OMPI allow run as root

Checkout code

Run as root user

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Fix GitHub Linux CI

Merge pull request #15267 from bangerth/requires

Add 'requires' clauses for matrix template arguments to PETSc TS and SNES solvers.

Merge pull request #15264 from bangerth/doxygen

Suppress 'requires' clauses for doxygen if doxygen is too old.

Merge pull request #15278 from pcafrica/docker_workflow

Use dealii-dependencies Docker for GitHub workflow

Merge pull request #15261 from jh66637/drop_inexact_kernels

remove inexact CGAL kernels and add test

Use dealii-dependencies Docker image for "linux debug parallel simplex" job

Merge pull request #15263 from bangerth/ida

Convert IDA to use the callback standard.

Merge pull request #15271 from bangerth/petsc-snes

Convert PETSc SNES interfaces to use callback error conventions.

Merge pull request #15269 from bangerth/petsc-ts

Make the PETSc TS interfaces conform to callback conventions.

Merge pull request #14569 from peterrum/tensor_product_matrix_collection_fix_vectorization

Tensor product matrix collection fix vectorization

Merge pull request #15277 from marcfehling/fix-date-format

Fix data format in some changelogs.

Merge pull request #14327 from peterrum/fdm_precompute_inverted_diagonal

Precompute inverse diagonal (FDM)

Merge pull request #15275 from masterleinad/fix_matrix_free_test_no_vectorization

Fix some matrix_free tests without vectorization

TensorProductMatrixSymmetricSumCollection: fix vectorization

Precompute inverse diagonal (FDM)

Fix data format in some changelogs.

Fix some matrix_free tests without vectorization

Remove an unnecessary preprocessor undef.

Remove no longer user preprocessor define.

Add a test that tests PETSc (in)ability to recover from errors.

Add a test.

Convert tests.

Convert PETSc SNES interfaces to callback convention.

Add a test that shows that PETSc TS cannot recover from errors.

Add another test.

Adjust tests.

Make the PETSc TS interfaces conform to callback conventions.

Merge pull request #15268 from marcfehling/test-identity

Identity constraints in h-adapted grids?

Merge pull request #15240 from bergbauer/horizontal_add

Merge pull request #15265 from masterleinad/fix_tpetra_import

Fix TpetraWrappers::Vector import

Added test for identity constraints in h-adapted grids.

Document requirements on PETSc TS and SNES template arguments.

Also check PETSc TS and SNES requirements on matrices.

Introduce concepts for PETSc-based matrices.

Rearrange specializations and implement sum inline

Fix TpetraWrappers::Vector import

Improve docu

Rename to sum()

Suppress 'requires' clauses for doxygen if doxygen is too old.

Add tests for recoverable and irrecoverable situations.

Add a test.

Adjust tests.

Avoid making a variable 'public'.

Convert IDA to use our new callback standard.

Merge pull request #15195 from bangerth/import-2

Avoid the name 'import' as a function name.

drop inexact CGAL kernels

Co-authored-by: Marco Feder <marco.feder@sissa.it>

Add changelog entry.

Re-introduce the now deprecated name.

Merge pull request #15255 from bangerth/gridtools

Simplify a function declaration.

Merge pull request #15252 from tamiko/modernize_configure_2

CMake: introduce copy_target_properties() macro

Avoid the name 'import' as a function name.

CMake: change a warning into an error

For the time being we are not prepared to encounter an undefined target
at this point of the configure process. Thus simply emit a fatal error
instead of a warning.

CMake: try to filter generator expression in copy_target_properties()

As long as the generator expressions are not too complicated we can
simply remove them.

If any of the upstream project starts to use more complex generator
expressions we will at some point have to abandon our approach of
copying target properties.

CMake: add another prominent warning

CMake: fix copy_target_properties() for CMake versions prior to 3.19

CMake: introduce copy_target_properties() macro

This macro is used to copy target properties from imported targets
recursively into our interface targets. This will allow us to modernize
our configure_<feature> macros to use imported targets directly instead
of extracting all of this information for each external feature.

Merge pull request #15250 from Rombur/kokkos_cleanup

Merge pull request #15253 from tamiko/fix_define_interface_target

CMake: multiple fixes for check_compiler_setup()

Merge pull request #15257 from tamiko/fix_shell_escape

CMake: also escape linker flags of the form -Wl,-rpath -Wl,/path/

Merge pull request #15258 from kronbichler/typo_step14

Merge pull request #15244 from bangerth/15

Fix size of collection gradient View

Also link to the discussion from step-77.

Add an idea regarding precision to step-15.

Simplify a function declaration.

Remove a duplicate function definition.

There is a copy in another file, and it is that one that is instantiated.

step-14 tutorial: Fix typo in introduction

Address reviewer's comments

Update cmake/macros/macro_check_compiler_setup.cmake

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

CMake: also escape linker flags of the form -Wl,-rpath -Wl,/path/

Merge pull request #15245 from bangerth/arkode

Avoid making a variable 'public' in the ARKode interfaces.

Merge pull request #15247 from bangerth/arkode-docs

Minor updates to the ARKode documentation.

Merge pull request #15233 from richardschu/remote_point_eval_debug

fix bug in find_active_cell_around_point

Address reviewer's comment

Bugfix: Do not populate DEAL_II_LIBRARIES* variables

We now record dependencies with interface targets. Thus, populating
these variables with redundant libraries is incorrect.

CMake: use full link interface for compiler test

CMake: multiple fixes for check_compiler_setup()

 - use custom build type for test project to avoid auto populated
   compiler flags
 - remove dysfunctional caching mechanism
 - properly escape compile and link options
 - expand interface targets

Use get_lower/get_upper

Use intrinsics for vertical addition

Remove temporary Kokkos::View

Avoid too many deep_copy during the setup of CUDAWrappers::MatrixFree

Remove ctors and assign data directly

Merge pull request #15200 from Rombur/mf_kernel_launch

fix bug in find_active_cell_around_point and add test

Minor updates to the ARKode documentation.

Avoid making a variable 'public'.

Merge pull request #15242 from marcfehling/meshworker

More interface mismatch in ScratchData in hp mode.

Merge pull request #15243 from peterrum/typo_2

Fix typo

Fix typo

Fix doc about returning invalid fe indices.

Apply fix to dataype mismatch to all occurences in MeshWorker::ScratchData.

Merge pull request #15235 from masterleinad/fix_tpetra_newer_trilinos

Fix Tpetra for newer Trilinos

Merge pull request #15241 from drwells/fix-arkode

Fix compilation with ARKODE.

Fix compilation with ARKODE.

Also fix a test which doesn't seem to throw an exception with newer
versions of SUNDIALS.

Merge pull request #15223 from bangerth/arkode

Convert ARKode interfaces to conform to our callback policy.

Horizontal add function for VectorizedArray

Merge pull request #15229 from kronbichler/avoid_unnecessary_work

MatrixFree: Avoid setting face vectorization group boundary in serial