Also include HTML files when updating copyright years.

Merge pull request #2971 from drwells/fix-test-matrix-tests

Move testmatrix.h in the remaining tests.

Move testmatrix.h in the remaining tests.

This commit finishes the work started in bea2270a943, where
tests/lac/testmatrix.h was renamed to tests/testmatrix.h.

Merge pull request #2963 from tjhei/petsc_reinit_prec

Allow PETScWrappers::Precondition* re-init

update

Merge pull request #2967 from tjhei/move_tests_sparsity

move sparsity tests into separate folder

Merge pull request #2968 from tjhei/typo_1

typo fix

typo fix

move sparsity tests into separate folder

Merge pull request #2950 from bangerth/convert-symmetrictensor-to-tensor

Implement the conversion of a SymmetricTensor<4,dim> to Tensor<4,dim>.

Merge pull request #2965 from drwells/add-missing-error-code-asserts

Add some missing error code asserts.

Merge pull request #2964 from drwells/use-more-const-references

Prefer const reference to const value.

Merge pull request #2962 from drwells/redo-epsflagsbase-assignment

Don't possibly dereference a null pointer.

Merge pull request #2961 from drwells/rewrite-mpi-check

Rearrange some MPI ifdefs to make cppcheck happy.

Allow PETScWrappers::Precondition* re-init

This PR allows re-using a preconditioner object by calling initialize()
more than once. Update documentation while we are here.

Merge pull request #2956 from tjhei/remove_compressed_sp

Remove compressed SparsityPattern classes

Rearrange some MPI ifdefs to make cppcheck happy.

Don't possibly dereference a null pointer.

Since this code checks that the dimension really is not 1 we can get rid
of this case, which would result in an ill-formed reference.

remove duplicate tests

Add some missing error code asserts.

These were caught by cppcheck.

Prefer const reference to const value.

These were caught by cppcheck.

Merge pull request #2945 from bangerth/convert-pointers-to-unique-ptrs

Convert Triangulation members from pointers to unique_ptrs.

Merge pull request #2959 from bangerth/fix-test

Fix a test by not using a C++11 statement GCC 4.6 balks at.

Fix a test by not using a C++11 statement GCC 4.6 balks at.

Adjust test outputs.

Convert two more members of Triangulation from raw pointers to std_cxx11::unique_ptrs.

Convert Triangulation::faces from a raw pointer to a std_cxx11::unique_ptr.

Allow (de)serialization of std_cxx11::unique_ptrs also in C++98 mode.

This just requires forwarding to the corresponding functions for the
boost::scoped_ptr class.

Merge pull request #2957 from drwells/remove-unused-variables

Remove some unused variables.

Remove some unused variables.

These were found by cppcheck.

changelog

rephrase tutorial

update documentation

fix test output

update/delete/rename tests

remove CompressedSparsityPattern classes

[Block]Compressed*SparsityPattern classed got deprecated in March 2015
for DynamicSparsityPattern. Remove them and corresponding tests.

Merge pull request #2954 from drwells/remove-duplicated-tests

Remove duplicated tests.

Merge pull request #2953 from drwells/split-tests/bits-05

Move all FullMatrix tests into tests/full_matrix/.

Remove duplicated tests.

These tests are complete duplicates (exact same source and output file)
of other tests. I found them by running

    $ md5sum tests/*/*cc | awk '{print $1}' | sort | uniq -d
    0be8a61d11d01d793df126ad14932c6e
    5c1929a43e16b989065ae8d325c29136
    6587df713735d2c99f43cc2212550ed4
    97de58c85ba5c0b00905a8d402712381
    9ca74160ee9756c6e64b475c9539c239
    c42ec6af54ccc4af92035a3a9a078830
    c8c0be1052e2f6f64bbaa36b7ebe8d95
    e200c88ddc7bbb442d760a1be01a6a1d
    ea545bb72f77c0f4ac7133479340f92e

and then, for each particular MD5sum, running something like

    $ md5sum */*cc | grep 0be8a61

to locate the tests. For the sake of record, here are the (formerly)
duplicated tests:

0be8a61d11d01d793df126ad14932c6e
grid/grid_in_gmsh_02: same as grid/grid_in_gmsh_01

5c1929a43e16b989065ae8d325c29136
bits/chunk_sparse_matrix_03b: same as bits/chunk_sparse_matrix_03a

6587df713735d2c99f43cc2212550ed4
grid/have_same_coarse_mesh_04: same as grid/have_same_coarse_mesh_02

97de58c85ba5c0b00905a8d402712381
bits/sparse_matrix_03b : same as bits/sparse_matrix_03a

9ca74160ee9756c6e64b475c9539c239
dofs/accessor_02: same as dofs/accessor_01

c42ec6af54ccc4af92035a3a9a078830
grid/get_finest_common_cells_04 : same as grid/get_finest_common_cells_02

c8c0be1052e2f6f64bbaa36b7ebe8d95
grid/grid_out_05: same as grid/grid_out_03

e200c88ddc7bbb442d760a1be01a6a1d
bits/fe_field_function_vector_03: same as bits/fe_field_function_03

ea545bb72f77c0f4ac7133479340f92e
manifold/tria_accessor_point_03: same as manifold/tria_accessor_point_02

Move all FullMatrix tests into tests/full_matrix/.

We have, at the time of writing this, 177 distinct full matrix tests, so
it is worth making a directory just for them.

Merge pull request #2949 from bangerth/dont-use-nothrow

No longer use 'throw()', use 'noexcept' instead.

Add a changelog entry about deprecated language features.

Use DEAL_II_NOEXCEPT instead of 'throw()'.

Merge pull request #2952 from bangerth/disable-test-without-metis

Disable a test that requires METIS if not configured with METIS.

Disable a test that requires METIS if not configured with METIS.

Add changelog entry.

Add test.

Implement the conversion of a SymmetricTensor<4,dim> to Tensor<4,dim>.

Introduce a way to say throw()/noexcept generically.

This is necessary because newer C++ standards deprecate 'throw()', but
older ones do not support the more modern replacement 'noexcept'.

Merge pull request #2946 from davydden/fix/gmg_coarse_smoother

fix a SmartPointer bug in MGCoarseGridApplySmoother

fix a SmartPointer bug in MGCoarseGridApplySmoother

Merge pull request #2936 from class4kayaker/MGLO_clear_entry

Update changes.h for MGLevelObject::clear() change

Merge pull request #2942 from drwells/improve-indentation-script

[WIP] Use an explicit suffix on unindented backup files.

Merge pull request #2943 from tjhei/add_newlines

add newlines at end of files

add newlines at end of files

Merge pull request #2938 from davydden/feature/gmg_coarse_smoother

GMG: coarse smoother and linear operator

Merge pull request #2941 from bangerth/fix-signature-of-rand

Fix signature of our rand/srand implementations.

minor fixes in GMG unit tests

Use an explicit suffix on unindented backup files.

Merge pull request #2769 from danshapero/tria-move

Move constructor for Triangulation

Added move constructor to Triangulation

Fix signature of our rand/srand implementations.

Since these are functions in our own namespace -- that happen to have the
same names as ones in the std:: namespace, but really independent -- there
is no reason not to use our own conventions. Specifically:
- make input arguments 'const'
- remove the deprecated 'throw()' specification.

minor fixes in doxygen of MGCoarseGridApplySmoother

Update changes.h for MGLevelObject::clear() change

Merge pull request #2939 from drwells/fix-compilation-without-trilinos

Fix compilation without Trilinos.

Merge pull request #2909 from tjhei/integrator_divergence

Extend LocalIntegrators::divergence and LocalIntegrators::GradDiv

Fix compilation without Trilinos.

an entry in changes.h

GMG: add MGCoarseGridPreconditioner to apply a few steps of smoother at the coarse level

Merge pull request #2933 from loylick/bugfix

Fixed linker error under VS2013, moved definition of format_version v…

Added const modifier to format_version variable.

changelog

deprecate functions, simplify code, cleanup

- cleanup
- update tests
- deprecate some functions
- simplify code

grad-div residuals added and tested for consistency
grad-div removed from file divergence.h

add divergence integrators

GMG: make it possible to use as a LinearOperator

Merge pull request #2922 from class4kayaker/deprecate_MGL_clear

Rename and deprecate MGLevelObject::clear()

Merge pull request #2908 from tjhei/parallel_block_relaxation

Implement parallel GMG block relaxation

implement parallel RelaxationBlock

- use a ghosted vector in RelaxationBlock
- introduce VectorType in base class RelaxationBlock
- update test for parallel RelaxationBlock
- add documentation

parallel RelaxationBlock

- template RelaxationBlock::step on vector type
- instantiate for Trilinos
- add test

Merge pull request #2930 from drwells/update-default-constructor-explanation

Redo the explanation of a default constructor.

Fixed linker error under VS2013, moved definition of format_version varible from a header to cc file.

Merge pull request #2932 from davydden/fix/parpack_warning

parpack: fix compiler warning

parpack: fix compiler warning

Merge pull request #2931 from masterleinad/cleanup_step56

Remove ununsed class BoundaryValuesForVelocity in step-56

Remove ununsed class BoundaryValuesForVelocity

Merge pull request #2924 from class4kayaker/fix_deprec_examples

Replace deprecated MGConstrainedDoFs::initialize in examples

Redo the explanation of a default constructor.

clang 3.8 requires this default constructor be present in 98, 11, or 14
modes, which does techically follow the standard (section 8.5).

Merge pull request #2925 from drwells/fix-tests-with-bind

Fix some small test issues with std_cxx11::bind.

Merge pull request #2926 from drwells/fix-sphericalmanifold-test

Fix a SphericalManifold test

Adjust documentation for MGConstrainedDoFs::initialize() deprecation

Replace deprecated MGConstrainedDoFs::initialize in examples

Merge pull request #2928 from tjhei/indent_inst_files

Indent .inst.in files using astyle

indent all files

run astyle .inst.in files

Merge pull request #2927 from drwells/split-tests/bits-04

Move all DataOut tests into numerics.

Move all DataOut tests into numerics.

Some of these tests were already there, but most of them were in
tests/bits.

Fix merge conflicts in SphericalManifold tests.

Enable compilation of a test in C++03 mode.

Fix some small test issues with std_cxx11::bind.