generate changes.h in binary dir

closes #4102

Merge pull request #4193 from tamiko/cmake_check_for_zlib_8.5

[8.5] CMake: Also check for enabled zlib support in p4est

CMake: Also check for enabled zlib support in p4est

Even though we might not necessarily use zlib compression in p4est
output at all, p4est might silently fail if zlib support is disabled.

Work around this issue by always requiring a p4est installation with
enabled zlib support.

Closes #4151

Merge pull request #4181 from tjhei/r_8_5_pr_4180

[8.5] take over #4180: add step-57 DOI

add step-57 DOI

Merge pull request #4179 from jppelteret/r_8_5-pr_4174

[8.5] take over #4174: Add DOI citation to step-44

Merge pull request #4178 from jppelteret/r_8_5-pr_4145

[8.5] take over #4145: add @dealiiTutorialDOI{} macro for tutorial programs

Add DOI citation to step-44

add @dealiiTutorialDOI{} macro for tutorial programs

Merge pull request #4177 from tjhei/r_8_5_pr4173

[8.5] take over #4173: change MathJax CDN

change MathJax CDN

https://cdn.mathjax.org is shutting down, so switch to the recommended alternative CDN.

Fixes #4169

Merge pull request #4159 from tamiko/pr_4157-8.5

[8.5] CMake: Workaround: Ensure "mpiuni/mpi.h" is reachable

Merge pull request #4166 from masterleinad/restrict_parallel_petsc_8_5

[8.5] take over #4165: Restrict tests requiring a parallel PETSc

Restrict tests requiring a parallel PETSc

CMake: Workaround: Ensure "mpiuni/mpi.h" is reachable

In case of a sequential build without mpi support and sequential petsc a
dummy mpi.h file installed by petsc must be reachable in from our final
set of include directories.

Normally this is not an issue - petsc exports such information in the
file "petscvariables" that we parse. But some distributions have chosen
to not install this file...

Closes #4157

Merge pull request #4164 from masterleinad/take_over_4156

[8.5] take over #4156: fix cmake regex for finding MPI version

fix cmake regex for finding MPI version

cmake regex is greedy, which means that the old regex
MPI_VERSION.*([0-9]+)
would only put the last digit of the version into the group \1 because
.* consumes the others. Fix this.

Merge pull request #4161 from tamiko/pr_4160-8.5

[8.5] Examples: Require MPI for step-18

Merge pull request #4154 from tjhei/r_8_5_pr4152

[8.5] take over #4152: fix step-55

Examples: Require MPI for step-18

fix step-55

This causes crashes with PETSc and solver convergence issues with
Trilinos with more than one rank.

Merge pull request #4148 from tamiko/cmake_2.8.8_compatibility

CMake: Compatibility with 2.8.8, do not build examples per default

CMake: Default to not building examples

CMake: Bugfix: Ensure compatibility with cmake-2.8.8

Merge pull request #4144 from kronbichler/take_over_documentation

[8.5] Take over #4138: Update documentation of FEEvaluation

Update documentation of FEEvaluation

Merge pull request #4137 from drwells/fix-double-angle-bracket

Convert a template '>>' to a '> >'.

Convert a template '>>' to a '> >'.

Merge pull request #4136 from masterleinad/takeover_astyle

[8.5] take over #4125: Update documentation on location of astyle.rc.

Merge pull request #4135 from masterleinad/takeover_abf_03

[8.5] take over #4134: Fix test on some platforms

Update documentation on location of astyle.rc.

Fix test on some platforms

Merge pull request #4132 from drwells/fix-quick-tests-8.5

[8.5] take over #4131: Remove tests.h dependency from the quick tests.

Remove tests.h dependency from the quick tests.

The release candidates ship without this file.

Merge pull request #4129 from drwells/add-user-version-flag

Always add the user version flag.

Merge pull request #4130 from tjhei/r_8_5_pr4127

[8.5] take over #4127: Fix bug in matrix-free evaluation kernel for degree 9 in 2D

Make the stack size selection a single parameter

Fix bug in matrix-free evaluation kernel for degree 9 in 2D

Always add the user version flag.

This gets around a bug where, if a user requests '-std=c++03' and is using a
compiler which defaults to C++11 or newer (e.g., GCC 6) then the library is
compiled with the default language flag (e.g., gnu++14) but
DEAL_II_WITH_CXX11=OFF: this causes compilation errors with boost::optional.

Merge pull request #4124 from tjhei/r_8_5_pr4122

[8.5] take over #4122: Avoid multiple deprecation warnings in steps

fix step-41 warning

Avoid multigrid deprecation warnings in step-16/39

Merge pull request #4121 from tjhei/p8.5-doxygen

[8.5] fix doxygen errors

fix doxygen errors

Merge pull request #4118 from tamiko/remove_cuda

[8.5] CMake: Remove CUDA feature

CMake: Remove CUDA feature

Merge pull request #4116 from bangerth/fix-abf-02

Fix FE_ABF::convert_generalized_support_point_values_to_nodal_values

Fix FE_ABF::convert_generalized_support_point_values_to_nodal_values

removed unfinished steps (release tasks step 8).

add AUTHORS

Merge pull request #4112 from tjhei/r85_pr4108

[for 8.5] take over #4108: Make sure to clean all data before filling MG transfer data fields

Make sure to clean all data before filling MG transfer data fields

update VERSION

Merge pull request #4099 from tjhei/doxygen_fixes

8.5 task: doxygen formatting fixes

Merge pull request #4100 from tjhei/tag_filename

8.5 task: update TAG file URL

address comment

Merge pull request #4098 from bangerth/update-changes-file

Replace individual files by one changelog for the whole release.

Adjust for the upcoming release.

Remove now obsolete files.

Update the changelog file for the release.

Merge pull request #4101 from bangerth/update-copyright

Update copyright years.

Update copyright years.

8.5 task: update TAG file URL

Merge pull request #4097 from masterleinad/check_cell_loop

Check array access in MatrixFree::cell_loop

doxygen formatting fixes

- wrong indentation
- code blocks not marked correctly
- some @ref fixes

Check array access in MatrixFree::cell_loop

Merge pull request #4096 from kronbichler/fix_clang_warning_mapping

Fix warning with clang compiler

Merge pull request #4064 from bangerth/replace-FE_interpolate

Replace FE::interpolate() by FE::convert_support_point_values_to_nodal_values().

Add warning with clang compiler

Merge pull request #3886 from kronbichler/master

Fix support points on quad for MappingQGeneric and StraightBoundary.

Merge pull request #4094 from masterleinad/fix_indexset_asc_etc

Refactor and fix IndexSet::is_ascending_and_one_to_one

Merge pull request #4095 from masterleinad/fix_sparsity_compress

Check access in SparsityPatter::compress()

Merge pull request #4091 from tamiko/opencascade_compatibility

Opencascade 7 fixes

Work on review comments

Performance improvements. Augment documentation.

Fixed closest_point_to_shape.

Fixed circle_normal_projection.

Check access in SparsityPatter::compress()

Refactor and fix IndexSet::is_ascending_ad_one_to_one

CMake: Add TKSTEP209 to the opencascade link interface

tests/opencascade: Fix two tests

Add a changes.h entry

CMake: Extract opencascade version in a more robust manner

Opencascade: Add an include for version 7 compatibility

Opencascade: Bugfix. Call Handle macro in a compatible fashion

Opencascade: Fix includes for version 7

CMake: Add include/opencascade to include path alternatives

Merge pull request #4086 from bangerth/improve-exception

Improve the wording of an exception.

Merge pull request #4087 from bangerth/update-reference

Update the reference to a paper that has been accepted.

Update the reference to a paper that has been accepted.

Improve the wording of an exception.

Rename variables in a function.

Match variable names at a calling site to the ones used in the called function.

Use FE::convert_generalized_support_point_values_to_nodal_values().

Implement the new FiniteElement::convert_generalized_support_point_values_to_nodal_values interface.

This is easily done by copying the implementation of the
existing FiniteElement::interpolate() functions in the
various derived classes, removing the 'offset' argument,
and reordering+renaming the other two arguments.

Introduce FiniteElement::convert_generalized_support_point_values_to_nodal_values.

Merge pull request #4082 from masterleinad/restrict_lapackfmprint

Restrict LAPACKFullMatrix::print_formatted to matrix states

Restrict LAPACKFullMatrix::print_formatted to matrix states

Merge pull request #4080 from tjhei/fe_field_func_parallel

Fix FEFieldFunction behavior for nonlocal cells

Merge pull request #4083 from drwells/other-coverity-fixes

Other coverity fixes

Add new test