Fixed an issue with Utilities::int_to_string.
It cannot handle more than ten digits in its current form, so I wrote a
simple wrapper around boost::lexical_cast.

Merge pull request #402 from bangerth/remove-deprecated-functions

Remove deprecated functions after 8.2 release

Merge pull request #405 from tamiko/port_to_cmake_3.1

This series of commits resolve a bunch of issues with CMake 3.1 along with

Add an entry to changes.h

CMake: Build up library name directly

The LOCATION property is deprecated starting with CMake 3.0. Further it
leads to an astonishing bug if used in CMake 3.1 [1]. Thus, we have to
build up the library name by hand.

[1] http://public.kitware.com/Bug/view.php?id=15338

CMake: Use a global property to store object targets

CMake: Explicitly set all policies to new behavior

We support all CMake policies up to version 3.1.0 . Thus, set them to new
behavior.

Merge pull request #400 from tamiko/add_revision_information

Query git branch and commit during configure

Merge pull request #404 from bangerth/update-step-43

Fix two oversights in the step-43 code.

Remove some left-over debug statement.

This program does not use MPI. Don't pretend that we do.

Update changelog.

Remove deprecated function MGConstrainedDoFs::at_refinement_edge_boundary.

Remove deprecated function MGConstrainedDoFs::non_refinement_edge_index.

Remove deprecated class BlockList.

Remove deprecated GridOutFlags::XFig::level_color.

Remove deprecated variant of DoFTools::make_sparsity_pattern with a vector-of-vector mask.

Remove deprecated variant of DoFTools::count_dofs_per_component.

Remove deprecated function DoFRenumbering::downstream_dg.

Remove deprecated function DataOutBase::write_hdf5_parallel.

Remove deprecated function Algorithms::ThetaTimestepping::initialize.

Remove deprecated functions FunctionParser::initialize().

Remove deprecated function Newton::initialize().

Remove deprecated function ThetaTimestepping::operator().

Remove deprecated function DataOutBase::create_xdmf_entry.

Remove deprecated function GridGenerator::parallelogram with a rank-2 tensor for the corners.

Remove deprecated function GridGenerator::laplace_transformation. Move the implementation to its new home in GridTools.

Remove deprecated classes Threads::ThreadCondition and Threads::ThreadMutex.

Remove deprecated functions Threads::new_thread.

Remove deprecated functions MeshWorker::loop and MeshWorker::integration_loop.

Now that we no longer take a VectorMemory object as argument, simplify the functioning of the MGSmoother class and its derivatives.

Remove deprecated constructors of MGSmoother* classes that take VectorMemory objects as arguments.

Add changelog entries for each deprecated function.

Remove deprecated function DataPostprocessor::compute_derived_quantities_*.

Reindent a few lines.

Remove deprecated function PointValueHistory::mark_locations().

Remove deprecated function TimeDependent::end_sweep with an argument.

Add a revision.h header file that exports git branch and revision for
compile time usage in user projects

Testsuite: Do not write revision.log, this is now done in setup_git.cmake

CMake: Print commit in summary.log and detailed.log

CMake: Query branch and commit during configure

Merge pull request #399 from bangerth/remove-svn-date-tags

Remove svn date tags

No need any more to deal with dollar signs in the form of $Date:$ etc that
date back to svn times.

No need to exclude '.svn' directories any more, now that we don't use svn any more.

Merge pull request #398 from tamiko/handle_version_subminor

CMake: Also handle subminor version number

CMake: Also handle subminor version number

CMake now correctly queries the DEAL_II_PACKAGE_VERSION string for a
subminor version replacing "pre" and "rc?" by "0". The subminor version
number is also exported in the project configuration and the config.h
header file.

git no longer expands $DATE$ tags, so remove it from the footer of various HTML pages. While there, also remove other information that does not really contribute any information now that everyone is using these pages online, rather than from local installations.

git no longer expands $DATE$ tags, so do not attempt to put them into HTML <meta> tags.

Merge pull request #397 from tamiko/improve_cmake_output

CMake: Unify configure output, print all file inclusion

CMake: Unify configure output, print all file inclusions

Merge pull request #396 from kronbichler/master

Fix definition of syev method. Correct ifdef guard.

Fix definition of syev method. Correct ifdef guard.

This avoids compiler errors with clang 3.5.

Merge pull request #385 from tamiko/guard_have_macros

Replace HAVE_* by DEAL_II_HAVE_*

Merge pull request #394 from tjhei/simplify_cast

simplify cast

simplify cast

Merge pull request #390 from bangerth/fix-missing-instantiations-2

Add changes.h entry

Merge pull request #395 from tjhei/wrap_comments_improvements

wrapcomments paren handling

wrapcomments paren handling

Correctly handle an opening parenthesis directly in front of @ref and
fix the one place we use it.

Fix missing instantiations.

fix a comment

Add an entry to changes.h

Guard HAVE_* variables and definitions with DEALI_II prefix

This commits renames every HAVE_* definitions to DEAL_II_HAVE_*. This is
done to avoid name clashes with external projects also exporting HAVE_*
definitions.

Merge pull request #388 from bangerth/fix-missing-instantiations

Fix missing instantiations.

Fix missing instantiations.

Merge pull request #386 from tamiko/cmake_fixes

Small cmake configuration and documentation fixes

add changes.h entry

Update documentation of DEAL_II_WITH_* lists, and testsuite configuration

remove obsolete functionparser definitions

Add an additional hint for opencascade

Merge pull request #383 from tamiko/fix_error_message

step-34: Also adjust error message

step-34: Also adjust error message

Merge pull request #382 from tamiko/restructure_file

CMake: Restructure configuration file

CMake: Restructure configuration file

Merge pull request #381 from tjhei/wrapcomments_part_two

wrapcomments.py @ref handling

wrapcomments on all files

manually reformat some files

fix typo in step-52

better @ref handling

Correctly handle @ref in the wrapcomments.py script. We need to keep the
description in quotes in one line and move everything else to the next line
except immediate punctuation.

Merge pull request #378 from luca-heltai/another-fix-to-cpack

Now also cached variables for cpack config have CPACK prefix.

Merge pull request #379 from tjhei/doxygen_wrapcomments_fixes

Doxygen wrapcomments fixes

fixup files

more fixup

format everything

fix warpcomments.py

fix up more files

fix more files

force @ref in separate line

put @ref in separate line

remove stray comment

update wrapcomments.py

now handle @image tags correctly

fix doxygen formatting

reformat a couple of places in the doxygen comments manually (broken
@image lines etc.). This is mostly to make wrapcomments.py happy.

Now also cached variables have CPACK prefix.

Merge pull request #377 from tjhei/solution_transfer_msg

improve SolutionTransfer exception

Merge pull request #376 from tjhei/export_ignores

add .gitattributes

improve SolutionTransfer exception

parallel::distributed::SolutionTransfer only works with parallel::distributed::Triangulation. This is now checked in the constructor.

add .gitattributes

we ignore the testsuite and some other files when creating a tarball
with git archive. This is also used by github for 'releases'.

Merge pull request #374 from tamiko/update_normalize_script

update normalize script

update normalize script

Merge pull request #372 from tamiko/fix_step34

fix configuration for step-34

fix configuration for step-34