Add Step-68 performance test

Merge pull request #15438 from bangerth/simplify

Simplify some code that uses SolutionTransfer.

Merge pull request #15419 from bangerth/77-3

Minor adjustment to versions of step-77 in the test suite.

Merge pull request #15524 from tamiko/fix_a_test_30

Test: mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: do not compare output

Simplify some code that uses SolutionTransfer.

Test: mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: do not compare output

The parallel partition that we compared in this test depends on metis,
and thus shows different (but valid) output depending on machine,
and chosen optimization level. Let us restrict this test to run only and
not compare the output.

Merge pull request #15416 from bangerth/lambda

Rename a lambda function and make it easier to read.

Merge pull request #15402 from bangerth/add-indices

Optimize IndexSet::add_indices() for the case of duplicate indices.

Merge pull request #15418 from bangerth/sorted

When we know that sparsity pattern entries are sorted, communicate that.

Merge pull request #15417 from bangerth/erase

Standardize on the idiom of calling std::erase after std::unique.

Merge pull request #15443 from bangerth/assert

Add an assertion.

Merge pull request #15513 from masterleinad/fix_cuda_tests

Fix output for matrix_free/matrix_free_device_initialize_vector with CUDA support

Merge pull request #15420 from bangerth/67

Add a version of step-67 that uses PETSc TS time stepping.

Merge pull request #15509 from tamiko/fp_exception_behavior_strict

CMake: enable -ffp-exceptions-behavior=strict when compiling with clang

Merge pull request #15508 from tamiko/update_version_dependencies

Post release branch: require the current version of deal.II

Merge pull request #15507 from tamiko/update_deprecations

Post release branch: switch DEAL_II_DEPRECATED_EARLY over to DEAL_II_DEPRECATED

Merge pull request #15505 from tamiko/update_version

Post release branch: update VERSION on main branch

Fix output for matrix_free/matrix_free_device_initialize_vector with CUDA support

CMake: enable -ffp-exceptions-behavior=strict when compiling with clang

We have to ensure that we emit floating-point instructions in debug mode
that preserve the occurence of floating-point exceptions and don't
introduce new ones. gcc plays nicely in this regard by enabling
`-ftrapping-math` per default, at least for the level of optimization we
have in debug mode. clang however is more aggressive and assumes that it
can optimize code disregarding precise floating-point exception
semantics.

We thus set `-ffp-exceptions-behavior=strict` in debug mode to ensure
that our testsuite doesn't run into false positive floating-point
exceptions. See https://github.com/dealii/dealii/issues/15496

update version dependencies in documentation

update version dependencies in examples

reindent

switch DEAL_II_DEPRECATED_EARLY over to DEAL_II_DEPRECATED

update VERSION

Merge pull request #15503 from tamiko/update-changes-file

Update the changelog file for the release.

fix whitespace

doc: fix typos and use <code> annotation in two places

doc: use https:// instead of http://

doc: update tag file list

Add dummy files.

Remove now obsolete files.

Add a misplaced entry

Update the changelog file for the release.

Merge pull request #15499 from tamiko/bind_to_none

CMake: run_test.sh: ensure to never bind to cores/processors for mpi tests

Merge pull request #15502 from masterleinad/fix_compiling_clang_16_new

Fix compiling with clang-16 and C++20

CMake: run_test.sh: also try to suppress kokkos warnings

CMake: run_test.sh: ensure to never bind to cores/processors for mpi tests

Fix compiling with clang-16

Merge pull request #15500 from tamiko/redemption

Tests: exonerate two debug test variants and run them again

Revert "Test distributed_grids/checkpointing_03: do not run debug variant"

This reverts commit 6b92cdabc142c6b1fc82c16cf7a2cfbe996cd644.

Revert "Test fe/fe_enriched_color_07: do not run debug variant"

This reverts commit 56dd9b490b4e15468969ff4856758ccedb107120.

Merge pull request #15498 from tamiko/update_mailmap

Update .mailmap: a quick update to fix some spelling  e-mail setting mistakes

Update .mailmap: a quick update to fix some spelling  e-mail setting mistakes

Merge pull request #15493 from tamiko/fix_test_20

Test non_matching/step-70: add an output variant

Merge pull request #15494 from masterleinad/require_arborx_1_3

Require ArborX 1.3 or later

Merge pull request #15492 from bangerth/task

Ensure we set a flag correctly even if a task ends in an exception.

Merge pull request #15497 from tamiko/bob/fix_test_21

Test simplex/compute_point_locations_01: add output variant

Merge pull request #15491 from tamiko/fix_test_18

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: add ouput variant

Test simplex/compute_point_locations_01: add output variant

With clang-16 libc++ we get a different order of quadrature points.
Verified manually that - apart from the order - all output quadrature
points match.

Require ArborX 1.3 or later

Test non_matching/step-70: add an output variant

Add an output variant for the case when deal.II is configured with PETSc
support but without Trilinos support.

Add a changelog entry.

Ensure we set a flag correctly even if a task ends in an exception.

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: add ouput variant

Add an output variant for the case when deal.II is configured with PETSc
support but without Trilinos support.

Merge pull request #15488 from tamiko/fix_test_17

Test: cgal/cgal_intersect_simplices_2d_3d: restrict to CGAL >= 5.5.0

Merge pull request #15487 from tamiko/fix_test_16

Test mpi/p4est_bug_01: remove test

Test: cgal/cgal_intersect_simplices_2d_3d: restrict to CGAL >= 5.5.0

Test mpi/p4est_bug_01: remove test

This test needs an external p4est library built with debug symbols,
otherwise it "fails" because we do not error out while running the test
"expect=run".

Let's remove this test for now.

The long standing bug it documents is reported in
  https://github.com/dealii/dealii/issues/7428

See also
  https://github.com/dealii/dealii/issues/9047

Merge pull request #15486 from kronbichler/test_robustness2

MatrixFree inverse mass matrix: Make tests more robust

Merge pull request #15485 from kronbichler/output_variants

Add two output variants for tests writing p4est vtk output

Make tests more robust

Add two output variants for tests writing p4est vtk output

Merge pull request #15481 from tjhei/kinsol-warning

fix kinsol unused lambda capture warning

Merge pull request #15482 from tjhei/unused-var

fix unused variable warning

fix kinsol unused lambda capture warning

fix unused variable warning

Merge pull request #15474 from luca-heltai/stefanozampini/fp-trap

Fixes for FPE and older versions of PETSc

Merge pull request #15477 from tamiko/fix_test_15

Test fe/fe_enriched_color_07: do not run debug variant

Merge pull request #15475 from tamiko/restrict_scalapack_test_variants

Test scalapack/*: restrict all scalapack tests to less than 10 mpi ranks

Merge pull request #15473 from tamiko/fix_test_14

Test mpi/trilinos_step-27: add output variant

Merge pull request #15472 from tamiko/fix_test_13

Test distributed_grids/checkpointing_03: do not run debug variant

Merge pull request #15465 from bangerth/kokkos

Filter out --help from argv when initializing Kokkos

Merge pull request #15471 from tamiko/fix_la_test_02

Test lac/vector_memory_02: add output variant

Merge pull request #15470 from tamiko/fix_la_test

Test: lac/linear_operator_10: disable floating point exceptions

Merge pull request #15469 from tamiko/fix_grid_tools_cache_tests

Test grid/grid_tools_cache_{04,06,08,09}: add output variants

Merge pull request #15468 from tamiko/fix_test_12

Test grid/grid_generator_pipe_junction: add output variant

Merge pull request #15467 from tamiko/fix_cgal_test_02

Test cgal/cgal_triangulation_05: add test variant for clang-16, libc++

Merge pull request #15466 from tamiko/fix_cgal_test

Test cgal/cgal_remesh_surface: disable floating point exceptions

Test fe/fe_enriched_color_07: do not run debug variant

This test is massive (a whopping 2000 lines of code) and regularly times
out on different regression tester variants. Let's restrict it to run in
release mode only.

Test scalapack/*: restrict all scalapack tests to less than 10 mpi ranks

Let us restrict the maximal concurrency of scalapack tests to less than
10 MPI ranks:

 - The purpose of these tests is to test our interfaces to scalapack and
   not whether scalapack functions properly for high(er) MPI
   concurrency. As such testing a few variants with a low number of MPI
   ranks is enough.

 - This cuts down the number of tests in our testsuite that have a
   concurrency of 10 or more from around 225 to around 190.

   The issue with these tests is the fact that we have to block off
   parallel slots in the ctest run equal to the number of MPI ranks.
   Meaning the more tests we have that have a high number of MPI ranks
   the less optimal the scheduling in ctest.

Test mpi/trilinos_step-27: add output variant

With clang and libc++ I get a slightly different adaptive refinement.
Thus add an output variant.

Disable FPE trapping in some tests with older versions of PETSc

Test distributed_grids/checkpointing_03: do not run debug variant

With gcc-13 in debug mode this test can takeup to 10 minutes to
complete. Thus, restict it to release mode where it only takes a couple
of seconds.

Test lac/vector_memory_02: add output variant

Fix warning

catching polymorphic type ‘class dealii::StandardExceptions::ExcFunctionNotProvided’ by value [-Wcatch-value=]

alternative outputs for MACOSX

Some versions of PETSc do not apply Shift if zero!

Test: lac/linear_operator_10: disable floating point exceptions

Test grid/grid_tools_cache_09: add output variants

Test grid/grid_tools_cache_08: add output variant

Test cgal/cgal_remesh_surface: disable floating point exceptions

Test grid/grid_tools_cache_06: add output variant

Test grid/grid_tools_cache_04: add output variant

Test grid/grid_generator_pipe_junction: add output variant

Test cgal/cgal_triangulation_05: add test variant for clang-16, libc++

Use a range-based for loop.

Filter out --help from Kokkos flags.

Minor clean-up to the Kokkos initialization.

Merge pull request #15461 from tamiko/fix_distributed_grids_tests

Test distributed_grids/3d_refinement_08: add output variants

Merge pull request #15462 from tamiko/fix_cgal_test_02

Test cgal/cgal_triangulation_06: disable floating point exceptions