Add some links

Merge pull request #41 from tjhei/unset_slepc_dir

unset SLEPC_DIR

also unset SLEPC_DIR

Merge pull request #40 from tjhei/remove_unused_options

remove unused deal.II options

remove unused deal.II options

several options no longer exist in deal.II since 8.5, so remove them.

Merge pull request #39 from tjhei/unset_petsc_dir

unset PETSC_DIR

unset PETSC_DIR

If PETSC_DIR is already set in the environment, configuration of PETSC fails,
so just unset it before.

Merge pull request #38 from koecher/slepsc

slepsc: updated download location

slepsc: updated download location

Merge pull request #37 from tjhei/oce-update

update opencascade to 0.18.1 and use tarball

Merge pull request #36 from koecher/hdf5

hdf5: updated minor version to v1.10.1 from v1.10.0-patch1

update opencascade to 0.18.1 and use tarball

- use official repo
- use tarballs
- update to 0.18.1 (fixes osx special case, so remove)

hdf5: updated minor version to v1.10.1 from v1.10.0-patch1

Merge pull request #34 from gassmoeller/use_selected_fortran_compiler_p4est

p4est: set F77=$FF as (MPI) Fortran77 compiler

Merge pull request #33 from gassmoeller/fix_parmetis_for_non_mpicc

parmetis: Allow other compiler wrappers than mpicc as cc

Use $FF as Fortran77 compiler in p4est

Allow other compiler wrappers than mpicc

Merge pull request #32 from gassmoeller/cray_config

Add cray support

Add parmetis and cmake

Add cray support

Merge pull request #26 from koecher/macos

Extend macOS support

Merge pull request #29 from gassmoeller/follow_user_options

rearranges DEAL_CONFOPTS in dealii.package to allow the user to overwrite defaults

Merge pull request #28 from tjhei/parpack

Enable PARPACK support, if the optional ARPACK is enabled.

Merge pull request #30 from gassmoeller/fix_old_bash

Use tr instead of bash specific command

Follow user options

Use tr instead of bash specific command

enable PARPACK support

PARPACK support is disabled inside deal.II by default, but our version
is recent enough.

updates README.md for macOS support

package update: opencascade (git version v0.18; fix for macOS)

minor update to arpack-ng package (sets build dir)

package update: slepc v3.7.3 (works with macOS 10.12)

package update: petsc v3.7.6 (works with macOS 10.12)

updated platform installation notes for macOS 10.11, 10.12

removes general macosx platform file (use specific instead, like elcapitan or sierra)

updates copyright, indentation and some minor code cleanups

updates parmetis, superlu_dist and trilinos for macOS support

updates .gitignore for *.DS_Store macOS files

adds macOS 10.11 and 10.12 platform files

candi.sh: optimised macOS support (detects 10.12 and 10.11)

Merge pull request #24 from tjhei/macosx

preliminary mac osx support

mac osx support

Merge pull request #23 from koecher/hdf5-1.10

updates hdf5 to current v1.10.0-patch1

updates hdf5 to current v1.10.0-patch1

Merge pull request #22 from tjhei/arpack

add arpack-ng package

add arpack

(disabled by default)

Merge pull request #21 from tjhei/fix_numdiff

fix numdiff path

fix numdiff path

Merge pull request #18 from tjhei/release_8_5

switch to 8.5.0

Merge pull request #20 from tjhei/p4est_zlib

Fix p4est without zlib

Merge pull request #17 from tjhei/update_p4est

update p4est to 2.0

Merge pull request #19 from tjhei/add_numdiff

add numdiff package

p4est: enforce zlib and pass over arguments

If zlib is installed as part of candi (or manually by setting ZLIB_*),
pass this info to p4est. It turns out p4est won't work (at least in
debug mode) without having access to zlib. So enforce that too.

add numdiff package

numdiff is not installed by default and strictly speaking not a
dependency of deal.II, but it is very convenient to be able to do

    ./candi.sh --packages="numdiff"

and have it installed automatically.

switch to 8.5.0

update p4est to 2.0

Merge pull request #16 from tjhei/update_boost

update boost

update boost

Merge pull request #15 from koecher/update-readme

updates and enhances README.md

updates and enhances README.md

Merge pull request #13 from tjhei/update_ubuntu_instructions

update ubuntu instructions

Merge pull request #14 from tjhei/bg-color

change warning color from yellow to purple

change warning color from yellow to purple

(unreadable on a shell with white background)

update ubuntu instructions

Merge pull request #10 from koecher/superlu-dist-v5.1.2

Superlu dist v5.1.2

Merge pull request #9 from koecher/trilinos-v12.10.1

Set new repository (github.com) source for trilinos; updates to v12.10.1

Merge pull request #12 from tcclevenger/fix_apt-get_ubuntu16

Package names for ubuntu 16.04 have changed.

package names for ubuntu 16.04 have changed.

Merge pull request #11 from koecher/fedora-25

adds fedora 25 platform

adds fedora 25 platform

SuperLU_dist: v5.1.2 with simpler cmake and shared-lib interface; trilinos: superlu and explicit inst.

Set new repository (github.com) source for trilinos; updates to v12.10.1

Merge pull request #8 from koecher/deal.II-v8.4.2

Set deal.II v8.4.2 as default

Set deal.II v8.4.2 as default

Merge pull request #7 from dealii/fedora24

adds current fedora 24 to the supported platforms

adds current fedora 24 to the supported platforms

Merge pull request #4 from tjhei/petsc_update

update PETSc

Merge pull request #3 from tjhei/overwrite_package

allow overwriting packages list in cmdline

Merge pull request #1 from tjhei/cleanup

Cleanup, readme, simpler default paths

update PETSc

- update to 3.6.4
- use light package
- add mumps
- add parmetis/scalapack needed for mumps

allow overwriting packages list in cmdline

typo

change default paths

bump version, format package list

update readme

replace candi.cfg link, remove project-switch script

deal.II: v8.4.0 as default

Merge pull request #72 from Rombur/readme

Add documentation for generic linux cluster.

Add documentation for generic linux cluster.

Merge pull request #69 from tjhei/module_path

set sane module path

set sane module path

Merge pull request #71 from tjhei/config_path

changes to CONFIGURATION_PATH

Merge pull request #70 from tjhei/print_env_info

print environment script infos

changes to CONFIGURATION_PATH

- do not manually set the configuration path
- change the default to be under the installation path (only important
if you change the installation path)

print environment script infos

Merge pull request #65 from tjhei/trilinos_superlu

deal.II: fix trilinos 12 together with superlu dist

Merge pull request #61 from tjhei/j_space

candi: improve command line parsing and adds help message with the usual command line switch

Merge pull request #64 from tjhei/update_boost

update boost

Merge pull request #66 from tjhei/cleaning

Cleaning: removing dorsal's readme and usage files
In-source-build: added folders to gitignore

Merge pull request #63 from tjhei/update_petsc

update PETSC to 3.6.3

Merge pull request #62 from tjhei/enable_sh_check

enable.sh: check that object is a file