improve documentation of Functions::StokesLSingularity

Merge pull request #4659 from drwells/fix-mapping-q1

Fix mapping q1

Describe the changes in a test and changelog entry.

Merge pull request #4657 from masterleinad/alternative_pattern

Add alternative output for pattern_tools_06/07

Mark some quantities in transform_real_to_unit_cell as long double.

This improves accuracy but incurs a modest (about 20%) slowdown. Using the exact
formula here instead of the Newton scheme (that we use for MappingQGeneric)
results in a 40x speed up anyway, so this is relatively small.

Rearrange the MappingQ1 quadratic equation solver.

This gets around an issue where, for parallelograms, a should be zero: the
previous version did not handle this correctly.

Add alternative output for pattern_tools_06/07

Merge pull request #4655 from nfehn/master

Improvement of initialization of Chebyshev smoother.

entry in /doc/news/changes/minor/ added

Improvement of initialization of Chebyshev smoother.

Make initial guess robust with respect to number of processors by operating on the global index.

Merge pull request #4651 from gassmoeller/fix_zero_dim_output

Fix some minor bugs in #4628

Merge pull request #4653 from kronbichler/fix_unity_build_with_clang_3.5

Fix unity build with clang-3.5.

Fix unity build with clang-3.5.

Merge pull request #4652 from masterleinad/fix_compilation_without_p4est

Fix compilation without p4est

Merge pull request #4650 from masterleinad/fix_warning_geometryinfo

Fix warning about instantiation of GeometryInfo<0>

Fix compilation without p4est

Fix some minor bugs

Fix warning about instantiation of GeometryInfo<0>

Merge pull request #4442 from drwells/manual-unity

Manual unity

Merge pull request #4645 from bangerth/constraint-matrix-copy

Implement a ConstraintMatrix::copy_from() function.

Merge pull request #4648 from drwells/add-p4est-zlib-check

Fail to install p4est if it is not compiled with zlib.

Fail to install p4est if it is not compiled with zlib.

Merge pull request #4649 from simonsticko/disable_warning_immersed_surface_quad

Remove a compiler warning in ImmersedSurfaceQuadrature.

Remove a compiler warning in ImmersedSurfaceQuadrature.

Update the documentation on CMakeLists.txt files.

Add an option for a unity build.

Add another FE namespace fix.

Merge pull request #4632 from luca-heltai/pattern-tools

PatternsTools namespace.

Merge pull request #4305 from simonsticko/immersed_surface_quadrature

Add class ImmersedSurfaceQuadrature

Merge pull request #4646 from drwells/add-default-prm-note

Add a note on generating default parameter files.

Merge pull request #4647 from bangerth/doc-update

Minor doc updates to a couple of classes.

Add a note on generating default parameter files.

A since-removed equivalent to parse_input (see commit 8baf33d316b) took,
as an optional argument argument, a boolean that specified whether or
not parse_input should write a default parameter file if one is not
found. This commit summarizes that old documentation for users who want
the old behavior.

Moved changelog to major.

Specialise Bool pattern.

Fixed naming of is_stl_container and is_stl_map

change log

Added add_parameter function and tests.

Moved pattern_tools.h inside patterns.h

Moved Patterns namespace in its own file.

Support for std::pair

Renamed files to pattern_tools

Fixed support for arbitrary map types.

Renamed namespace, fixed cxx14 dep, fixed stylistic comments.

Added tests for several Convert<T> types.

Add Convert for string types.

Added convert for std::complex types.

Added tensor and point types.

Moved some functions to internal namespaces.

Removed patterns_tools.cc and refactored  add_parameter

Made all stl containers and map available.

Specialization of Convert for Map types.

Added getters to Patterns::Map

Patterns for arithmetic types and container types.

Added Convert struct, with its specialisation for integral types

Added getters for Patterns::List

Minor doc updates to a couple of classes.

Merge pull request #4644 from bangerth/doc-update

Better document the extract_subvector_to() functions.

Explicitly =delete ConstraintMatrix::operator=().

Currently, it was just made 'private' and not implemented.

Add a changelog entry.

Add a test.

Implement a ConstraintMatrix::copy_from() function.

Better document the extract_subvector_to() functions.

This commit deals with the variant of the function that takes iterators.

Better document the extract_subvector_to() functions.

This commit deals with the variant of the function that takes vectors.

Merge pull request #4628 from gassmoeller/allow_zero_dim_output

Allow zero dimensional output in DataOutBase

Add instantiations

Merge pull request #4640 from kronbichler/fix_mg_ghost_periodic

Fix ghost layer with multigrid hierarchy for distributed triangulation

Merge pull request #4636 from bangerth/dofhandler-update

More Dofhandler updates

Instantiate output for zero dim.

Address a couple of review comments.

Standardize on 'template <class DoFHandlerType>'.

Merge pull request #4641 from bangerth/make-var-const

Make a couple of variables 'const'.

Make a couple of variables 'const'.

Add changelog.

Add new test

Fix bug in MG ghost layer computation leading to dead locks.

Merge pull request #4637 from bangerth/fix-serialization

Fix serialization of DoFHandler.

Add class ImmersedSurfaceQuadrature

Add a class representing an quadrature rule over a surface cutting arbitrary
through the unit cell. In order to map a quadrature rule over a surface from
the unit cell to physical space it is not sufficient to know only points and
scalar weights, since information about the normal is also required. In
addition to points and weights this class also stores the normal vectors.

Merge pull request #4634 from bangerth/simplify-code

Simplify a small piece of code.

Merge pull request #4631 from bangerth/delete-copy-operators

Mark copy operators as explicitly deleted.

Merge pull request #4635 from bangerth/simplify-test

Remove an unnecessary cast.

Compress buffers before communicating.

This has already been done in distribute_dofs(). Also do it in renumber_dofs().

Substantially simplify the creation of the NumberCache.

This uses a recently introduced constructor of NumberCache.

Make two blocks of code the same.

One part of the renumber_dofs() algorithm in parallel is exactly the
same as in the distribute_dofs() algorithm, so use the same code in
both places.

Simplify the implementation of an algorithm slightly.

Also make it cheaper: We really only need to loop over ghost cells,
but not locally owned cells.

Rename a variable.

Simplify an algorithm.

We were trying hard to construct an IndexSet efficiently, but IndexSet
can now do that itself provided we give it a sorted set of indices.

More DoFHandler policy cleanups.

Specifically, make function names more uniform. Also some control
flow cleanups, and other minor improvements.

Instantiate the ParallelDistributed policy for hp::DoFHandler.

Fix serialization of DoFHandler.

Some gcc/boost combinations have trouble re-creating vectors of
std::unique_ptr objects because the latter has no copy constructor.
Work around this by doing things one element at a time.

Mark copy operators as explicitly deleted.

The operator=() of all accessor classes had previously been hidden
by making them private and not implementing them. C++11 now allows
us to bring them out of the dark and into the light by making
them public, but marking them as '=delete'.

Remove an unnecessary cast.

Simplify a small piece of code.

Merge pull request #4633 from tjhei/doc_loop_control

improve LoopControl documentation

improve LoopControl documentation

Merge pull request #4630 from masterleinad/replace_deprecated_table_indices_constructor

Replace calls to deprecated TableIndices constructor

Replace calls to deprecated TableIndices constructor

Merge pull request #4629 from masterleinad/fix_construct_chebyshev

Use appropriate constructor for QGaussChebyshev*

Use appropriate constructor for QGaussChebyshev*

Merge pull request #4624 from bangerth/dofhandler-update

DoFHandler policy update

Simplify an assertion.

More small cleanups.

Most documentation changes, renaming of variables, and general housekeeping.