Remove checks for various isnan functions.

This PR removes

DEAL_II_HAVE_ISNAN
DEAL_II_HAVE_STD_ISNAN
DEAL_II_HAVE_UNDERSCORE_ISNAN

in favor of using std::isnan, which is a C++11 function, instead.

Merge pull request #4758 from tamiko/remove_a_test_2

Bugfix: Actually delete the right test...

Bugfix: Actually delete the right test...

Merge pull request #4757 from tamiko/remove_a_test

opencascade/(arclength_boundary_01|plane_intersection_01): remove tests

opencascade/(arclength_boundary_01|plane_intersection_01): remove tests

Remove two failing tests that hit a bug in opencascade libraries
(versions 6.7.0 - 7.1.0) related to closed, periodic curves. We test the
same functionality already in other opencascade tests, so nothing is
lost.

Merge pull request #4755 from tamiko/fix_a_test_5

mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: Add an output variant

mpi/locally_owned_dofs_per_subdomain_02: Add an output variant

Another test that gives different results due to metis.

Merge pull request #4749 from bangerth/simplify-meshworker

Reduce MeshWorker complexity by removing an undocumented preprocessor #define.

Merge pull request #4752 from tamiko/add_missing_instantiations

ShapeInfo<...>::reinit: add missing instantiations

restructure

add a changelog entry

add missing instantiations

Merge pull request #4751 from tamiko/fix_a_test_4

add an output variant

add an output variant

The number CG iterations changed slightly. At some point we will have to
rewrite this test...

Merge pull request #4750 from tamiko/fix_a_test_3

trilinos/solver_control_06: Add output variants

trilinos/solver_control_06: Add output variants

Newer trilinios print the warning string (that we sometimes get and that
is already present in the original .output files) without a leading ~/.

Thus add another output variant.

Merge pull request #4746 from bangerth/fix-markup

Fix markup in step-56 intro headings.

Merge pull request #4748 from tamiko/fix_a_test_2

sharedtria/communicate_active_fe_indices_(01|02): add output variants

Reduce MeshWorker complexity by removing an undocumented preprocessor #define.

add a test variant

Merge pull request #4747 from tamiko/fix_a_test_1

petsc/solver_03_precondition_parasails: Update forgotten test output

add a test variant

petsc/solver_03_precondition_parasails: Update forgotten test output

Fix markup in heading.

Our scripts, as well as doxygen, need a bit of help here.

Merge pull request #4743 from masterleinad/fix_coverage

Fix creation of coverage information

Fix creating coverage information

Merge pull request #4744 from bangerth/fix-1

Restore true cell owners before setting up DoF data structures.

Restore true cell owners before setting up DoF data structures.

This is necessary when using a parallel::shared::Triangulation because
there, we want to enumerate DoFs on *all* cells, not just some, and so
we need to know who owns them etc and what the active_fe_index is.

Merge pull request #4664 from masterleinad/mapping_generic_tensor

Use tensorized evaluation in MappingQGeneric

Merge pull request #4724 from masterleinad/usecheck_solver_petsc

Use check_solver_within_range in PETSc(serial) tests

Merge pull request #4733 from bangerth/remove-unused-function

Remove a function that is now no longer used.

Merge pull request #4738 from drwells/remove-boost-bind-compiler-bug

Remove DEAL_II_BOOST_BIND_COMPILER_BUG.

Merge pull request #4732 from drwells/remove-member-var-specialization-check

Remove DEAL_II_MEMBER_VAR_SPECIALIZATION_BUG.

Remove DEAL_II_BOOST_BIND_COMPILER_BUG.

Reverts 0d2f17a9840 and d92bec4da6d.

Merge pull request #4731 from drwells/remove-gcc-4.4-check

Remove a check for GCC 4.4.

Merge pull request #4739 from tamiko/constraint_matrix_iterator

Implement ConstraintMatrix::get_lines()

Merge pull request #4741 from drwells/remove-type-qualifier-bug

Remove DEAL_II_TYPE_QUALIFIER_BUG.

add a news entry

add a test

Add ConstraintMatrix::get_lines() that returns a range of line iterators

Rename ConstraintLine::line to ConstraintLine::index

Make ConstraintMatrix::ConstraintLine a public member class

Merge pull request #4736 from drwells/remove-more-memory-consumption

Remove more memory consumption tests.

Changelog entry

Fix up tests

Use tensorized evaluation in MappingQGeneric if supported

Remove DEAL_II_TYPE_QUALIFIER_BUG.

This was a work around for a GCC 4.3 bug which has since been fixed.

Reverts 092bb3fc40b.

Remove DEAL_II_MEMBER_VAR_SPECIALIZATION_BUG.

This workaround is no longer necessary in any compiler that we support.

Reverts 1699cced170.

Merge pull request #4734 from drwells/remove-explicit-constructor-bug

Remove DEAL_II_EXPLICIT_CONSTRUCTOR_BUG.

Remove more memory consumption tests.

Merge pull request #4728 from tjhei/mg_lvl_apply

add MGLevelObject::apply()

Remove DEAL_II_EXPLICIT_CONSTRUCTOR_BUG.

This workaround is no longer necessary in any compiler that we support.

Reverts 8cba8cc3f1.

Remove a function that is now no longer used.

We use boost serialization, rather than setting up a fixed-sized buffer
into which we memcpy things.

Remove a check for GCC 4.4.

We no longer support this compiler.

Merge pull request #4727 from bangerth/delete-memory-consumption-tests

Remove the memory_consumption tests.

Use check_solver_within_range in PETSc(serial) tests

add MGLevelObject::apply()

Merge pull request #4609 from tamiko/deprecate_filter_matrix

Deprecate FilteredMatrix

Remove the memory_consumption tests.

These have, over the years, caused us significant pain in maintenance
(as evidenced by the fact that one of them has 8 output variants). On the
other hand, none of us can recall a case where they would have helped track
down a bug.

Thus, delete them.

Merge pull request #4725 from bangerth/doc-update

Update documentation about setting active FE indices.

Deprecate FilteredMatrix

Update documentation about setting active FE indices.

Merge pull request #4717 from tamiko/add_output_variants

sharedtria/(tria_load|copy_tria): add output variants

Merge pull request #4721 from masterleinad/usecheck_solver_trilinos

Use check_solver_within_range in Trilinos tests

Merge pull request #4707 from luca-heltai/array-views-in-fevalues-internals

Replaced dealii::Vector with ArrayView in internal FEValues calls.

Merge pull request #4712 from bangerth/exchange-active_fe_index

Exchange active_fe_index between processors.

Use check_solver_within_range in Trilinos tests

Merge pull request #4716 from tamiko/use_solver_within_range

petsc/solver_03_pre...: Use check solver_within_range macro

Merge pull request #4718 from drwells/remove-boost-bind

Remove a usage of boost::bind.

Merge pull request #4719 from drwells/fix-touch-count-upper-bound

Check the numeric type to get an upper bound.

Merge pull request #4713 from tjhei/pattern_tools_alt_output

add alternative test output for tests/pattern_tools_

fix tests/pattern_tools_

- add alternative output for pattern_tools_06 (different order for
unordered map)
- remove printing of typeid for pattern_tools_01
fixes #4691

Add another test.

Add a test.

Remove a usage of boost::bind.

Check the numeric type to get an upper bound.

According to @bangerth this is a holdover from long ago when 255 was
automatically replaced with numbers::internal_face_boundary_id
everywhere in the library.

sharedtria/tria_load_01: Add an output variant

sharedtria/copy_tria_01: Add an output variant

Exchange active_fe_index between processors.

Every processor should only set active_fe_index on their locally owned
cells, and then get those on ghost cells through parallel exchange.

Merge pull request #4714 from tamiko/fix_test_grid_mesh3d_12

grid/mesh_3d_12: Increase precision and update output

petsc/solver_03_precondition_boomeramg_symmetric: make test more robust

petsc/solver_03_precondition_boomeramg: make test more robust

Use solver_within_range macro instead of custom check_solve function.

grid/mesh_3d_12: Increase precision and update output

Merge pull request #4710 from tjhei/disable_test_lac_util_without_petsc

run tests/lac/utilities_01 only when we have PETSc+MPI

run tests/lac/utilities_01 only when we have PETSc+MPI

Merge pull request #4711 from gassmoeller/fix_unused_warning

Remove unused parameter warning

Remove unused parameter warning

Use make_array_view

Break long lines and make references instead of copies.

Replaced dealii::Vector with ArrayView in internal FEValues calls.

Merge pull request #4688 from bangerth/fix_mu_parser-2

Fix a problem with old TBBs.

Merge pull request #4702 from bangerth/iterator-work

Remove a largely unused iterator typedef.

Merge pull request #4703 from bangerth/dofhandler-cleanup

More DoFHandler policy cleanups.

Use plural for an array.

We already do so for all of the other arrays in this class.

Simplify an assertion.

We already check that a cell is not a ghost cell and we've only marked
locally owned cells. So test that.

Remove a largely unused iterator typedef.

Move further towards the goal of trying to dispatch as small a number
of iterators to make the life of IDEs easier.

Merge pull request #4679 from davydden/eigenvalue_estimate

minor fix to DiagonalMatrix and add Utilities::Lac:: Lanczos_largest_eigenvalue

add Utilities::LinearAlgebra::Lanczos_largest_eigenvalue()
and Utilities::LinearAlgebra::Chebyshev_filter()

Merge pull request #4699 from masterleinad/fix_clang_compile

Fix compilation of symmetric_tensor.inst for clang-4.0.0

Merge pull request #4693 from bangerth/iterator-work

Move an iterator declaration that is now completely generic.