step-34: fixes a runtime error in step-34
In the function output_results, around line 1017, two vectors (phi and alpha)
are added to a DataOut object.
A runtime error occured, because the type of the vector could not
determined automatically.

On branch dataout-issue-step-34
  Changes to be committed:
        modified:   examples/step-34/step-34.cc

Merge pull request #475 from tamiko/fix_bundled_boost

Fix linkage for bundled boost

add a changelog entry

CMake: Bugfix: Add -lrt to the link interface in case of bundled boost

CMake: Fix FIND_SYSTEM_LIBRARY macro

Merge pull request #473 from bangerth/remove-deprecated-functions-5

More removal of deprecated functions and classes

Remove deprecated classes PreconditionedMatrix and PreconditionLACSolver.

Remove deprecated class FEEvaluationDGP.

Remove deprecated classes FEEvaluationGeneral and FEEvaluationGL.

Remove deprecated functions Multigrid::vmult*

Remove deprecated class MGMatrix.

Remove deprecated function MGTools::extract_inner_interface_dofs.

Remove deprecated function MGTools::apply_boundary_values.

Remove deprecated version of MGTools::count_dofs_per_component.

Merge pull request #471 from bangerth/fix-test

Fix a test.

Fix a test.

Merge pull request #469 from bangerth/remove-deprecated-functions-4

Remove deprecated functions 4

Remove deprecated function BlockVector::scale().

Remove deprecated function parallel::distributed::BlockVector::scale().

Remove deprecated function PreconditionBlock::size().

Remove deprecated function GridTools::extract_boundary_mesh().

Remove deprecated function GridTools::create_union_triangulation().

Remove deprecated version of parallel::distributed::Vector::scale().

Remove deprecated version of parallel::distributed::Vector::compress_finish().

Remove deprecated constructor of SolverSelector.

Remove deprecated function SparsityPattern::partition.

Remove deprecated functions BlockMatrixArray and BlockTrianglePreconditioner.

Remove deprecated variants of DoFTools::make_periodicity_constraints().

Remove deprecated constructors of SparsityPattern iterators.

Remove deprecated typedef CompressedBlockSparsityPattern.

Remove deprecated functions Mapping::transform_*

Remove some of the deprecated functions in SparsityPattern.

Merge pull request #467 from tjhei/fix_mpi_step39_test

fix tests/mpi/step-39

fix tests/mpi/step-39

And yes, making a copy of the matrix was indeed a mistake here.

Merge pull request #466 from tamiko/git_info_for_user_projects

This is just a minor refactorization to allow to use the cmake stuff for

Update documentation

CMake: Also export git branch and revision in deal.IIConfig.cmake and Make.global_options

CMake: Fix a typo - use .../cmake/macros (lowercase)

CMake: allow to call DEAL_II_QUERY_GIT_INFORMATION from user projects

This commit enables to use the DEAL_II_QUERY_GIT_INFORMATION macro from
within user projects. In this case the variable prefix "DEAL_II_" is
ommited

CMake: Refactor setup_git.cmake into its own macro

Merge pull request #465 from kronbichler/master

Fill jacobians in FEFaceValues.

Fill jacobians in FEFaceValues.

The previous code did not fill the Jacobian transformations on
FEFaceValues and FESubfaceValues. This is now fixed for the various
mappings.

Remove deprecated functions in ChunkSparsityPattern.

Merge pull request #454 from dakshinai/filtered_matrix

closes #454

filtered_matrix test cases

Merge pull request #460 from bangerth/provide-more-shape-function-pictures

Provide more shape function pictures

Add links to pictures of shape functions provided by Manuel Quezada de Luna.

Merge pull request #458 from tamiko/fix_revision_h

CMake: Export a string literal in revision.h

Merge pull request #456 from tamiko/fix_includes

Fix include statements in testsuite

Merge pull request #459 from tamiko/fix_a_warning

Testsuite: Fix a warning when configuring with cmake-3.1

Testsuite: Fix a warning when configuring with cmake-3.1

CMake: Export a string literal in revision.h

add a forgotten changelog entry

Testsuite: Fix includes

One of the previous changes removed [...]/deal.II from the list of include
directories. Consequently, it is now mandatory to prefix all deal.II
includes with deal.II/

Merge pull request #455 from tjhei/prm_kept_open_bug

fix ParameterHandler::leave_subsection and parsing

fix ParameterHandler::leave_subsection and parsing

- leave_subsection() had a bool return value for success that doesn't
make sense because an Assert() would never allow false to be returned.
Remove this.
- read_input() would not complain about unbalanced 'subsection'/'end' in
the input. Instead, the ParameterHandler would just stay in that
subsection and so weird error messages about undefined entries would
show up later.
- One could argue that read_input() should always start and end with an
empty subsection path, but we didn't enforce this in the past and it
might be useful to read separate files not into the "top level".

Add links to pictures of shape functions provided by Manuel Quezada de Luna.

Add links to pictures of shape functions provided by Manuel Quezada de Luna.

Provide a reference to where to find the shape functions.

Remove a comment that I'm not sure is true any more.

It will turn out to be very difficult to keep in synch because it's not at the
place where the feature is actually implemented. Users will get to see an
error message in case they try to use this feature anyway.

Merge pull request #451 from bangerth/fix-colorization

Also colorize the edges, not just the faces, of a hypershell.

Merge pull request #450 from bangerth/improve-error

Improve an error message and provide guidance.

Merge pull request #453 from bangerth/fixup-image-refs

Fix up references to images.

Fix up references to images.

These references were broken just before the 8.2 release by a rogue script.

Merge pull request #433 from tamiko/remove_compat_feature

Remove compat feature

Provide a changes.h entry

Remove quirk

CMake: Export Makefile compatible definitions

This commit reintroduces Make.global_options that closely mirrors the
information and layout of the CMake project configuration
deal.IIConfig.cmake.

it is intended for sourcing in Makefiles.

CMake: Restructure library name creation and remove obsolete include

Remove component COMPAT_FILES

Merge pull request #446 from luca-heltai/transition-to-manifold-examples

Transition to manifold - Part 1 - Examples 1 to 16

Addressed last two comments on step-1.

Merge pull request #449 from davydden/opencascade

fix FindOPENCASCADE for OCC

Also colorize the edges, not just the faces, of a hypershell.

Improve an error message and provide guidance.

In response to a recent question on the mailing list.

fix FindOPENCASCADE for OCC

added mac[64,32]/clang/lib and lin[64,32]/gcc/lib to path_suffixes.

Fixed wolfgang comments.

Merge pull request #447 from bangerth/improve-readme.md

Improve wording slightly.

The existing instructions didn't make clear where the sources were located and
implicitly assumed that they are in the directory above the build
directory. This can be confusing.

(By suggestion of Joel Kulesza.)

Improve wording slightly.

The existing instructions didn't make clear where the sources were located and
implicitly assumed that they are in the directory above the build
directory. This can be confusing.

(By suggestion of Joel Kulesza.)

Updated changelog.

Boundary->Manifold in step-16.

Boundary->Manifold in step-15.

Boundary->Manifold in step-11.

Boundary->Manifold in step-10.

Removed unnecessary header. Step-9.

Removed unnecessary header. Step-8.

Removed unnecessary header.

Boundary->Manifold in step-6.

Boundary->Manifold in step-5.

Boundary->Manifold in step-2.

Fixed step-1 with manifold.

Merge pull request #445 from tjhei/manifold_bughunt

add flat manifold test

add test

This test checks that mapping quadrature points, and the computation of
shape_value, shape_gradient of FE_Q, and JxW works when applying a
MappingQ(4) inside or only on the boundary for a flat manifold.

Merge pull request #444 from bangerth/update-changelog

Update changelog, as requested by Matthias.

Update changelog, as requested by Matthias.

Merge pull request #442 from bangerth/bring-back-mpi-init

Bring back the constructor of MPI_InitFinalize.

Merge pull request #437 from bangerth/update-copyright-years

Some perl and shell magic.

Merge pull request #443 from tjhei/comment_wrapping

Comment wrapping

Ignore copyright update commits when determining the last update to a file.

Update copyright years of 3488 files.