Allow finding user-installed HDF5

Merge pull request #15121 from masterleinad/cmake_test_link_interface

CMake: Test link interface again

Merge pull request #15147 from kronbichler/matrix_free_diagonal_improve_reinit

MatrixFree diagonal: Avoid repeated computations and binary search

Merge pull request #15146 from bangerth/exc

Document how we deal with errors in call-backs.

Document how we deal with errors in call-backs.

Merge pull request #15151 from luca-heltai/mapping_info_iterators

Allow MappingInfo::reinit_cells() to work on containers

Merge pull request #15150 from luca-heltai/RPE_get_cell_data

Add getter for cell_data in RPE

Allow MappingInfo::reinit_cells() to work on containers

Merge pull request #15149 from luca-heltai/IntroduceMGTwoLevelTransferBase

Introduce `MGTwoLevelTransferBase`

Merge pull request #15155 from bergbauer/fix_integrate_1d

Fix bug in integrate_add_tensor_product_value_and_gradient_linear() for 1d

Merge pull request #15152 from marcfehling/update-bib-authors

Format authors in bibliography.

Merge pull request #15153 from marcfehling/update-bib-journal

Format journals in bibliography.

Return internal cell_data in RPE

second review

Fix bug in integrate_add_tensor_product_value_and_gradient_linear()

Format journals in bibliography.

Format authors in bibliography.

review

Introduce MGTwoLevelTransferBase class

Co-authored-by: peterrum <peterrmuench@gmail.com>

MF diagonal: Avoid repeated computations and binary search

Merge pull request #15135 from kronbichler/improve_compute_diagonal

MatrixFree diagonal: Avoid quadratic complexity & memory allocations

Merge pull request #15145 from marcfehling/update-bib-2

Various changes to bibliography.

Merge pull request #15143 from marcfehling/update-bib

Update bibtex entries of preprints.

Various cosmetic changes to bibliography.

Add articleno to some bibliography entries.

Update bibtex entries of preprints.

Merge pull request #15142 from bangerth/57

Convert step-57 references to bibtex, with proper cross-referencing.

Convert step-57 references to bibtex, with proper cross-referencing.

Merge pull request #15139 from bangerth/glossary

Add necessary include files to a code snippet in the glossary.

Add necessary include files to a code snippet in the glossary.

Merge pull request #15136 from peterrum/remove_assert

MatrixFree diagonal: Avoid quadratic complexity & memory allocations

Remove commented assert

Merge pull request #15133 from luca-heltai/stefanozampini/changelog

Add changelog entry for SNES and TS

Update doc/news/changes/major/20230422StefanoZampini

Co-authored-by: Luca Heltai <luca.heltai@sissa.it>

Add changelog entry for SNES and TS

Minor adaptions to TS and SNES classes

Merge pull request #15131 from bangerth/doxygen-2

More doxygen fixes.

Merge pull request #15129 from bangerth/doxygen

A variety of doxygen fixes.

More doxygen fixes.

A variety of doxygen fixes.

Merge pull request #15130 from marcfehling/assert

Added changelog for #14866.

Merge pull request #15065 from luca-heltai/stefanozampini/snes-only

PETScWrappers: Add support for nonlinear solver

Merge pull request #15127 from bangerth/57

Sort terms so that the bilinear form has ...phi_i * phi_j ... in step-57.

Also test for -fuse-ld=mold

Merge pull request #15051 from bangerth/map

Return objects by value, rather than via a reference.

Merge pull request #15125 from kronbichler/remove_tabulated_shape_functions_mapping_q

Remove tabulated shape functions from MappingQ

Merge pull request #15122 from luca-heltai/fix-parameter-acceptor

ParameterAcceptor now uses a set.

Merge pull request #15126 from luca-heltai/stefanozampini/ts-compat

PETScWrappers::TimeStepper fix backward compatibility to 3.7

Fix #15111. ParameterAcceptor now uses a set.

Added changelog for #14866.

Merge pull request #15118 from luca-heltai/stefanozampini/ksp

PETScWrappers: update KSP support

Also update some commentary.

Sort terms so that the bilinear form has ...phi_i * phi_j ... .

Merge pull request #14866 from marcfehling/assert

Warn users about FE index mismatch instead of silently dropping them.

PETScWrappers::TimeStepper fix backward compatibility to 3.7

Align interface with SNES

PETScWrappers::Solver Bring the class into the new century

PETScWrappers: Add support for nonlinear solver

Merge pull request #15119 from luca-heltai/stefanozampini/compat

Update PETSc compatibility stuff for SNES and TS

Remove tabulated shape functions from MappingQ

New test cases

Merge pull request #14969 from drwells/la-d-vector-move-assign

Implement arbitrary order derivatives for evaluate_tensor_product

Introduce _set_cache_variable

Merge pull request #15120 from bangerth/doc-64

Add an example to the documentation of GridTools::transform().

Merge pull request #15079 from bangerth/windoze

More gracefully deal with Windoze line endings.

Add an example to the documentation of GridTools::transform().

Avoid a problem with doxygen by just not prefixing some class names with dealii::.

Apparently this wasn't necessary anyway because it compiles just fine.

Get rid of old destroy_matrix function

PETScWrappers: Add .cc for compatibility

this is needed when we don't want to spill "petsc/private" headers into user code

Don't set EAL_II_COMPILER_HAS_FUSE_LD_GOLD=false explicitly

CMake: Test link inteface again

Merge pull request #15086 from luca-heltai/stefanozampini/get_mpi_comm_nonref

All get_mpi_communicator methods now return MPI_Comm by value

Merge pull request #15116 from luca-heltai/stefanozampini/block-fixes

block fixes

Avoid call to a deprecated function.

Add a changelog entry.

Deprecate DoFTools functions returning stuff via reference arguments.

Return objects by value, rather than via a reference.

We now have move operators that apply to return objects, along with mandatory
return value optimization. There is no readon not to use this.

This patch applies this to some internal functions. I will write a separate
patch to make this the case for the public interfaces that call these
functions.

Merge pull request #15117 from luca-heltai/stefanozampini/minordocs

PETScWrappers Fix docs for SF classes

Add a changelog entry

Add a test.

More gracefully deal with Windoze line endings.

All get_mpi_communicator methods now return MPI_Comm by value

Make constructors explicit

PETScWrappers Fix docs for SF classes

Merge pull request #15113 from bangerth/nvector

Address the pesky 'MPI_Comm as void*' problem with the SUNDIALS interfaces

Reword docs

PETScWrappers::BlockVector add constructors from arrays of Vecs

PETScWrappers::BlockSparseMatrix unify constructors

add missing test

PETScWrappers: Fix block objects update operations

Merge pull request #15115 from bangerth/69

Fix a class name in step-69 commentary.

Deal with a circular dependency problem.

We can't ask a default-created vector for its MPI communicator
if we only later initialize it.

Make sure block vectors have blocks.

Mark input arguments as 'const'.

Address the pesky 'MPI_Comm as void*' problem with the SUNDIALS interfaces.

Fix a class name in step-69 commentary.

Add a move assignment operator to LA::d::V.

Merge pull request #15083 from olegrog/master

Fix some minor typos

Merge pull request #15013 from bergbauer/vectorized_fe_point

Enable vectorization over quadrature points in whole FEPointEvaluation

Merge pull request #15093 from tamiko/cmake_fix

examples/step-1: undo accidental changes to CMakeLists.txt