more whitespaces

Use DEAL_II_IF_CONSTEXPR as attribute

cgal: disable diagnostics when including CGAL headers

This works around a hard to trace compilation warning that can be
triggered in some configurations in CGAL and Boost headers:

In file included from /usr/include/CGAL/Static_filtered_predicate.h:15,
                 from /usr/include/CGAL/Lazy_kernel.h:18,
                 from /usr/include/CGAL/Exact_predicates_exact_constructions_kernel.h:27,
                 from /usr/include/CGAL/Arr_segment_traits_2.h:30,
                 from /usr/include/CGAL/Gps_segment_traits_2.h:20,
                 from /usr/include/CGAL/Boolean_set_operations_2/complement.h:27,
                 from /usr/include/CGAL/Boolean_set_operations_2.h:21,
                 from /srv/temp/dealii/source/cgal/intersections.cc:33:
/usr/include/CGAL/Epic_converter.h: In member function ‘std::pair<CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>, bool> CGAL::Epic_converter<IK>::operator()(const typename IK::Segment_3&) const [with IK = CGAL::Simple_cartesian<CGAL::Interval_nt<false> >]’:
/usr/include/CGAL/Epic_converter.h:305:29: note: ‘<anonymous>’ declared here
  305 |       return std::make_pair(Segment_3(),false);
      |                             ^~~~~~~~~~~

In constructor ‘constexpr std::pair<_T1, _T2>::pair(_U1&&, _U2&&) [with _U1 = CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>; _U2 = bool; typename std::enable_if<(std::_PCC<true, _T1, _T2>::_MoveConstructiblePair<_U1, _U2>() && std::_PCC<true, _T1, _T2>::_ImplicitlyMoveConvertiblePair<_U1, _U2>()), bool>::type <anonymous> = true; _T1 = CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>; _T2 = bool]’,
    inlined from ‘constexpr std::pair<typename std::__strip_reference_wrapper<typename std::decay<_Tp>::type>::__type, typename std::__strip_reference_wrapper<typename std::decay<_Tp2>::type>::__type> std::make_pair(_T1&&, _T2&&) [with _T1 = CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>; _T2 = bool]’ at /usr/lib/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/12/include/g++-v12/bits/stl_pair.h:746:72,
    inlined from ‘std::pair<CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>, bool> CGAL::Epic_converter<IK>::operator()(const typename IK::Segment_3&) const [with IK = CGAL::Simple_cartesian<CGAL::Interval_nt<false> >]’ at /usr/include/CGAL/Epic_converter.h:309:28:
/usr/lib/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/12/include/g++-v12/bits/stl_pair.h:535:11: warning: ‘<anonymous>’ may be used uninitialized [-Wmaybe-uninitialized]
  535 |         : first(std::forward<_U1>(__x)), second(std::forward<_U2>(__y)) { }
      |           ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
/usr/include/CGAL/Epic_converter.h: In member function ‘std::pair<CGAL::Segment_3<CGAL::Epick>, bool> CGAL::Epic_converter<IK>::operator()(const typename IK::Segment_3&) const [with IK = CGAL::Simple_cartesian<CGAL::Interval_nt<false> >]’:
/usr/include/CGAL/Epic_converter.h:309:29: note: ‘<anonymous>’ declared here
  309 |       return std::make_pair(Segment_3(),false);
      |                             ^~~~~~~~~~~

Merge pull request #14724 from tamiko/silence_configure_warnings_2

CMake: Silence a warning about HDF5_ROOT containing NOTFOUND

Convert device-aware MPI implementation for LinearAlgebra::distributed::Vector

Merge pull request #14718 from masterleinad/fix_get_position_vector_test

Add explicit instantiations for VectorTools::get_position_vector overload

Merge pull request #14725 from tamiko/fix_bundled_boost_warning

Boost: apply an upstream patch to silence -Wnonnull warnings

Boost: apply an upstream patch to silence -Wnonnull warnings

This commit applies boost upstream patch:

  From affc79e04514b4cc4177967ced85f7674f3a6642 Mon Sep 17 00:00:00 2001
  From: "Romain Geissler @ Amadeus" <...>
  Date: Thu, 4 Mar 2021 03:23:14 +0100
  Subject: [PATCH] Ignore -Wnonnull new gcc 11 warnings. (#28)