Fix size of collection gradient View

Address reviewer's comments

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Remove temporary Kokkos::View

Avoid too many deep_copy during the setup of CUDAWrappers::MatrixFree

Merge pull request #15200 from Rombur/mf_kernel_launch

Merge pull request #15242 from marcfehling/meshworker

More interface mismatch in ScratchData in hp mode.

Merge pull request #15243 from peterrum/typo_2

Fix typo

Fix typo

Fix doc about returning invalid fe indices.

Apply fix to dataype mismatch to all occurences in MeshWorker::ScratchData.

Merge pull request #15235 from masterleinad/fix_tpetra_newer_trilinos

Fix Tpetra for newer Trilinos

Merge pull request #15241 from drwells/fix-arkode

Fix compilation with ARKODE.

Fix compilation with ARKODE.

Also fix a test which doesn't seem to throw an exception with newer
versions of SUNDIALS.

Merge pull request #15223 from bangerth/arkode

Convert ARKode interfaces to conform to our callback policy.

Merge pull request #15229 from kronbichler/avoid_unnecessary_work

MatrixFree: Avoid setting face vectorization group boundary in serial

Avoid setting face vectorization boundary in serial

Add more tests.

Adjust a changelog entry.

Add a test.

Adjust tests to our new interface.

Merge pull request #15238 from bangerth/nox-4

Initialize and check an assertion in the NOX solver.

Convert ARKode interfaces to conform to our callback policy.

Merge pull request #15239 from drwells/pyramid-lines

Fix the number of pyramid lines and one pyramid table.

Merge pull request #15215 from bergbauer/fe_face_point_evaluation

Face path for FEPointEvaluation

Merge pull request #15237 from bangerth/nox-2

Properly treat exceptions in a user callback in NOX.

Fix the number of pyramid lines and one pyramid table.

Merge pull request #15236 from bangerth/nox-1

Minor updates to the NOX solver documentation.

Initialize and check an assertion in the NOX solver.

Properly treat exceptions in a user callback in NOX.

Minor updates to the NOX solver documentation.

Fix Tpetra for newer Trilinos

Implement path for is_face = true

Merge pull request #15230 from masterleinad/fix_patterns_lists_of_lists

Merge pull request #15231 from tjhei/doc_petsc_snes

improve documentation for PETSc SNES

improve documentation for PETSc SNES

Use AssertThrow

Use std::strlen

Merge pull request #15220 from richardschu/compiler_warnings_redo

fix some compiler warnings

Merge pull request #15228 from kronbichler/compile_warning2

Avoid compiler warning

Patterns: Fix parsing lists of lists

Merge pull request #15222 from bangerth/6

Minor doc improvement in step-6.

Avoid compiler warning

Merge pull request #15221 from bangerth/77

Update output of step-77.

fixed some compiler warnings in tria.cc

Merge pull request #15186 from bangerth/nox

Let NOX callbacks conform to our new standard for callback errors.

Merge pull request #15216 from sebproell/sundials-remove-copy

Merge pull request #15199 from masterleinad/find_non_system_hdf5

Allow finding user-installed HDF5

Minor doc improvement in step-6.

Update output of step-77.

Merge pull request #15205 from tamiko/create_compile_commands_symlink

Fix reviewer's comment

Add changelog entry

SUNDIALS: remove outdated copy functionality

Merge pull request #15189 from bangerth/kinsol-3

Add a test with an irrecoverable failure of KINSOL.

Merge pull request #15194 from sebproell/kinsol-nvector-view

KINSOL: do not copy vectors internally

Merge pull request #15214 from sebproell/step-77-nox

Fix step-77 NOX test

Merge pull request #15207 from kronbichler/variable_type

Tensor product kernels: Use the right type in some templated functions

KINSOL: do not copy vectors internally

Add changelog entry for fixed step-77

Fix step-77 with NOX: zero out residual

Merge pull request #15212 from drwells/bundled-kokkos-gcc-13-fix

Fix Kokkos compilation with GCC 13.

Merge pull request #15211 from bergbauer/fe_point_consistent_template_arg

FEPointEvaluation: Use template argument consistently

Merge pull request #15208 from kronbichler/fix_documentation

Fix typo in documentation

Merge pull request #15210 from sebproell/step77-zero-residual

Fix step-77: zero out residual before assembly

Fix Kokkos compilation with GCC 13.

Use template argument consistently

Fix step-77: zero out residual before assembly

Fix typo in documentation

Tensor product kernels: Use the right type in some templated functions

Merge pull request #15196 from bangerth/import-3

Avoid variables named 'import', part 2.

Merge pull request #15191 from bangerth/import

Avoid variables named 'import'.

Merge pull request #15193 from bergbauer/reduce_overhead_fe_face_normal_eval

Remove overhead from AlignedVector in FEFaceNormalEvaluationImpl

add an entry to .gitignore for build directories of example steps

CMake: create a compile_commands.json symlink

Modern IDEs such as VSCode use a separate build directory for
configuring and compiling a project (such as our example steps).

Unfortunately, this sometimes confuses language servers such as clangd
that might fail to find the correct compile_commands.json in that build
directory. Let's work around this issue by simply creating a symlink
from the source directory pointing to the compile_commands.json file.

As a sanity check, if there is already a compile_commands.json file
present, or if the source and build directory are the same we simply do
nothing.

Merge pull request #15206 from masterleinad/fix_warnings_gcc_13_1

Fix warnings with gcc-13.1

Fix warnings with gcc-13.1

Allow finding user-installed HDF5

Use Kokkos to launch kernels in the CUDAWrappers::MatrixFree framework

Merge pull request #15188 from bangerth/kinsol-2

Avoid variables named 'import', part 2.

Merge pull request #15187 from bangerth/kinsol-1

Reduce overhead of AlignedVector

Merge pull request #15141 from peterrum/MGTwoLevelTransferBase

Add two level transfer operator between non-nested levels

Merge pull request #15192 from bangerth/test

Fix compilation of a test.

Fix compilation of a test.

Avoid variables named 'import'.

first part of review

Add interface for non-nested two level transfer

Co-authored-by: peterrum <peterrmuench@gmail.com>

Add a test with an irrecoverable failure of KINSOL.

Clean up after ourselves.

Catch and rethrow *all* exceptions.

Merge pull request #15178 from bangerth/kinsol-exc

Let KINSOL callbacks conform to our new standard for callback errors.

Add a test that checks NOX error handling.

Deal with obnoxious NOX ways of reporting errors.

Convert NOX tests to not return zero to indicate success.

Document what function we are setting up.

Convert NOX to use the new exception scheme.

Merge pull request #15182 from kronbichler/reduce_overhead2

Reduce overhead in calls to tensor product value function

Merge pull request #15159 from tjhei/mpi_comm_by_value

pass MPI_Comm by value