MatrixFree setup: Reduce cost of vector access pattern computation

Merge pull request #15862 from Rombur/hip

Fix issue when compiling with HIP

Update comment

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Merge pull request #15864 from kronbichler/improve_constraints

Making hanging constraints: Reduce number of memory allocation

Merge pull request #15861 from peterrum/gc_vtable

Remove not needed virtual

Fix issue when compiling with HIP

Merge pull request #15859 from kronbichler/simplify

MatrixFree fast hanging node constraints: simplify a check

Remove not needed virtual

Merge pull request #15858 from kronbichler/improve_hanging_nodes

MatrixFree hanging nodes: reduce memory allocations for line setup

Merge pull request #15857 from kronbichler/improve_cell_id_translator

Avoid memory allocation in CellIDTranslator

Simplify a check

MatrixFree hanging nodes: reduce memory allocations for line setup

Avoid memory allocation in CellIDTranslator

Merge pull request #15852 from masterleinad/fix_petsc_complex

Fix compiling with PETSc with complex scalar type

Merge pull request #15849 from stefanozampini/minor-snes

PETScWrappers:Align SNES with TS in comments and Jacobian handling

Merge pull request #15854 from peterrum/non_match_typo

Fix typo

Merge pull request #15853 from tamiko/add_output_variant

Test petsc/petsc_ts_03: add output variant for 3.15.5

Fix typo

Merge pull request #15794 from peterrum/mg_gc_edge_indices

Use MGTransferGlobalCoarsening also for local smoothing

Test petsc/petsc_ts_03: add output variant for 3.15.5

Fix compiling with PETSc with complex scalar type

Merge pull request #15850 from bangerth/iwr

No longer list IWR as the hosting institution.

PETScWrappers:Align SNES with TS in comments and Jacobian handling

Merge pull request #15817 from peterrum/as_dof_handler_level_iterator

Introduce Triangulation::as_dof_handler_level_iterator()

Introduce Triangulation::as_dof_handler_level_iterator()

Merge pull request #15787 from masterleinad/disallow_petsc_without_mpi

Require PETSc to be configured with MPI support

Merge pull request #15801 from bangerth/x3

Make GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole<2>() more robust.

Merge pull request #15816 from peterrum/contains_cell

Introduce Triangulation::contains_cell()

Merge pull request #15845 from luca-heltai/stefanozampini/ts-alternative-output

petsc_ts_03: need to add an output for pre 3.20

need to add an output for pre 3.20

Merge pull request #15841 from peterrum/compute_weights

MGTwoLevelTransfer: remove temporal vector in compute_weights()

Inroduce Triangulation::contains_cell()

Use MGTransferGlobalCoarsening also for local smoothing

MGTwoLevelTransfer: remove temporal vector in compute_weights()

Avoid some uses of GeometryInfo.

Avoid a compiler warning in a test.

Make sure we don't match points on the perimeter of the domain as 'inside'.

Fix a warning in a test.

Merge pull request #15785 from luca-heltai/stefanozampini/ts-resize-and-hooks

PETScWrappers::TimeStepper support resizing while solving

Merge pull request #15829 from drwells/fe-values-split-1

Split fe_values.h and fe_values.cc into three files each.

Merge pull request #15832 from gassmoeller/optimize_step_68

Avoid memory allocations in step 68

Merge pull request #15805 from AbbBallout/VectorFunctionFromTensorFunction_gradient

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Add test functions_08_gradient

Removed value() functions_08_gradient test

Added doc/news/changes/minor/

Update doc/news/changes/minor/20230730AbbasBallout

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>
Update doc/news/changes/minor/20230730AbbasBallout

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>
Update 20230730AbbasBallout doc minor changes

Fix test in base/functions_08_gradient.cc

Split fe_values.h and fe_values.cc into three files each.

In 367243a1614 (PR 15575) I removed SPLIT_INSTANTIATIONS_INDEX et al from
fe_values.cc. This was fine for -O2 but with -O3 -march=native this file now
takes several minutes to compile.

The majority of our compilation time here is in FEValuesViews - ultimately I'd
like to split that up. This commit performs one step towards splitting that up
by splitting up fe_values.h and corresponding source files into files for
FEValuesViews, FEValues, and FEValuesBase.

Merge pull request #15826 from peterrum/fix_test2

Fix a build warning

Avoid memory allocations in step 68

Fix test

Merge pull request #15815 from peterrum/NoncontiguousPartitioner_import_from_ghosted_array

Merge pull request #15822 from peterrum/fix_test

Merge pull request #14976 from peterrum/pack_rtree_of_indices_win

Fix test

Add NoncontiguousPartitioner::import_from_ghosted_array()

Merge pull request #15802 from bangerth/x4

Merge pull request #15811 from peterrum/simplices_find_cell

GridTools::find_active_cell_around_point() and find_all_active_cells_around_point() for simplices

GridTools::find_active_cell_around_point() and find_all_active_cells_around_point() for simplices

Merge pull request #15808 from peterrum/find_all_locally_owned_active_cells_around_point_cache_get_vertex_to_cell_map

Use Cache::get_vertex_to_cell_map() in GT::find_all_locally_owned_act…

PETScWrappers::TimeStepper: use empty function when not knowing how to deal with the exception

PETScWrappers::TimeStepper: make setup_xxx calls private

Use Cache::get_vertex_to_cell_map() in GT::find_all_locally_owned_active_cells_around_point()

Merge pull request #15810 from peterrum/vertex_to_cell_map_check_hn

GT::vertex_to_cell_map(): check if triangulation is locally refined.

implement Wolfgang's comments

Merge pull request #15812 from luca-heltai/fix_hanging_nodes_in_parallel_nnmg

Add constrained entries to partitioner_coarse in NonNestedMG

Merge pull request #15649 from pcafrica/serialization_test

Test serialization for serial and shared triangulations

GT::vertex_to_cell_map(): check if tria has hn

Move create_coarse_partitioner to public

Merge pull request #15809 from peterrum/use_create_extended

Use BB::create_extended()

Add warning to pack_rtree_of_indices()

Add test with locally refined distributed grids

Add constrained DoFs to locally relevant DoFs in non-nested MG

Use BB::create_extended()

Merge pull request #15752 from peterrum/gc_init_MGConstrainedDoFs

MGTransferGlobalCoarsening: initialize with MGConstrainedDoFs

MGTransferGlobalCoarsening: initialize with MGConstrainedDoFs

Merge pull request #15793 from peterrum/interpolate_to_mg_zero

`MGTransferMF::interpolate_to_mg()`: zero out ghost values

Make GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole<2>() more robust.

Merge pull request #15800 from peterrum/ac_warning

AffineConstraints: fix warnings

MGTransferMF::interpolate_to_mg(): zero out ghost values

Merge pull request #15799 from masterleinad/restrict_trilinos_sparse_matrix_mmult_01

trilinos_sparse_matrix_mmult needs EpetraExt

Merge pull request #15797 from peterrum/add_mg_data_vector

DataOut::add_mg_data_vector(): copy vector and update ghost values

Adjust expectations in a function.

AffineConstraints: fix warnings

Merge pull request #15798 from masterleinad/fix_block_vector_vector_assign

Fix block_vector_vector_assign

trilinos_sparse_matrix_mmult needs EpetraExt

Fix [complex_]block_vector_vector_assign

Merge pull request #15795 from bangerth/x2

Minor addition to the documentation of a GridTools function.

Merge pull request #15796 from bangerth/x1

Simplify code using structured bindings.

Remove VectorHelper

DataOut::add_mg_data_vector(): copy vector and update ghost values

Merge pull request #15792 from peterrum/mg_level_object_clear

Add MGLevelObject::clear()

Minor addition to the documentation of a GridTools function.

Simplify code using structured bindings.

Add MGLevelObject::clear()

Merge pull request #15791 from masterleinad/fix_timing_step_37

Fix timing_step_37.cc

Fix timing_step_37.cc

Merge pull request #15784 from peterrum/MGTransferMG

Replace MGTransferMG usages in tests/matrix_free

PETScWrappers::TimeStepper: add missing tests for callbacks

PETScWrappers::TimeStepper: cannot change the pointers to the matrices

use MatCopy instead (just to make sure....)

PETScWrappers::TimeStepper: Fix for older versions of PETSc

Require PETSc to be configured with MPI support