address comments

- rename files

new .inst splitting insolution_transfer.cc

add changelog

move error_estimator code into templates.h

split compilation units

Implement .inst splitting in make_instantiations

Merge pull request #1377 from maieneuro/analytical_hessian_for_fe_poly_tensor

Analytical hessian for fe poly tensor

changed shape hessians in FE_PolyTensor to use analytical instead of numerical differentiation

Merge pull request #1520 from asartori86/prm_preprocess

Allow to use "\" in the file of parameters

allows continuation lines in ParameterHandler

Merge pull request #1524 from Rombur/cxx11_thread_bug

Workaround a bug with Ubuntu 14.04

Merge pull request #1525 from tjhei/sparsity_pattern_docs

update SparsityPattern documentation

update documentation

Workaround a bug with Ubuntu 14.04

Merge pull request #1521 from kronbichler/master

Attempt to fix non-C++11 code path

Attempt to fix non-C++11 code path

Merge pull request #1518 from tamiko/fix_openmp_simd_configuration

CMake: Fix openmp-simd configuration

add news/changes.h entry

CMake: Fix openmp-simd configuration

This enables openmp simd for Clang version 3.6 or newer (and the
corresponding version for XCode). Further, it unconditionally disables
the openmp check for any older clang version - checking for openmp support
with the flag only is unreliable

Merge pull request #1424 from davydden/fe_nothing_dominate

let make_hp_hanging_node_constraints() search for a common space in FECollection

fixed compiler warning in dof_tools_constraints

test make_hanging_node_constraints() with hp-ref and neither_element_dominates

simplified Grid generation in hp_constraints_neither_dominate_01

Also fixed indentation.

extend make_hp_hanging_node_constraints to hp-ref with neither_element_dominates

Remove no more used get_most_dominating_subface_fe_index().
Added an item to changes.h.

fix find_least_face_dominating_fe() for self-domination

test make_hanging_node_constraints() with p-ref and neither_element_dominates

extend make_hanging_node_constraints() to the case neither_element_dominates

Merge pull request #1513 from bangerth/further-FEValues-cleanups-31

Deprecate FEValues::transform().

Merge pull request #1512 from bangerth/further-FEValues-cleanups-30

Provide MappingQ::transform() variants.

Deprecate FEValues::transform().

I don't see the use of this function given that all the
transformations from reference to real cell should actually go
through the Mapping classes directly. The function is also not
used anywhere.

Fixes #1509. In reference to #1198.

Provide MappingQ::transform() variants.

Adding these variants had previously been forgotten.

Merge pull request #1510 from bangerth/further-FEValues-cleanups-29

Further fe values cleanups 29: update Mapping::transform()

Update documentation of Mapping::transform() functions.

Reorder the arguments to Mapping::transform().

Merge pull request #1507 from tjhei/test_fixes

Test fixes

fix compilation error

Type case to make sure the correct reinit() is picked up (not the
template). Error message:
/ssd/deal-git/tests/trilinos/trilinos_sparsity_pattern_03.cc:42:
undefined reference to `void
dealii::TrilinosWrappers::SparsityPattern::reinit<int>(dealii::IndexSet
const&, dealii::IndexSet const&, int const&, int const&, bool)'

do not elide initializer list braces

This fixes the test on intel 15.

Merge pull request #1497 from bangerth/update-step-6

Update the 'possibilities for extensions' section of step-6.

Provide a changelog entry.

Provide more links.

Update the 'possibilities for extensions' section of step-6.

This uses the code example provided by Konstantin Ladutenko.

Update step-6 results section in a few places.

Merge pull request #1506 from bangerth/fix-test-output

Adjust test output.

Adjust test output.

Merge pull request #1505 from tamiko/silence_warnings

CMake: Silence warnings on Mac with XCode prior to 6.3

Merge pull request #1504 from tamiko/fix_compilation

Fixes for commit 5ba5f99, pull request #1312

CMake: Silence warnings on Mac with XCode prior to 6.3

Testsuite: Obey naming convention

Bugfix: Fix syntax error in function.templates.h

Merge pull request #1312 from QiaoLei-88/constFunction

New class ConstantVectorFunction

Merge pull request #1494 from bangerth/squash-warning

Squash warnings.

Merge pull request #1503 from tjhei/simplify_indent_script

simplify indent script

simplify indent script

- find can filter by extension
- xargs does parallel invocation
- fair grouping improves performance

Merge pull request #1502 from tjhei/auto_indent_tests

Auto indent tests

fix indentation

auto-indent code in tests

Merge pull request #1501 from bangerth/fix-test-output

Fix test output.

Fix test output.

Merge pull request #1500 from kronbichler/master

Run astyle over testsuite.

Run astyle over testsuite.

Merge pull request #1499 from tjhei/fix_test_output

fix test output

Merge pull request #1488 from davydden/fe_nothing_dominate_part4

introduced FECollection::find_least_face_dominating_fe(const std::set…

fix test output

Merge pull request #1498 from kronbichler/master

Make test output more robust.

Make test output more robust.

Output the vertex locations for each component separately and put a space between the parenthesis and the numerical output (for numdiff).

introduced FECollection::find_least_face_dominating_fe(const std::set<unsigned int>&) const

Merge pull request #1495 from bangerth/add-tests

Add two tests.

Add tests.

Merge pull request #1484 from davydden/fe_nothing_dominate_part3

introduce a parameter to allow FE_Nothing dominate other FEs

introduce a parameter to allow FE_Nothing dominate other FEs

made other FEs to comply with the new FE_Nothing;
corrected documentation of FE_Nothing::compare_for_face_domination()

Squash warnings.

We previously had warnings about invalid array accesses for dim==1. The
function in question doesn't implement this, but is instantiated anyway.

Merge pull request #1491 from tjhei/hdiv_seminorm

Fix Hdiv_seminorm computation

do not use square of weight for Hdiv_seminorm

The interpretation of weight in integrate_difference is that it scales
the norm not the function being integrated. We therefore need to scale
the components of div u with the square root of the weight.

add changelog

add H1_seminorm to test

Merge pull request #1441 from maieneuro/jacobian_hessian

computing jacobian_2nd_derivative and jacobian_3rd_derivative in mapping classes

Merge pull request #1455 from masterleinad/branch_activate_periodicity_03

Fix Issue 1128 and enable periodicity_03

computing jacobian_2nd_derivative and jacobian_3rd_derivative in mapping classes

Fix Issue 1128 and enable periodicity_03

fix incorrect Hdiv computation

|| u ||_Hdiv
= || div u ||_L2
= sqrt( \int_\Omega (div u)^2 )
= sqrt( \int_\Omega (sum d/dx_i u_i)^2 )
and not
= sqrt( \int_\Omega (sum (d/dx_i u_i)^2) )
which was the old implementation.

remove Exception from Hdiv_seminorm

also add some comments

add test for H1div_seminorm

Merge pull request #1489 from tamiko/add_output_variants

Testsuite: Add output variants for metis and opencascade tests

Merge pull request #1487 from tjhei/readd_affinity_quicktest

Readd affinity quicktest

Testsuite: Add an output variant for opencascade/iges_write

The output format is not stable under round-off errors due to the a forced
line break with line numbering on the right side...

Testsuite: Add output variants for metis tests.

Those are variants for a modern 64bit GNU userland

update affinity test and error message

Report DEAL_II_NUM_THREADS and don't error out if it is set to some
value. This was the reason we removed it in 384d5c6.

Revert "Remove the test affinity.cc."

This reverts commit 384d5c60b376a25c4e7b65b1e4c5364767dd449d.

Merge pull request #1479 from tamiko/testsuite_fixes

Testsuite: Bugfix: Fix mpi tests

Merge pull request #1483 from davydden/fe_nothing_dominate_part2

allow get_most_dominating_fe_index() inside hp::DoFHandler to fail

Merge pull request #1482 from davydden/fe_nothing_dominate_part1

drop Assert in FESystem when neither FE dominate

Merge pull request #1481 from cpraveen/changes-tecplotflags

Update changes.h regarding the update to TecplotFlags in pull request…

Merge pull request #1485 from kronbichler/master

Another non-MPI fix

Another non-MPI fix

make get_most_dominating_fe_index() return invalid_unsigned_int if we can't find the most dominating fe index

made comments wider

drop Assert in FESystem when neither FE dominate

Update changes.h regarding the update to TecplotFlags in pull request #1462

Merge pull request #1480 from tamiko/testsuite_fixes_2

Testsuite: Also adjust location in disctributed_grids and mpi

Testsuite: Also adjust location in disctributed_grids and mpi

We have a small number of tests under distributed_grids/ and mpi/ that read
in external grids from deal.II/ (which is now removed).

Update those references to the new location "../grid/grid_in*".