Add Transfinite Line

Merge pull request #5827 from bangerth/sort-code-gallery

Sort entries to the code gallery by their name, not their directory name.

Merge pull request #5837 from QiaoLei-88/fix_icc15_compile

make icc 15 compiles on CentOS 7

Merge pull request #5836 from bangerth/fix-wording

Use less obscure wording.

Use less obscure wording.

Merge pull request #5838 from kronbichler/mf_dg_step1

Add macro for __restrict keyword.

Add macro for __restrict keyword.

Merge pull request #5831 from masterleinad/fix_periodicity_01

Fix mpi/periodicity_01

Merge pull request #5835 from Rombur/trilinos_documentation

Remove reference to a function that does not exist

satisfy icc 15 about template arguments of std::map's

Remove reference to a function that does not exist

Merge pull request #5833 from masterleinad/fix_enriched_ice

Fix ICC-16 ICE in fe_enriched.h

Workaround ICC compiler bug

Merge pull request #5832 from masterleinad/fix_typo_finitelement

Fix typo FinitElement

Fix typo FinitElement

Merge pull request #5826 from Rombur/cusparse_assert

Cusparse assert

Merge pull request #5714 from masterleinad/replace_hypersphere

 Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Add changelog entry

Add AssertCusparse macro to check that a cuSPARSE routine was successful

Improve documentation

Clean up

Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Fix else branch in SphericalManifold::normals_at_vertices

Fix mpi/periodicity_01

Merge pull request #5830 from kronbichler/fix_mg_transfer_mf

Fix matrix-free transfer for multi-components FE and p>10

Add changelog.

Add test.

Fix transfer for high polynomial degrees.

Merge pull request #5819 from drwells/project-to-object-tol

Improve tolerances for errors near zero.

Merge pull request #5711 from masterleinad/simplify_normal_spherical

Simplify implementation for normal_vector and get_normals_at_vertices in SphericalManifold

Sort entries to the code gallery by their name, not their directory name.

Merge pull request #5825 from Rombur/fix_cuda

Fix a bug in a CUDA vector constructor

Simplify implementation for normal_vector and get_normals_at_vertices in SphericalManifold

Merge pull request #5823 from BenBrands/move_some_to_some

move implementation of Utilities::MPI::some_to_some()

Fix a bug in a CUDA vector constructor

The constructor did not set the values in the vector to zero

Merge pull request #5824 from masterleinad/rm_sd_ids_p_08

Remove subdomain_ids_parallel_08

Merge pull request #5779 from masterleinad/fix_periodic_dofs

Fix periodicity constraints for multiply constrained DoFs

Merge pull request #5811 from bangerth/unpack-for-arrays

Add a variant of Utilities::unpack() for arrays.

Remove subdomain_ids_parallel_08

move implemetation of MPI::some_to_some

Merge pull request #5822 from bangerth/copyright

Update copyright years.

Merge pull request #5820 from BenBrands/move_all_gather

Move implementation of MPI::all_gather()

Update copyright years.

Merge pull request #5817 from drwells/cppcheck-4

Fix some things cppcheck found.

Merge pull request #5821 from masterleinad/fix_utilities_pack_unpack_03

Fix utilities_pack_unpack_03

Merge pull request #5809 from bangerth/pointers

Specialize ArrayViewHelper::is_contiguous() for pointers.

Fix utilities_pack_unpack_03

Use nullptr for the null pointer.

Use constant references instead of copies.

This was found by cppcheck.

Reduce the scope of some variables.

This was found by cppcheck.

Fix initialization of protected/private solver members.

This was found by cppcheck.

Move implementation of MPI::all_gather()

Improve tolerances for errors near zero.

Details in the floating point implementation (e.g., whether or not -ffast-math
is used) can change the error by an order of magnitude or more. Get around this
by, in each relevant case, bounding the error above.

Since the errors are now checked in a different way the alternative output file
has been removed.

Merge pull request #5816 from jppelteret/fix_5763

Ensure parallel::Tria can't be used with DoFRenumbering::subdomain_wise

Merge pull request #5784 from BenBrands/utilities_mpi_gather

Add Utilities::MPI::gather

Initialize some variables.

This was found by cppcheck.

Use default copy constructors.

This was found by cppcheck.

Add test.

Merge pull request #5814 from drwells/fix-doc-typos-8

Fix some typos in the documentation.

Ensure parallel::Tria can't be used with DoFRenumbering::subdomain_wise

The documentation is also updated to reflect this point. Fixes 5763.

Fix some typos in the documentation.

Merge pull request #5815 from drwells/remove-c++03-references

Remove some references to older C++ versions.

Remove some references to older C++ versions.

We now require C++11 so these statements are not correct.

Merge pull request #5813 from masterleinad/alternative_output_cafi01b

Add alternative output for communicate_active_fe_indices_01b

Specialize ArrayViewHelper::is_contiguous() for pointers.

Merge pull request #5812 from masterleinad/unused_metis

More unused parameters without METIS

Add alternative output for communicate_active_fe_indices_01b

More unused parameters without METIS

Merge pull request #5810 from bangerth/add-test-pack

Add a test for the fast-path pack()/unpack() functions.

Add a test.

Add a variant of Utilities::unpack() for arrays.

Merge pull request #5804 from bangerth/hyper-sphere

Restrict the template arguments of GridGenerator::hyper_sphere.

Add a test for the fast-path pack()/unpack() functions.

Merge pull request #5808 from bangerth/fix-warnings

Disable warnings in zoltan_cpp.h.

Disable warnings in zoltan_cpp.h.

Without this, we get warnings of the kind
/home/bangerth/bin/trilinos-12.8.1-mpi/include/zoltan_cpp.h:181:24: warning: unused parameter ‘iperm’ [-Wunused-parameter]
                  int * iperm )
                        ^~~~~

We already do a similar thing in sparsity_tools.cc, the only other places
where we include zoltan_cpp.h.

Merge pull request #5806 from jppelteret/comment_5788

Amend comment related to making a local copy of Trilinos MPI vector.

Amend comment related to making a local copy of Trilinos MPI vector.

Merge pull request #5807 from masterleinad/lapack_unused_parameters

Unused parameters without LAPACK

Unused parameters without LAPACK

Merge pull request #5801 from masterleinad/tensor_iterators

Tensor iterators

Merge pull request #5803 from masterleinad/scalapack_assert

Fix structure of Assert in scalapack.cc

Simplify Utilities::MPI::sum for *Tensor

Introduce begin/end_raw and switch element access to const&

Reorder array_view.h and make_array_view for Tensor classes

add gather to Utilities::MPI
index_set: replace MPI_Gather by Utilities::MPI::gather

Add changelog.

Merge pull request #5790 from masterleinad/check_contiguity

Check contiguity of iterators in make_array_view

Restrict the template arguments of GridGenerator::hyper_sphere.

This function can only work for dim==spacedim-1, and this is also documented.
Consequently, get rid of the dim template argument.

Merge pull request #5802 from masterleinad/fix_more_unused

Fix more unused variables

Fix structure of Assert in scalapack.cc

Fix more unused variables

Check contiguity of iterators

Merge pull request #5794 from jppelteret/fix_5788

Allow copy of Trilinos::MPI::Vector to dealii::Vector on subset of procs

Merge pull request #5536 from ikligge/add_SQMR

Add sqmr

Allow copy of Trilinos::MPI::Vector to dealii::Vector on subset of procs

This commit adds a flag that reduces the strictness of the scenario in
which the constructor to dealii::Vector that takes a
Trilinos::MPI::Vector can be called. Previously it was necessary that
this be called on all MPI processors (MPI_COMM_WORLD). By setting the
additional flag to be true, this function need only be called by the
processes (maybe a subset of MPI_COMM_WORLD) that own this vector.

Merge pull request #5799 from masterleinad/fix_unused_variables_5

Fix unused variables in linear algebra source files

Merge pull request #5798 from masterleinad/fix_unused_variables_4

Fix unused variables in Manifold source files

Merge pull request #5796 from bangerth/fix-warnings

Fix a variety of warnings.

Merge pull request #5800 from bangerth/optimize-pack-unpack

Optimize the pack/unpack() functions for simple data types.

Optimize the pack/unpack() functions for simple data types.