Fix documentation TrilinosWrappers::SparseMatrix

Don't use TrilinosWrappers::VectorBase anymore

Fix comments in the tests to reference TrilinosWrappers::MPI::Vector

Add changelog entry

Remove deprecated serial Trilinos vectors from examples

Remove deprecated serial Trilinos vectors from test suite

Remove deprecated serial Trilinos vectors

Merge pull request #4459 from kronbichler/fix_tria_signals

Also clear triangulation signals on destruction

Also clear triangulation signals on destruction

Merge pull request #4460 from masterleinad/fix_indent_template-arguments

Fix indentation in template-arguments.in

Merge pull request #4461 from kronbichler/master

Move changelog entry to major

Move changelog entry to major

Merge pull request #4456 from tamiko/fix_timer_test

Testsuite: fix base/timer

Testsuite: fix typo

Fix indentation in template-arguments.in

Merge pull request #4404 from kronbichler/transfinite_manifold

Transfinite interpolation manifold implementation

Avoid division by zero.

Add changelog

Transfinite interpolation manifold.

Added tests.
Adjusted division by zero in MappingQGeneric.
Disable using additional points on TransfiniteInterpolationManifold

Merge pull request #4449 from tamiko/fix_timer_03_test

Tests: Make base/timer_03 test more robust

Testsuite: fix base/timer

 - comparing concurrent timer runs on SMP machines with overclocking is
   useless

 - test the whole timer interface for consistency instead

Testsuite: Reindent base/timer_03 to make astyle happy

Merge pull request #4452 from bangerth/fix-typo

Fix a grammar error.

Fix a grammar error.

Merge pull request #4448 from bangerth/set-flags

Fix DataOutInterface::set_flags() for GnuplotFlags.

Tests: Make base/timer_03 test more robust

Closes #4439

Merge pull request #4446 from tamiko/fix_feature_config

CMake: Fix path to deal.IIFeatureConfig.cmake

Add a test.

Add a changelog entry.

Fix DataOutInterface::set_flags() for GnuplotFlags.

CMake: Fix path to deal.IIFeatureConfig.cmake

Merge pull request #4444 from davydden/gmg_clear

add mg::Matrix::reset() and MGCoarseGridApplySmoother::clear()

add mg::Matrix::reset() and MGCoarseGridApplySmoother::clear()

Merge pull request #4437 from davydden/feature_info

add deal.IIFeatureConfig.cmake which contains detailed info about con…

newlines

add deal.IIFeatureConfig.cmake which contains detailed info about configured features

Merge pull request #4438 from kronbichler/reduce_size_trilinos_test

Reduce size of Trilinos preconditioner test

Merge pull request #4435 from kronbichler/augment_documentation_fe_evaluation_2

Finalize FEEvaluation documentation update from #4431

Reduce size of Trilinos preconditioner test

Merge pull request #4436 from jppelteret/update_tests_4427

Reduce computation time of step-18 based tests

Finalize FEEvaluation documentation update from #4431

Reduce computation time of step-18 based tests

Merge pull request #4422 from drwells/add-trilinos-index-access

Move Trilinos index functions into a new header file.

Merge pull request #4433 from drwells/fix-task_09-2

Clean up task_09 a bit.

Move Trilinos index functions into a new header file.

Merge pull request #4428 from tamiko/remove_build_tests

Tests: Remove build_tests/ category

Documentation: fix

Merge pull request #4432 from kronbichler/shorten_mf_gmg_tests

Shorten matrix-free multigrid tests

CMake: Update description

Doc: Update documentation to latest "build tests" changes

add a changes entry

Tests: Force building examples in run_buildtest.cmake

Tests: Remove build_tests/ category

The build_tests/ category had been an ugly hack for compiling all
configurable example steps.

But nowadays we already compile all (configurable) example steps as part
of the main build process - so this is redundant. Further, selectively
running a subset of example steps (as was done) is ugly and useless
(output is never compared).

Thus, let's simply remove the category and custom cmake script files.

Clean up task_09 a bit.

This commit applies some small cleanups to this test (e.g., preferring C++11
functionality to POSIX) and, in addition, makes the following changes:
1. The OK message won't be set to deallog until after tasks is destroyed (i.e.,
   all threads must join).
2. If on a POSIX platform, unset the thread environment variable so that we
   really can run the 'right' number of threads.

Merge pull request #4431 from kronbichler/augment_documentation_fe_evaluation

Document FEEvaluation behavior for partially filled SIMD lanes

Document FEEvaluation behavior for partially filled SIMD lanes

Shorten matrix-free multigrid tests

Merge pull request #4430 from davydden/pum_test

make fe_enriched_step-36 do less refinements and thereby faster

make fe_enriched_step-36 do less refinements and thereby faster

Merge pull request #4429 from drwells/fix-task_09

Fix tests/base/task_09.cc.

Fix tests/base/task_09.cc.

The current implementation of the Task class will call join() on the created
thread in its destructor. Hence, the tasks in the loop run in sequence instead
of in parallel since they immediately go out of scope after each loop iteration,
which is not the point of the test.

Merge pull request #4424 from tamiko/fix_tag_feature

CMake: Bugfix: run get_latest_tag only if git is recent enough

Merge pull request #4423 from drwells/remove-petsc-vector-references

Remove remaining references to PETScWrappers::Vector.

CMake: Bugfix: run get_latest_tag only if git is recent enough

Fixes #4420

Remove remaining references to PETScWrappers::Vector.

Merge pull request #4369 from class4kayaker/timer_data

Add function to access timer data from within program

Add function to access timer data from within program

Merge pull request #4413 from bangerth/use-MPI_Abort

Use MPI_Abort instead of std::abort.

Merge pull request #4418 from bangerth/address-coverity-2

Check that a stream is good while we read.

Merge pull request #4417 from bangerth/address-coverity

Better document why we take a large argument by value.

Check that a stream is good while we read.

This addresses another (correct) Coverity warning.

Better document why we take a large argument by value.

This addresses an issue found by Coverity. We copy the argument intentionally.

Merge pull request #4416 from SoilRos/master

fixed direct reference of _feature to petsc in CHECK_MPI_INTERFACE

Merge pull request #4407 from davydden/cmake_tag

cmake: query for latest tag

fixed direct reference of _feature to petsc in CHECK_MPI_INTERFACE

install git scripts and use get_latest_tag.sh to get Git tag

Merge pull request #4414 from davydden/mf_base_constraints

factor out pre- and post-processing of dst/src inside MatrixFreeOpera…

add auxiliary git bash scripts

Merge pull request #4412 from bangerth/avoid-warning

Avoid warnings about unused variables.

Merge pull request #4410 from drwells/add-update-ghosts-tests

Add tests for update_ghost_values.

Use MPI_Abort instead of std::abort.

Avoid warnings about unused variables.

Add tests for update_ghost_values.

These functions need to exist (for PETSc and Trilinos vectors and block
vectors) but should not do anything.

factor out pre- and post-processing of dst/src inside MatrixFreeOperators::Base::mult_add() into two functions

Merge pull request #4409 from drwells/remove-read-input-docs

Remove references to the old read_input function.

Remove references to the old read_input function.

add DEAL_II_GIT_TAG to deal.IIConfig.cmake

add an optional argument to DEAL_II_QUERY_GIT_INFORMATION macro

Merge pull request #4403 from luca-heltai/regularize-mesh

Regularize corner cells.

Implemented regularize corner cells

cmake: query for latest tag

Merge pull request #4406 from drwells/add-update-ghost-values-stubs

Implement update_ghost_values stubs.

Implement update_ghost_values stubs.

Merge pull request #4405 from Rombur/cuda_setup_tests

Guard FIND_PACKAGE(CUDA) with DEAL_II_WITH_CUDA.

Merge pull request #4401 from davydden/solvercontrol

add ConsecutiveControl

Guard FIND_PACKAGE(CUDA) with DEAL_II_WITH_CUDA.

Merge pull request #4402 from Rombur/cuda_tests

Check for cuda only if configured with cuda support.

add ConsecutiveControl

Check for cuda only if configured with cuda support.

Merge pull request #4398 from davydden/remove_wrong_todo

remove wrong TODO in template-arguments.in